生命组学: 比较真核生物有关呼吸链的gene是比较核外编码基因,因为与呼吸有关的功能在线粒体上,线粒体位于核外.想要查看两种基因是否具有相互作用,可以对不同物种的编码ATP6 和ATP8的直系同源基因构建共进化树:可以绘制热图观察其区块化现象:可以计算相关系数:可以绘制箱图,进行类别之间相互比较,可看出显著性差异.以上操作都可以得到一组值或者图,为判定是否具有相互作用,可使用已知数据做同样操作,得到一个标准值.两相比较得到复合物之间相互作用. DIP(蛋白质相互作用数据库)和PCN这些已有数据库…

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概述 Jstat是JDK自带的一个轻量级小工具.全称“Java Virtual Machine statistics monitoring tool”,它位于java的bin目录下,主要利用JVM内建的指令对Java应用程序的资源和性能进行实时的命令行的监控,包括了对Heap size和垃圾回收状况的监控. jstat 用法   option: 参数选项 -t: 可以在打印的列加上Timestamp列,用于显示系统运行的时间 -h: 可以在周期性数据数据的时候,可以在指定输出多少行以后输出一次表…

宏基因组 ( Metagenome)(也称微生物环境基因组 Microbial Environmental Genome, 或元基因组) .是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名词, 其定义为"the genomes of the total microbiota found in nature" , 即生境中全部微小生物遗传物质的总和.它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因, 目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和.而所谓宏基因组学 (或元基因组学, meta…

NGS又称为下一代测序技术,高通量测序技术 以高输出量和高解析度为主要特色,能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列读取,在提供丰富的遗传学信息的同时,还可大大降低测序费用.缩短测序时间的测序技术. Sanger法测序(一代测序):是一种利用DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物的测序技术.每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP).由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基团,使延长的…

摘要 分型是计算生物学的一个新兴领域,在临床决策和生物医学科学中有着重要的应用. 虽然机器学习技术在许多生物医学应用中显示出巨大的潜力,但它们在分型中的用途尚未完全理解. 在本文中,我们研究了基于聚类的多倍体生物的阶段化技术的发展,其中在所研究的生物的细胞中每个染色体存在两个以上的拷贝. 我们基于相关聚类的概念,开发了一个称为PolyCluster(多集群)的新框架,然后使用一个有效的聚类合并机制来最小化驻留在每个集群中的短读之间的不一致量. 我们首先引入一个图形模型来量化每对DNA读数之间的相…

一.基本概念 dip        : Density independent pixels ,设备无关像素. dp        :就是dip px        : 像素 dpi       :dots per inch , 直接来说就是一英寸多少个像素点.常见取值 120,160,240.我一般称作像素密度,简称密度 density : 直接翻译的话貌似叫 密度.常见取值 1.5 , 1.0 .和标准dpi的比例(160px/inc) 分辨率   : 横纵2个方向的像素点的数量,常见取值…

最近每天半夜,服务器都会出现崩掉的现象,pc  app 都不能正常使用 查看错误日志发现问题所在: [Wed Nov 09 08:07:28.651642 2016] [mpm_winnt:error] [pid 4256:tid 2692] AH00326: Server ran out of threads to serve requests. Consider raising the ThreadsPerChild setting Starting the Apache2a service…

在Android手机的诞生之初,由于Android系统是开源的,一开始便有众多的OEM厂商对Android手机进行深度定制,于是乎Android手机的皮肤和屏幕大小都变得百花齐放,这可苦逼了我们这群开发者,因为我们被要求要注意写出一个好的Android软件,写一次代码就能适应大小不同的屏幕.这就好比,你做了一套衣服,要让不同身材的人都穿得合身,类似于生活中的道理,我们这套衣服肯定不能用没有弹性的布料,所以我们要像生活中那种无尺码,有弹性的衣服学习,在代码里面尽量让界面能够自动适应屏幕的大小,幸好…

原题链接:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=4870 原题: Rating Time Limit: 10000/5000 MS (Java/Others)    Memory Limit: 32768/32768 K (Java/Others) Total Submission(s): 654    Accepted Submission(s): 415 Special Judge Problem Description    A little…