思来想去,还是觉得ENCODE的流程靠谱,所以又花了快一周来调试,终于排除万难,跑成功了.[2019年12月08日] 以下是ATAC生成的结果目录: call-align call-call_peak_pooled call-filter call-idr_ppr call-overlap call-pool_ta_pr2 call-spr call-align_mito call-call_peak_ppr1 call-frac_mito call-idr_pr call-overlap_pp…

一.数据分析的步骤: 1.查看数据并提出问题 2.数据清洗 3.代码编写,提取出结果数据,并分析是否有异常数据,修改代码 4.根据数据选择合适的图表进行展示 5.根据图表小组讨论交流获得最终的结果 二.环境与原始数据准备 安装Anaconda2版本,同时更新软件包更新最新版本  conda upgrade --all 下载first.zip文件,解压 里面有3张csv文件分别是enrollments.csv,daily_engagements.csv,project_submission.csv…

题目:MHCquant: Automated and reproducible data analysis for immunopeptidomics 期刊:Journal of Proteome Research 发表时间:October 7, 2019 DOI:10.1021/acs.jproteome.9b00313 分享人:陈洁 本次分享的文章的题目是:MHCquant: Automated and reproducible data analysis for immunopeptido…

1.获取数据 2.去掉空值.空行.重复行 3.去掉无用行,筛选出需要行 4.分组数据 5.数据排序…

seq 5 seq 5 >1.txt 其中的>是覆盖 seq 1 5 用来产生从数1到数5之间的所有整数 或, seq 5…

[root@room9pc01 ~]# seq 5 1 2 3 4 5 [root@room9pc01 ~]# seq 2 5 2 3 4 5 seq 1 2 10 1 3 5 7 9 [root@desktop0 ~]# seq 10 -2 1 10 8 6 4 2 /etc/profile #定义的系统变量文件…

前言 我们公司在日志管理方面一直没有统一,主要痛点有: 每个开发人员都是各用各的,存储日志的形式也是五花八门,如:本地文件,数据库,Redis,MongoDB 由于公司访问服务器要通过堡垒机,所以本机无法直连测试或生产环境.如果测试日志是写入本地文件,就需要开发人员只能登录服务器上查看日志,查看非常不方便. 综合以上所述有三种选择: 自己写一个日志系统 找一个现成的 不记录日志了 综合考虑,第三点肯定是不靠谱的,第一点成本太高,公司本来就比较忙,那就只能去找一个现成的了… Seq简介 Seq是运…

Python 数据分析环境 数据分析领域有很多可选方案,例如SPSS傻瓜式分析工具,SAS专业性商业分析工具,R和python这类需要代码编程类的工具.个人选择是python这类,包括pandas,numpy,matplotlib,sklearn,keras.基于jupyter或者zeppelin作为编程界面,可以用python开发出比较清爽的数据分析报告. 总体来说,jupyter notebook编写的分析结果基本上可以满足要求,但是也有些弊端,例如无法做很好的presentation,虽然…

有时候可能有这样的需要:用Shell生成类似0001这样的序列作为批次号,这里整理了一下个人的方法 方法一:通过seq命令 seq命令可以生成从某个数字到递增到另一数字的序列.用法如下: # seq --help Usage: seq [选项] 尾数 or: seq [选项] 首数 尾数 or: seq [选项] 首数 增量值 尾数 Print numbers from FIRST to LAST, in steps of INCREMENT. 选项参数如下: -f, --format=格式 u…

1.seq() 用来生成一组数字的函数. Usage: ## Default S3 method:seq(from = 1, to = 1, by = ((to - from)/(length.out - 1)),length.out = NULL, along.with = NULL, ...)seq.int(from, to, by, length.out, along.with, ...)seq_along(along.with)seq_len(length.out) Arguments:…