RNA-seq简单处理流程】的更多相关文章

基于modelsim-SE的简单仿真流程—下 编译 在 WorkSpace 窗口的 counter_tst.v上点击右键,如果选择Compile selected 则编译选中的文件,Compile All是编译所有文件,这里选择 Compile->Compile All,如下图所示: 在脚本窗口中将出现绿色字体: # Compile of counter.v was successful. # Compile of counter_tst.v was successful.,说明文件编译成功,在…
基于modelsim-SE的简单仿真流程 编写RTL功能代码 要进行功能仿真,首先得用需要仿真的模块,也就是RTL功能代码,简称待测试的模块,该模块也就是在设计下载到FPGA的电路.一个电路模块想要有输出,就得有输出,数字电路也是一样的,时钟和复位信号是必不可少的测试激励信号之一,同时可能还包括控制信号.数据信号.这里总结一下,一般系统中包括的测试激励信号主要为四大类: 系统信号(时钟.时钟使能信号.复位信号等): 控制信号(使能信号.片选信号.握手信号,状态机控制信号等): 数据信号(并行接口…
两种RNA seq的基因表达量计算方法: 1. RPKM:http://www.plob.org/2011/10/24/294.html 2. RSEM:这个是TCGAdata中使用的.RSEM据说比RPKM更有优势.anyway,原来还以为TCGA 的data需要重新换算成RPKM,现在不需要了~:)…
原文:微信公众号PHP简单开发流程 微信公众号开发分傻瓜模式和开发者模式两种,前者不要考虑调用某些接口,只要根据后台提示傻瓜式操作即可,适用于非专业开发人员. 开发模式当然就是懂程序开发的人员使用的. 下面简单说一下微信公众号开发的简易流程,新手看看会有帮助,高手请一笑而过. 1.配置服务器: A.首先在本机建立如下结构的文件夹(这里是我自己的习惯,仅供参考) MMPN:总目录mro message public number 微信公众号 backup:备份目录,主要用于备份php文件,每次修改…
变量:强类型局部变量: 1.先赋值,后使用 2.作用范围:从定义开始,到所在代码块结束 3.重合范围内不允许重复命名 数据类型(8中基本类型) byte 1B -128~127 short 2B -32768~32767 int 4B long 8B l或L float 4B f 或F double 8B d或D 不加 boolean 1B true false char 2B 'A'对象类型 String "hehe"强制转换 int a=(int)12.5; 自动类型提升 a b…
RNA -seq RNA-seq目的.用处::可以帮助我们了解,各种比较条件下,所有基因的表达情况的差异. 比如:正常组织和肿瘤组织的之间的差异:检测药物治疗前后,基因表达的差异:检测发育过程中,不同的发育阶段,不同的组织之间的基因表达差异 等 在所有检测的差异类型中,最常用的一种检测就是:检测所有mRNA的表达量的差异. 还可以检测 RNA 的结构上的差异.例如:mRNA的剪接方式的差异,即“可变剪接”:还可以检测“融合基因”,同时还可以检测基因单点突变导致的SNP. 测序方法.步骤:人的细胞…
前言:对于急切想了解引擎功能的开发人员,在下载版本后,就想尝试编写代码,完成一个流程的开发和测试.本文试图从一个最简单的流程来示例说明,如何快速了解引擎代码的编写. 版本: .NETCore 2.1 1. 创建流程图形 串行流程(Sequence)用于顺序流程的创建,节点按照前后顺序生成. var pmb = ProcessModelBuilder.CreateProcess("BookSellerProcess", "BookSellerProcessCode")…
友情推广:Uminicmf 一个基于thinkphp开发的OA框架.http://blog.csdn.net/youmypig/article/details/51727713 drupal 简单站点开发流程 1.创建菜单和栏目 2.创建各种内容模型(比方blog,文章,Book,产品,超链接等等) 3.创建主题 不喜不要喷.就学了这么一点 $(function () { $('pre.prettyprint code').each(function () { var lines = $(thi…
RNA_seq pipline RNA_seq pipline PeRl 2018年3月7日 首先说明一下我做RNA-seq处理流程的文件树格式: RNA-seq/ data/ GRCh38.gtf chroms/ hg38/ samples/ SraAccList.txt sra/ fasta/ fastqc/ cufflinks_result/ tophat_result/ HTSeq_result/ tools/ Trimmomatic-0.36/ 1. 下载参考基因组序列信息及注释文件G…
今天通过一个简单的例子梳理一下用jmeter进行测试的流程 1.确定被测网站:gogomall.com 2.制定测试指标:响应时间和错误率 3.设计测试场景 4.具体测试步骤 1>创建一个测试计划,测试计划里创建线程组,线程组中再创建取样器,一般是http请求,创建成功如下图: 下面来解释一下http请求的设置: ①名称:用于标识一个取样器,建议使用一个有意义的名称,自己能够区分 ②注释:仅用于记录用户可读的注释信息,对测试无任何作用 ③协议:向目标服务器发送http请求时的协议,可以是http…