Seurat | 单细胞分析工具】的更多相关文章

Seurat是一个老牌的单细胞分析工具了(satija的力作),我之前测试过,但是没怎么用. 最近发现这个工具又publish在了NBT上,所以很有必要看一下这篇文章. Integrating single-cell transcriptomic data across different conditions, technologies, and species 主要目的:identifying subpopulations of cells that are present across m…
1 lint简介 1.1 概述 lint是随Android SDK自带的一个静态代码分析工具.它用来对Android工程的源文件进行检查,找出在正确性.安全.性能.可使用性.可访问性及国际化等方面可能的bugs和可优化提升的地方. 1.2 lint工作流程 针对我们的项目,通过lint.xml配置lint分析的选项,执行检查后,会针对要分析的issue生成报告. 2 lint使用 有关lint的使用,有以下地方需要理解: 2.1 分析的范围 要对Android项目进行静态分析,首先就是指定要分析…
性能测试排查定位问题,分析调优过程中,会遇到要分析gc日志,人肉分析gc日志有时比较困难,相关图形化或命令行工具可以有效地帮助辅助分析. Gc日志参数 通过在tomcat启动脚本中添加相关参数生成gc日志 -verbose.gc开关可显示GC的操作内容.打开它,可以显示最忙和最空闲收集行为发生的时间.收集前后的内存大小.收集需要的时间等. 打开-xx:+ printGCdetails开关,可以详细了解GC中的变化. 打开-XX: + PrintGCTimeStamps开关,可以了解这些垃圾收集发…
引言 本文为 Java 性能分析工具系列文章第三篇,这里将介绍如何使用 Java 任务控制器 Java Mission Control 深入分析 Java 应用程序的性能,为程序开发人员在使用 Java 任务控制器的时候提供帮助.第一篇:操作系统工具,第二篇:Java 内置监控工具. JMC 是在 JAVA 7u40 发布中加入的性能监控工具.使用过 JDK 6 中 JRockit JVM 的用户并不会陌生,因为它是 Java 7 中 JMC 功能的一部分.启动 JMC 后将会显示当前机器中的所…
引言 本文为 Java 性能分析工具系列文章第二篇,第一篇:操作系统工具.在本文中将介绍如何使用 Java 内置监控工具更加深入的了解 Java 应用程序和 JVM 本身.在 JDK 中有许多内置的工具,其中包括: jcmd:打印一个 Java 进程的类,线程以及虚拟机信息.适合用在脚本中.使用 jcmd - h 来查看使用方法. jconsole:提供 JVM 活动的图形化展示,包括线程使用,类使用以及垃圾回收(GC)信息. jhat:帮助分析内存堆存储. jmap:提供 JVM 内存使用信息…
引言 性能分析的前提是将应用程序内部的运行状况以及应用运行环境的状况以一种可视化的方式更加直接的展现出来,如何来达到这种可视化的展示呢?我们需要配合使用操作系统中集成的程序监控工具和 Java 中内置的监控分析工具来进行 Java 程序的性能分析.本文为系列文章,共三篇分别介绍这几类工具.在本文中将介绍操作系统中的性能监控工具. 操作系统中的程序性能监控工具并非只针对于 Java 程序,适用于所有运行其中的程序.在基于 UNIX 的操作系统中,有许多命令行工具可以用来监控程序的运行状况,例如 s…
测试环境:Ubuntu16.04(在VMWare虚拟机使用perf top存在无法显示问题) Kernel:3.13.0-32 系统级性能优化通常包括两个阶段:性能剖析(performance profiling)和代码优化.性能剖析的目标是寻找性能瓶颈,查找引发性能问题的原因及热点代码.代码优化的目标是针对具体性能问题而优化代码或编译选项,以改善软件性能. 在性能剖析阶段,需要借助于现有的profiling工具,如perf等.在代码优化阶段往往需要借助开发者的经验,编写简洁高效的代码,甚至在汇…
软件交流群:571171251(软件免费版本在群内提供) krpano技术交流群:551278936(软件免费版本在群内提供) 最新博客地址:blog.turenlong.com 限时下载地址:http://pan.baidu.com/s/1kVRW9AR 版本更新历史 1.2.0(2017.1.4) 1.新增:预览功能,krpano项目/普通网页可以无需打开服务器直接在工具中浏览2.新增:输入框中增加了右键菜单"粘贴"3.新增:krpano项目强力加密功能4.修正:解密时无法获取到k…
软件交流群:571171251(软件免费版本在群内提供) krpano技术交流群:551278936(软件免费版本在群内提供) 最新博客地址:blog.turenlong.com 限时下载地址:http://pan.baidu.com/s/1kVRW9AR 强力加密KRPano项目 KRPano资源分析工具1.2版本加入了强力加密KRPano项目的功能,相比KRPano自带的加密,强力加密使得KRPano项目难以被破解,可以有效保护XML,全景图片资源. 加密具有以下特性: 1.KRPano主J…
