haploview画出所有SNP的LD关系图】的更多相关文章

有时候我们想画出所有SNP的LD关系图,则需要在命令行添加“-skipcheck”命令行,如下所示: java -jar Haploview.jar -skipcheck -n -pedfile 800kb1.ped -info 800kb1.info -png -out 800kb 这样就不需要经过haploview的过滤标准了. 如果只想过滤某个标准,则可参看下来参数 -skipcheck Skip all the genotype data quality checks and uses…
流程图,思维导图,拓扑图通常能把我们遇到的一些复杂的关系结构用图形的方式展现出来.在Latex中要想画这样的拓扑图,有一个很好用的绘图工具包 pgf/tikz . 1.pgf/tikz的安装:pgf/tikz 绘图工具用到的宏是 \usepackage{tikz} .如果你的Latex并不带有这个宏包,那就需要参考[1]中进行安装.也可以直接下载使用带有这个宏包的新版本 CTeX_2.9.2.164_Full. 2.pgf/tikz的使用:参考[2]pgf/tikz使用说明,这里详细介绍了pgf…
http://blog.sina.com.cn/s/blog_53fc9db50100as5o.html 在Visio图形元素上,点击右键,选择“形状显示选项”,将“实现链接”选中,这个时候,类图形元素上会出现一个黄点,拖动这个黄点,连接到表示接口的图形元素上.实现类和接口之间的关系就自动出来了.…
在上一个博客中,我们构建了随机森林温度预测的基础模型,并且研究了特征重要性. 在这个博客中,我们将从两方面来研究数据对预测结果的影响 第一方面:特征不变,只增加样本的数据 第二方面:增加特征数,增加样本的数据 1.sns.pairplot 画出两个变量的关系图,用于研究变量之间的线性相关性,sns.pattle([color]) 用于设置调色板, 有点像scatter_matrix 2.MSE   round(abs(pred - test_y).mean(), 2)  研究预测值与真实值之差的…
VISO画UML用例图添加Include关系的方法 今天用Microsoft Visio 2007画用例图时,发现visio UML用例里面找不到include关系,查到一个可行的解决办法:  1)创建一个UML用例图模板:打开Microsoft Visio  -> 选择模板类别“软件和数据库” -> UML模型图.如果已经创建过,跳过~ 2)点击菜单栏“UML” -> 单击选项“构造型”: 3)点击弹出的面板右侧的[新建],在“构造型”那列输入include,“基类”那列选“归纳”,点…
原文:通通玩blend美工(8)--动态绘制路径动画,画出个萌妹子~ 2年前我在玩Flex的时候就一直有一个疑问,就是如何来实现一个蚊香慢慢烧完的Loading动画呢? 刚经历了某甲方高强度一个月的洗礼后,这几天刚好闲下来,这个问题又浮现在我脑海里.于是经过几番思索纠结后,我发现了一个更好玩的效果,如下:                                                  ↑点击开始   只要是通过path来表示的都可以画出来哦亲~如果好好构思一下是可以实现很震撼的…
前言 本文灵感来源于Mike Bostock 的一个 demo 页面 原 demo 基于 D3.js v3 开发, 笔者将其使用 D3.js v5 进行重写, 并改为使用 ES6 语法. 源码: github 在线演示 : demo 效果 可以看到, 上图左上角为图例, 中间为各个手机公司之间的专利关系图. 图例中有三种线段: 红色实线: 正在进行专利诉讼 (箭头指向方为被诉讼方) 蓝色虚线: 诉讼已经结束 绿色实线: 专利已经授权 实现 下面让我们看看如何一步步实现上图的效果. 分析数据 […
环境Win10 VS2017 .Net Framework4.7.1   本文仅讨论在DrawingVisual中进行的画图.   WPF单位,系统DPI,显示器DPI三者的定义及关系 WPF单位:一种与设备无关的单位,以1/96逻辑英寸为一个单位,也就是说如果将一个对象的长度设为96,那么在任何设备上WPF都会试图将其显示为1逻辑英寸长. 系统DPI:将多少个显示器的像素点定义为1逻辑英寸,默认是96个点 在win10中,图中所设置的 100%即为96DPI; 125%即为120DPI; 15…
今天是个特殊的日子,圣诞节,也是周末,在这里先祝大家圣诞快乐!喜庆的日子,我们可以稍微放松一下,扯一扯昨天雷霆对战凯尔特人的比赛,这场比赛大威少又双叒叕拿下三双,而且是一个45+11+11的超级三双,其实小托马斯的表现也不遑多让,拿下31分9个助攻,末节一开始便带队打出一波小高潮反超比分,无奈威少爷最后几分钟暴走直接带走比赛,让人直呼精彩.好了,扯完之后我们进入正题. 今天给大家带来的是一个比较好玩的东西--H5坦克大战.这个东西的实现主要用到了H5的canvas以及原生的js,如果你已经是大牛…
今天大家在群里大家非常热闹的讨论像画笔一样慢慢画出Path的这种效果该如何实现. 北京-LGL 博客号@ligl007发起了这个话题.然后各路高手踊跃发表意见.最后雷叔 上海-雷蒙 博客号@雷蒙之星 以一种巧妙的思路实现了这个效果 使大家受益匪浅 本来这篇博客应该由雷叔来写的,奈何雷叔忙着写教材,就委托我来写了. 我之前也总结过两种方法,再加上雷叔这第三种方法,一起写出来,分享给大家. 方法1 这种方法是最容易想到的,但是局限性也比较大,只适用于接近直线的这种Path.但是相对的代码比较简单,也…