1.把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下:2.制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /home/username/blast/bin:3.在当前用户目录下,编辑bashrc文件,在文件中加入export PATH=/home/username/bin/=$PATH;4.在当前目录下,将数据文件格式化,$formatdb -i filename.后缀 -p F -o T 5.将待进行blas…

Linux下Setuid命令! 转载  在Linux系统中每个普通用户都可以更改自己的密码,这是合理的设置. 问题是:用户的信息保存在文件/etc/passwd中,用户的密码保存在文件/etc/shadow中,也就是说用户更改自己密码时是修改了/etc/shadow文件中的加密密码,但是, -rw-r--r-- 1 root root 1787 Oct 27  2009 /etc/passwd -r-------- 1 root root 1187 Oct 27  2009 /etc/shado…

链接:http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=830496&do=blog&quickforward=1&id=640600 Linux下BLAST+的本地化(NCBI-BLAST 2.2.29+): 1.  下载软件BLAST: 在以下网址  ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 下载:   ncbi-blast-2.2.29+-x6…

权声明:本文为博主原创文章,遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议,转载请附上原文出处链接和本声明.本文链接:https://blog.csdn.net/xxmonstor/article/details/80507769在使用linux时,经常需要进行文件查找.其中查找的命令主要有find和grep.两个命令是有区的. 区别:(1)find命令是根据文件的属性进行查找,如文件名,文件大小,所有者,所属组,是否为空,访问时间,修改时间等. (2)grep是根据文件的内容进行查找,会对文件的每一…

http://blog.csdn.net/hzqnju/article/details/6779556 http://blog.csdn.net/gxy3509394/article/details/8166288 第一步:下载jdk-7-linux-i586.tar.gz wget -c http://download.oracle.com/otn-pub/java/jdk/7/jdk-7-linux-i586.tar.gz (注:如果下载不下来,建议使用迅雷下载,然后拷贝到Linux系统上.…

介绍: 1 开头 程序必须以下面的行开始(必须方在文件的第一行): #!/bin/sh 符号#!用来告诉系统它后面的参数是用来执行该文件的程序. 在这个例子中我们使用/bin/sh来执行程序. 当编写脚本完成时,如果要执行该脚本,还必须使其可执行. 要使编写脚本可执行: 编译 chmod +x filename 这样才能用./filename 来运行 2 注释 在进行shell编程时,以#开头的句子表示注释,直到这一行的结束. 我们真诚地建议您在程序中使用注释. 如果您使用了注释,那么即使相当长…

版权声明:本文为博主原创文章,遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议,转载请附上原文出处链接和本声明.本文链接:https://blog.csdn.net/qq_33571752/article/details/83826758文件权限#####1.文件属性的查看ls -l filename -|rw-r--r--.|1| root| root|   46 |Oct  1 05:03 |filename— —————————  —  ————  ————    ——  ————————————…

什么是Awk Awk是一种小巧的编程语言及命令行工具.(其名称得自于它的创始人Alfred Aho.Peter Weinberger 和 Brian Kernighan姓氏的首个字母).它非常适合服务器上的日志处理,主要是因为Awk可以对文件进行操作,通常以可读文本构建行. 我说它适用于服务器是因为日志文件,转储文件(dump files),或者任意文本格式的服务器终止转储到磁盘都会变得很大,并且在每个服务器你都会拥有大量的这类文件.如果你经历过这样的情境--在没有像Splunk或者其他等价的工…

[原文地址]http://blog.csdn.net/hikaliv/article/details/4276758 [cpp] view plaincopy   for( i = 0; i < 5; i++ ) if( fork() == 0 ) continue; 共生成多少个子进程? 简查了一下 fork() 的知识,它调用一次,返回两次,进入子进程并返回一次,然后退到父进程再返回一次,子进程中返回值为 0,父进程中返回的是子进程的进程号. 答案是 31. 如上图所示,这就是一个二项树,二…

linux 下的信号量参数 转载自:http://blog.itpub.net/26110315/viewspace-718306/ 信号量是一种锁机制用于协调进程之间互斥的访问临界资源.以确保某种共享资源不被多个进程同时 访问.数据库使用信号量来管理对操作系统资源的访问(比如内存共享段).如果所有数据库进程所 需的信号量不足,会导致数据库不能启动或者运行时出错.这时候DBA 需要查看内核的信号量参数, 并重新进行设置. [root@zeng ~]# cat /proc/sys/kernel/s…

如何用javac 和java 编译运行整个Java工程 (转载)  http://blog.csdn.net/huagong_adu/article/details/6929817 [转]在Linux下编译与执行Java程序  http://www.cnblogs.com/howard-queen/archive/2012/01/30/2331795.html 执行 java /root/first 仍然出现错误 "Exception in thread "main" jav…

