R语言高性能编程,优化(一)】的更多相关文章

这段时间学习了<R高性能编程>这本书,基于这段时间做的项目实践,总结了一些自己的体会,和大家分享 一.为什么R程序有时候会很慢?1.计算性能的三个限制条件 cpu ram io R代码本身2.R是运行时解释的 在运行时解释并执行R代码3.R是单线程的 CPU的强大核心并没卵用,R只会只用一个4.R需要将全部数据加载到内存 处理的最大数据了取决于内存的限制 这里 linux相比于windows有一个优势,当我们试图装载一个可用内存大小的数据集数据可能会成功装载,不过一旦可用内存耗尽,操作系统会将…
一.使用并行计算加倍提升性能1.数据并行 VS 任务并行实现数据并行的算法scoket 并行性注意并行计算时间并不与执行任务的计算资源数目成正比(计算机核心),amdahl定律:并行代码的速度受限于串行执行的部分,包括并行性带来的开销在非windows系统中,parallel支持分叉集群(交叉法),新的work进程会从父R进程分叉出来,并拷贝数据.好处是不需要显示的创建和销毁集群实现任务并行的算法 2.计算机集群并行执行多个任务只有基于socket的集群可以做到这一点,因为进程不可能被分叉到另外…
接着上一篇 一.减少内存使用的简单方法1.重用对象而不多占用内存 y <- x 是指新变量y指向包含X的那个内存块,只有当y被修改时才会复制到新的内存块,一般来说只要向量没有被其他对象引用,就可以正常修改,以避免复制向量带来的CPU和RAM开销.按照程序属于来说,R是按值传递,应该避免使用sort 类似的函数,会返回一个副本,资源开销至少和原对象一样大,甚至更大2.删除不在需要的中间数据注意 在调用rm()的时候,内存不会被立即释放并交还到操作系统,而是在必要的时候,或者当已删除对象的内存量超过…
一.基于S3的面向对象编程 基于S3的面向对象编程是一种基于泛型函数(generic function)的实现方式. 1.S3函数的创建 S3对象组成:generic(generic FUN)+method(generic.class FUN) 泛型函数(generic)创建示例: get_n_elements <- function(x,...) { UseMethod("get_n_elements") } 通常用UseMethod()函数定义一个泛型函数的名称,通过传入参数…
摘要:R语言的知识体系并非语法这么简单,如果都不了R的全貌,何谈学好R语言呢.本文将展示介绍R语言的知识体系结构,并告诉读者如何才能高效地学习R语言. 最近遇到很多的程序员都想转行到数据分析,于是就开始学习R语言.总以为有了其他语言的编程背景,学习R语言就是一件很简单的事情,一味地追求速度,但不求甚解,有些同学说2周就能掌握R语言,但掌握的仅仅是R语言的语法,其实这只能算是入门. R语言的知识体系并非语法这么简单,如果都不了R的全貌,何谈学好R语言呢.本文将展示介绍R语言的知识体系结构,并告诉读…
R语言中文社区历史文章整理(类型篇)   R包: R语言交互式绘制杭州市地图:leafletCN包简介 clickpaste包介绍 igraph包快速上手 jiebaR,从入门到喜欢 Catterplots包,让你绘制不一样的图 今天再来谈谈REmap包 ggplot2你需要知道的都在这... R访问数据库管理系统(通过RODBC包和RMySQL包两种方式) NLP——自然语言处理(三)text2vec包 Rattle:数据挖掘的界面化操作 借助caret包实现特征选择的工作 R语言的高质量图形…
R语言服务器程序 Rserve详解 http://blog.fens.me/r-rserve-server/ Rserve的R语言客户端RSclient https://blog.csdn.net/u011955252/article/details/65442783 http://blog.fens.me/series-r/ R的极客理想系列文章 R的极客理想系列文章,涵盖了R的思想,使用,工具,创新等的一系列要点,以我个人的学习和体验去诠释R的强大. R语言作为统计学一门语言,一直在小众领域…
R 语言基本数据结构 首先让我们先进入 R 环境下: sudo R 赋值 R 中可以用 = 或者 <- 来进行赋值 ,<- 的快捷键是 alt + - . > a <- c(2,5,8) > a [1] 2 5 8 筛选 我们可以用下标来筛选,例如: > a[1:2] [1] 2 5 注意 R 语言的下标是从 1 开始的. 当然我们也可以用逻辑进行筛选,例如: > a[a>4] [1] 5 8 为了了解这个式子的原理,我们先看看 a>4 是什么: &g…
博客总目录:http://www.cnblogs.com/weibaar/p/4507801.html 前言 延续之前的用R语言读琅琊榜小说,继续讲一下利用R语言做一些简单的文本处理.分词的事情.其实就是继续讲一下用R语言读书的事情啦,讲讲怎么用它里面简单的文本处理方法,来优化我们的读书体验,如果读邮件和读代码也算阅读的话..用的代码超级简单,不涉及其他包 这里讲两个示例,结尾再来吐槽和总结. 1)R-Blogger订阅邮件拆分 2) R代码库快速阅读方法 不在博客园上阅读时才会看到的,这篇博文…
本文对应<R语言编程艺术> 第14章:性能提升:速度和内存: 第15章:R与其他语言的接口: 第16章:R语言并行计算 ========================================================================= 性能提升:速度和内存 要使R代码运行速度更快,有以下建议: 通过向量化的方式优化.使用字节码编译等: 将代码中最消耗CPU的核心部分用编译型语言编写,如C或C++: 将代码用某种并行的方式编写. 消除显示循环: 采用向量化提升速度…