软件交流群:571171251(软件免费版本在群内提供) krpano技术交流群:551278936(软件免费版本在群内提供) 最新博客地址:blog.turenlong.com 限时下载地址:http://pan.baidu.com/s/1boM583X KRPano资源分析工具可以分析网站(不限于KRPano制作的网站,任意网站均可)的资源结构,例如,我们在网址框中,输入一个全景网站,输入完成后,点击回车,即可浏览网站. http://vr.pacificparkbrooklyn.com/p…
软件交流群:571171251(软件免费版本在群内提供) krpano技术交流群:551278936(软件免费版本在群内提供) 最新博客地址:blog.turenlong.com 限时下载地址:http://pan.baidu.com/s/1boM583X 对于下载完成的切片图(如何下载切片图:http://www.cnblogs.com/reachteam/p/6131093.html), 可以对这些图片进行拼接,还原为球面图. 操作十分简单,只需要在上一步所下载的切片图目录上,单击鼠标右键,…
软件交流群:571171251(软件免费版本在群内提供) krpano技术交流群:551278936(软件免费版本在群内提供) 最新博客地址:blog.turenlong.com 限时下载地址:http://pan.baidu.com/s/1boM583X KRPano资源分析工具支持批量下载全景网站的全景切片图,例如下面的一个网站 http://vr.firstep.cn/dawa/lvyou/pano/honghaitanlangdao/tour.html 首先我们先在资源查看器中的筛选框中…
软件交流群:571171251(软件免费版本在群内提供) krpano技术交流群:551278936(软件免费版本在群内提供) 最新博客地址:blog.turenlong.com 限时下载地址:http://pan.baidu.com/s/1boM583X KRpano网站中,有一些XML文件是被加密的,我们可以使用KRPano资源分析工具进行解密. 在如下的网站中:http://vr.pacificparkbrooklyn.com/park_stills.html 我们可以查看其中一个名为pp…
Roslyn的PM(程序经理) Bill Chiles,Roslyn使用纯托管代码开发,但性能超过之前使用C++编写的原生实现,这有什么秘诀呢?他最近写了一篇文章叫做<Essential Performance Facts and .NET Framework Tips>里头推荐了一个性能分析工具<Improving Your App's Performance with PerfView>.PerfView能够收集Windows事件跟踪(ETW)数据来追踪程序的调用流向,这些程序…
Understand 2.0是一款源代码阅读分析软件,功能强大.试用过一段时间后,感觉相当不错,确实可以大大提高代码阅读效率.由于Understand功能十分强大,本文不可能详尽地介绍它的所有功能,所以只列举本人认为比较重要或有特色的功能,以做抛砖引玉之举. Understand 2.0可以从http://www.scitools.com/下载到,安装后可以试用15天. 使用Understand阅读代码前,要先创建一个Project,然后把所有的源代码文件加入到这个Project里.这里我创建了…
来源:http://www.csdn.net/article/2012-11-23/2812174-5-Good-and-useful-.NET-Profilers 虽然.NET框架号称永远不会发生内存泄漏,原因是引入了内存回收机制.但在实际应用中,往往我们分配了对象但没有释放指向该对象的引用,导致对象永远无法释放.最常见的情况就是给对象添加了事件处理函数,但当不再使用该对象时却没有将该函数从对象的事件handler中减掉.另外如果分配了非托管内存,而没有手工释放,GC同样无能为力.所以当.NE…
一款好用且免费的语句分析工具 在调优过程中的查询语句优化阶段,分析语句的执行计划是必经之路,一款好的执行计划分析工具确实可以帮助我们事半功倍 一款名为“Plan Explorer“,自己用的挺爽,不私藏了,分享给大家 小贴士:Plan Explorer是将Plan Explorer 专业版与免费版整合在一起发布的全新.完全免费版.微软的数据库专家和开发人员也在用哦.现在,整个功能集全免费的,对于DBA来说,福利啊! Plan Explorer主要功能介绍 1. 通过执行计划表格或图形形式,快速定…
转自51Testinghttp://bbs.51testing.com/viewthread.php?tid=116526 经常看到很多人讨论说loadrunner对linux/aix的性能监测太少,的确,LR对于非WINDOWS平台的监测是太少了点,但是我们可以借助IBM的nmon来进行性能分析,这是一个非常棒的工具,下载地址在IBM官方网站:http://www-941.haw.ibm.com/collaboration/wiki/display/Wikiptype/nmon nmon分析工…