转载自:http://www.hackbase.com/tech/2012-02-27/65972.html 编辑生成.mo文件 我们在弄网站的时候很可能会接触到.mo和.po文件..po文件是GNU gettext项目的一套应用规范,“po”是: Portable Object(可跨平台对象)的缩写..mo文件是二进制格式文件,通常我们要更改网站语言,需要对该文件进行反编译,得到.po文件,然后用相应的程序 打开.po文件进行编辑后再行打包成.mo文件. WordPress的世界里, 我们经常…

一下内容转载于:http://blog.chinaunix.net/space.php?uid=22976768&do=blog&id=1640924.这个总结的很好~ windows下的TortoiseSVN是资源管理器的一个插件,以覆盖图标表示文件状态,几乎所以命令都有图形界面支持,比较好用,这里就不多说.主要说说linux下svn的使用,因为linux下大部分的操作都是通过命令行来进行,所以必须得掌握linux下svn的常用指令.当然linux下也有模仿TortoiseSVN的lin…

[转载]实战Linux下VMware虚拟机根目录空间扩充 (2011-07-31 21:34:34) 转载▼ 标签: 转载   原文地址:实战Linux下VMware虚拟机根目录空间扩充作者:sharps 今天上午接到通知说服务器挂了,经过检查发现原因是Linux的虚拟机根分区已经使用100%,以至于服务不能正常进行. 经过小小的研究,顺利解决问题,把服务器的空间由4G扩成12G.现将执行全过程总结如下,以供分享. 首先,介绍下大体的解决思路,要想扩充,硬件上要有准备,说白了也就是要有一块新的空…

转自:http://www.cnblogs.com/sixiweb/archive/2012/11/20/2778732.html 搭建过程参考这篇文章 先说我搭建过程中出现的问题吧: 按照 教程搭建好之后出现了619错误,查看日志:/var/log/messages: Nov 20 09:46:20 localhost pptpd[7498]: GRE: read(fd=6,buffer=8059680,len=8196) from PTY failed: status = -1 error…

(转载)http://www.xinfengit.com/200907/1433646.html 由于DOS下的编辑器和linux(linux教程 linux培训 )编辑器对文件行末的回车符处理不一致,在Linux下经常能看到C文件或者TXT文件每行末尾都有一个^M符号,这个会导致shell脚本运行错误. 我们可以采用VI的编辑器命令进行删除. 下面是我自己发明的一种方法和石头提供的,都差不多一样,利用VI的查找替换命令,将^M替换为空格符 (1):在VI的编辑模式下,ESC shilt + :…

Linux下单机安装ASM流程总结 一．安装Linux ESXi上传iso镜像至存储目录 创建虚拟机,并且选择主机设备的ISO启动 选择完成时编辑虚拟机设置 配置镜像文件如下: 打开控制台: 并且选择开机 点击开机并且进行安装linux 选择第一项目进行安装 Skip检查快速安装 输入机器名: 进行磁盘的设置 将SWAP分区设置的较大(50G左右) 选择现在定义源,增加部分包 Linux安装完成即可 二 .  系统参数修改以及软件安装 转载:http://www.cnblogs.com/jyzh…

转载https://blog.csdn.net/weixin_38187469/article/details/79273962 开启mysql日志   1.查看日志是否启用 mysql> show variables like 'log_bin'; 出现off就代表没有开启. 2.编辑my.cnf 退出mysql Linux下输入[root@izuf60sguf4gh3h771pjx6z etc]# vim my.cnf  新增两句话 server-id=1(单个服务器设置为1) log-bi…

详细介绍文档 转载文章路径 /bin:二进制可执行命令. /dev:设备特殊文件. /etc:系统管理和配置文件. /etc/rc.d:启动的配 置文件和脚本. /home:用户主目录的基点,比如用户user的主目录就是/home/user,可以用~user表示. /lib:标准程序设计库,又 叫动态链接共享库,作用类似windows里的.dll文件. /sbin:系统管理命令,这 里存放的是系统管理员使用的管理程序. /tmp:公用的临时文件存储 点. /root:系统管理员的主目 录. /m…

转载源地址:https://www.cnblogs.com/qingergege/p/5914218.html 1.getopt()函数的出处就是unistd.h头文件(哈哈),写代码的时候千万不要忘记把他老人家include上. 2.原型:int getopt(int argc,char * const argv[ ],const char * optstring); 1)前两个参数就是main函数的两个参数; 2)第三个参数是个字符串,看名字,我们可以叫他选项字符串(后面会说明) 3)返回值…

