一.Hive简介 Hive是基于Hadoop的一个数据仓库工具,可以将结构化的数据文件映射为一张数据库表,并提供完整的sql查询功能,可以将sql语句转换为MapReduce任务进行运行.其优点是学习成本低,可以通过类SQL语句快速实现简单的MapReduce统计,不必开发专门的MapReduce应用,十分适合数据仓库的统计分析. Hvie是建立在Hadoop上的数据仓库基础架构.它提供了一系列的工具,可以用来进行数据提取转化加载(ETL),这是一种可以存储.查询和分析存储在Hadoop中的大规…

Nr,GenBank, RefSeq, UniProt 数据库的异同 有的文章在做DEG分析时,会把reads比对到RefSeq的转录组上.我也没搞清楚这和直接比对到常规转录组上有什么区别. 文章:Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Dynamic Changes in lncRNA Expression during Reprogramming 方法:For differential expression analysis, we aligne…

本文介绍一下Hive中的数据库(Database/Schema)和表(Table)的基础知识,由于篇幅原因,这里只是一些常用的.基础的. Hive的数据库和表 先看一张草图: Hive结构 从图上可以看出,Hive作为一个“数据库”,在结构上积极向传统数据库看齐,也分数据库(Schema),每个数据库下面有各自的表组成. 1.  Hive在HDFS上的默认存储路径 Hive的数据都是存储在HDFS上的,默认有一个根目录,在hive-site.xml中,由参数hive.metastore.ware…

DROP DATABASE是删除所有的表并删除数据库的语句.它的语法如下: DROP DATABASE StatementDROP (DATABASE|SCHEMA) [IF EXISTS] database_name [RESTRICT|CASCADE]; 下面的查询用于删除数据库.假设要删除的数据库名称为userdb. hive> DROP DATABASE IF EXISTS userdb; 以下是使用CASCADE查询删除数据库.这意味着要全部删除相应的表在删除数据库之前. hive>…

方案一:请参考<数据库“行专列”操作---使用row_number()over(partition by 分组字段 [order by 排序字段])>,该方案是sqlserver,oracle,mysql,hive均适用的. 在hive中的方案分为以下两种方案: 创建测试表,并插入测试数据: --hive 测试 行转列 collect_set collect_list create table tommyduan_test( gridid string, height int, cell st…

此文是基于上一篇文章:Hive环境搭建及测试 因为Hive默认的数据库是derby,不支持同时开启两个./hive的命令终端: 而将Hive的默认数据库修改成mysql后,可以解决该问题. 仅在安装Hive的CloudDeskTop上配置 一.root用户下:上传mysql安装包(mysql-5.5.32.tar.gz)到/install目录下,并解压安装; 二.hadoop用户下:上传mysql驱动包(mysql-connector-java-3.0.17-ga-bin.jar )到/soft…

定位: HIVE:长时间的批处理查询分析 impala:实时交互式SQL查询 impala优缺点优点: 1. 生成执行计划树,不用多次启动job造成多余开销,并且减少中间结果数据写入磁盘,执行速度快 2. 不占用yarn的资源 3. 缺点: 1. 不支持Date类型 2. 与HIVE数据不同步,需要手工刷新 3. 排序异常 4. 不支持多个count(distinct) 5. 不支持用户定义函数UDF 6. 不支持查询期的容错7. sum后精度只保留两位小数,需强转为double Impala与…

安装hive,初始化数据库的时候报错 schematool -dbType mysql -initSchema Metastore Connection Driver : com.mysql.cj.jdbc.Driver Metastore connection User: hive org.apache.hadoop.hive.metastore.HiveMetaException: Failed to get schema version. Underlying cause: java.sq…

<configuration> <property> <name>javax.jdo.option.ConnectionURL</name> <value>jdbc:mysql://master:3306/hive?createDatabaseIfNotExist=true</value> </property> <property> <name>javax.jdo.option.Connectio…

官网文档:https://cwiki.apache.org/confluence/display/Hive/LanguageManual+DDL 一.create table 1.官方字段 # # CREATE [TEMPORARY] [EXTERNAL] TABLE [IF NOT EXISTS] [db_name.]table_name -- (Note: TEMPORARY available in Hive 0.14.0 and later) [(col_name data_type […