本文作者:余光创,目前就读于香港大学公共卫生系,开发过多个R/Bioconductor包,包括ChIPseeker, clusterProfiler, DOSE,ggtree,GOSemSim和ReactomePA. 进化树看起来和层次聚类很像.有必要解释一下两者的一些区别. 层次聚类的侧重点在于分类,把距离近的聚在一起.而进化树的构建虽然也可以说是一个聚类过程,但侧重点在于推测进化关系和进化距离(evolutionary distance). 层次聚类的输入是距离,比如euclidean或ma…

使用PowerDesigner默认配置逆向工程是没有注释(name列为英文,comment列是空的),这样的不方便查看字段具体是什么意义,将注释一同导出,方便查看字段具体的意义,如下图 注释列导出步骤 1.新建脚本DBMS,选择菜单:Tools→Resources→DBMS 弹出List Of DBMS对话框,选择新建 弹出新建对话框,填写名称为“My Microsoft SQL Server 2008”(这个名称可以自己定义),选择“Microsoft SQL Server 2008”,点击O…

前言 ceph的可视化方案很多,本篇介绍的是比较简单的一种方式,并且对包都进行了二次封装,所以能够在极短的时间内构建出一个可视化的监控系统 本系统组件如下: ceph-jewel版本 ceph_exporter的jewel版本 prometheus的2.3.2版本 grafana的grafana-5.2.1版本 Ceph grafana的插件- Clusterby Cristian Calin 适配的系统为centos7 资源如下: http://static.zybuluo.com/zphj1…

前言:大数据,人工智能,工业物联网,5G 已经或者正在潜移默化地改变着我们的生活.在信息技术快速发展的时代,谁能抓住数据的核心,利用有效的方法对数据做数据挖掘和数据分析,从数据中发现趋势,谁就能做到精准控制,实时分析,有的放矢,从而获取更快速.更平稳.更长远地发展.在航空领域,机场.航班和航线信息是至关重要的数据,本文将介绍以 HT 为平台,应用 JavaScript.HTML5.GIS 等技术开发的全球航线实例. 界面预览 - 主界面 - 飞机及飞机阴影动画 代码实现 - 场景搭建 本实例的场…

构建进化树的工具有: muscle mega 进化树的可视化: 本地可视化软件 Figtree (网址:http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/) 该软件是java开发的,运行在JVM上,下载后解压即可,无需安转. 在线可视化软件http://www.evolgenius.info/evolview.html (已注册)http://itol2.embl.de/index.shtml (已注册)…

导入数据 BGI开发的一款web工具,用于可视化GO注释结果.自己平时不用,但要介绍给别人,简单记录下要点,避免每次授课前自己忘了又要摸索. 地址:http://wego.genomics.org.cn/ 导入文件到灰色框中,可同时导入多个文件进行比较(点一次弹出一次).支持多种文件格式导入,如果是自己导入,可另存为txt导入,通常我们做GO注释后,会有这样一个基因和GO对应关系的文件: 如果是要做个样本比较的话,每个样本一个文件导入,这样才好比较. 也可用Launch WEGO Demo直接用…

0.前言 虽然很早就知道R被微软收购,也很早知道R在统计分析处理方面很强大,开始一直没有行动过...直到 直到12月初在微软技术大会,看到我软的工程师演示R的使用,我就震惊了,然后最近在网上到处了解和爬一些R的资料,看着看着就入迷了,这就是个大宝库了,以前怎么没发现,看来还是太狭隘了.直到前几天我看到这个Awesome R文档,我就静不下来了,对比了目前自己的工作和以后的方向,非常适合我.所以毫不犹豫的把这个文档汉化了,所以大家一起享受吧. 说明:本文已经提交到github,地址:https:/…

[翻译]Awesome R资源大全中文版来了,全球最火的R工具包一网打尽,超过300+工具,还在等什么? 阅读目录 0.前言 1.集成开发环境 2.语法 3.数据操作 4.图形显示 5.HTML部件 6.复用组件研究 7.Web技术和服务 8.并行计算 9.高性能 10.语言API 11.数据库管理 12.机器学习 13.自然语言处理 14.贝叶斯 15.最优化 16.金融 17.生物信息学 18.网络分析 19.R 开发 20.日志 21.数据包 22.其他工具 23.其他编译器 24.R学习…

.NET技术, 开源项目, 数据挖掘, 机器学习, 微软Power BI, 足球赛事分析, Matlab与C#编程 博客园 管理 本站首页 头条推荐 Power BI .NET开源 机器学习 博客美化 X组件 Matlab 随笔 - 189  文章 - 15  评论 - 4316 [翻译]Awesome R资源大全中文版来了,全球最火的R工具包一网打尽,超过300+工具,还在等什么? 阅读目录 0.前言 1.集成开发环境 2.语法 3.数据操作 4.图形显示 5.HTML部件 6.复用组件研究…

这本书我看了电子版的,感觉还不错,全书共有20章,书中的简介如下: 本书旨在让你尽快学会 Python ,以便能够编写能正确运行的程序 -- 游戏.数据可视化和 Web 应用程序,同时掌握让你终身受益的基本编程知识.本书适合任何年龄的读者阅读,它不要求你有任何 Python 编程经验,甚至不要求你有编程经验.如果你想快速掌握基本的编程知识以便专注于开发感兴趣的项目,并想通过解决有意义的问题来检查你对新学概念的理解程度,那么本书就是为你编写的.本书还可供初中和高中教师用来通过开发项目向学生介绍编程…