原文地址:[转载]Linux下安装LoadRunner LoadGenerator作者:邱建忠tester LR的负载机安装在linux的理由: 1.windows xp,双核+4G内存,基本上每个vuser会消耗2-5m的内存,单机300-500的虚拟用户时,CPU已经超过90%,此时整个测试系统的瓶颈实际上是负载机,已经无法真实反映系统性能.当然可以通过多负载机的模式来实现,但是这样的测试环境构造起来成本比较高,性价比不高. 2.很多时候,被测试环境是放在机房的,那么在机房丢一台window…

usb_bulk_msg函数 当对usb设备进行一次读或者写时,usb_bulk_msg 函数是非常有用的; 然而, 当你需要连续地对设备进行读/写时,建议你建立一个自己的urbs,同时将urbs 提交给usb子系统. 转载于此http://os.chinaunix.net/a2003/0630/1056/000001056933.shtml Linux下的硬件驱动——USB设备(上)(驱动配置部分) USB设备越来越多,而Linux在硬件配置上仍然没有做到完全即插即用,对于Linux怎样配置和…

[转载]Linux下非root用户如何安装软件 来源:https://tlanyan.me/work-with-linux-without-root-permission/ 这是本人遇到的实际问题,之前用到的所有机器,无论是自己的PC还是云服务器,root权限都是妥妥的,但是现在发现实验室的服务器原来自己并没有root权限2333 再看用户的权限.root用户是bug,电脑上所有的文件都是它的,权限位设置对其无效.非root用户默认 只对家目录有完全的控制权限,对/tmp目录有读写的权限./tm…

我们知道启动springboot的项目有三种方式: 运行主方法启动 使用命令 mvn spring-boot:run”在命令行启动该应用 运行“mvn package”进行打包时,会打包成一个可以直接运行的 JAR 文件,使用“java -jar”命令就可以直接运行. 我们在开发的时候,通常会使用前两种,而在部署的时候往往会使用第三种.但是,我们在使用java -jar来运行的时候,并非后台运行. 下面我们来说说服务器上如何后台启动springboot项目.实际上,实现的方法有很多种,这里就列两…

Linux下高cpu解决方案(转载 1.用top命令查看哪个进程占用CPU高gateway网关进程14094占用CPU高达891%,这个数值是进程内各个线程占用CPU的累加值.   PID USER      PR  NI  VIRT  RES  SHR S %CPU %MEM    TIME+  COMMAND    14094 root      15   0  315m  10m 7308 S 891%  2.2   1:49.01 gateway                     …

Linux下的I/O复用与epoll详解 转载自:https://www.cnblogs.com/lojunren/p/3856290.html  前言 I/O多路复用有很多种实现.在linux上,2.4内核前主要是select和poll,自Linux 2.6内核正式引入epoll以来,epoll已经成为了目前实现高性能网络服务器的必备技术.尽管他们的使用方法不尽相同,但是本质上却没有什么区别.本文将重点探讨将放在EPOLL的实现与使用详解. 为什么会是EPOLL select的缺陷      …

linux下的文件结构,看看每个文件夹都是干吗用的/bin 二进制可执行命令 /dev 设备特殊文件 /etc 系统管理和配置文件 /etc/rc.d 启动的配置文件和脚本 /home 用户主目录的基点,比如用户user的主目录就是/home/user,可以用~user表示 /lib 标准程序设计库,又叫动态链接共享库,作用类似windows里的.dll文件 /sbin 系统管理命令,这里存放的是系统管理员使用的管理程序 /tmp 公用的临时文件存储点 /root 系统管理员的主目录(呵呵,特权…

linux 下查看机器cpu是几核的 本文转自”映月的博客“:http://wurhuangfeng.blog.163.com/blog/static/35178241201111235829116/. 几个cpu more /proc/cpuinfo |grep "physical id"|uniq|wc -l 每个cpu是几核(假设cpu配置相同) more /proc/cpuinfo |grep "physical id"|grep "0"…

因为工作原因,需要经常在不同的服务器见进行文件传输,特别是大文件的传输,因此对linux下不同服务器间数据传输命令和工具进行了研究和总结.主要是rcp,scp,rsync,ftp,sftp,lftp,wget,curl. rcprcp不是一种安全的的传输文件的方式,rcp通过rsh(rsh见下面)来执行远程命令,要使用rcp必须经过一些配置,现在rcp已经被scp取代了,常用scp来进行文件传输.要使用rcp,需要具备以下条件: (1)如果系统中有/etc/hosts 文件,应确保该文件包含要与…

原文来自:http://www.cnblogs.com/wen858636827/archive/2012/12/26/2834373.html /opt   放置用户自己下载的软件  英文全称是optional 美 [ ˈɑ:pʃənl ] 随意的 adj. 可选择的; 随意的,任意的; 非强制的; 选修科目 /bin 二进制可执行命令 /dev 设备特殊文件 /etc 系统管理和配置文件 /etc/rc.d 启动的配置文件和脚本 /home 用户主目录的基点,比如用户user的主目录就是/h…