常用 Java 静态代码分析工具的分析与比较 简介: 本文首先介绍了静态代码分析的基 本概念及主要技术,随后分别介绍了现有 4 种主流 Java 静态代码分析工具 (Checkstyle,FindBugs,PMD,Jtest),最后从功能.特性等方面对它们进行分析和比较,希望能够帮助 Java 软件开发人员了解静态代码分析工具,并选择合适的工具应用到软件开发中. 引言 在 Java 软件开发过程中,开发团队往往要花费大量的时间和精力发现并修改代码缺陷.Java 静态代码分析(static cod…
官网下载地址(30天免费试用):http://revealapp.com/ 作用: 在 iOS 开发中,我们有时很希望有一款类似 Web 开发中的 UI Debug 工具(例如:Firebug),让我们能够实时查看 UI 的结构,还可以实时更改某个 UIView 的位置和大小的相关属性值查看效果.这里我们发现原来真有这么一款强大的工具存在,他就是 Reveal.(虽然现在的 Xcode 版本有「Capture View Hierarchy」功能,但支持的功能还只是基础的查看 UI 结构,对比 R…
在调优过程中的查询语句优化阶段,分析语句的执行计划是必经之路,一款好的执行计划分析工具确实可以帮助我们事半功倍 小贴士:Plan Explorer是将Plan Explorer 专业版与免费版整合在一起发布的全新.完全免费版.微软的数据库专家和开发人员也在用哦.现在,整个功能集全免费的,对于DBA来说,福利啊! Plan Explorer主要功能介绍: 1. 通过执行计划表格或图形形式,快速定位存储过程中的哪个语句Statement使用总资源最多(百分比),IO读写的比较多(线的粗细). 2.…
1. 3D分析 1.1. 3D Features toolset 工具 工具 描述 3D Features toolset (3D 要素工具集) Add Z Information 添加 Z 信息 添加关于具有 Z 值的要素类中的要素的高程属性的信息. Buffer 3D 3D 缓冲 围绕点或线创建三维缓冲区以生成球形或圆柱形的多面体要素. Difference 3D 3D 差异 消除目标要素类中部分与减法要素类中闭合的多面体要素体积重叠的多面体要素. Enclose Multipatch 封闭…
测试环境: linuxMint + nginx1.4.6+mysql5.5+php5.5 什么是xhprof? XHProf是一个分层PHP性能分析工具.它报告函数级别的请求次数和各种指标,包括阻塞时间,CPU时间和内存使用情况.一个函数的开销,可细分成调用者和被调用者的开销,XHProf数据收集阶段,它记录调用次数的追踪和包容性的指标弧在动态callgraph的一个程序. 一,如何安装? 1,下载最新的xhprof包 官网地址:https://pecl.php.net/package/xhpr…
软件开发中的性能优化对程序员来说是一个非常重要的问题.一个小问题可能成为一个大的系统的瓶颈.但是对于程序员来说,通过自身去优化代码是十分困难的.幸运的是,有一些非常棒的工具可以帮助程序员进行代码分析和性能测试,从而大大简化程序员进行代码性能优化的过程.MSDN杂志2011年7月份曾发布主题为“.NET代码分析工具和技术”的那一期,让广大程序员收获颇丰.四年过去之后,这些工具又进一步做出了很多改进,同时也出现了更多的选择.本文对当前主流的一些Visual Studio代码性能分析工具进行简单的梳理…
转自:http://blog.chinaunix.net/uid-26488891-id-3118279.html Normal 0 7.8 磅 0 2 false false false EN-US ZH-CN X-NONE MicrosoftInternetExplorer4 /* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:普通表格; mso-tstyle-rowband-size:0; mso-tstyle-colb…
Android Studio 翻译的官方文章 原文链接 当你在Android Studio中使用Android Monitor里的Memory Monitor工具监视内存使用情况时,可以把Java堆快照转储到Android HPROF文件中(译者注:与标准的java hprof文件格式标准不一样).HPROF查看工具会列出类.类的实例和实例的引用树,以此来帮助你跟踪内存的使用情况,找出内存泄漏的地方.HPROF最初是由J2SE支持的一种二进制堆转储格式. (本文出处:http://www.jia…
上篇文章介绍了: Reveal UI 分析工具简单使用 这里介绍如何使用 Reveal UI 分析工具来进行手机 App UI 界面的分析. 前提准备: (1)已安装 Reveal 的 Mac (2)已越狱的 iPhone (3)良好的网络环境 原理: 回想起我们使用 Reveal 来分析 iPhone 模拟器的 App 时,我们是在 Xcode 的指定工程里引用并加载 Reveal.framework 文件,从而当 App 运行时,打开 Reveal 选中连接当前 App 就可以进行他的 UI…
性能测试排查定位问题,分析调优过程中,会遇到要分析gc日志,人肉分析gc日志有时比较困难,相关图形化或命令行工具可以有效地帮助辅助分析. Gc日志参数 通过在tomcat启动脚本中添加相关参数生成gc日志 -verbose.gc开关可显示GC的操作内容.打开它,可以显示最忙和最空闲收集行为发生的时间.收集前后的内存大小.收集需要的时间等. 打开-xx:+ printGCdetails开关,可以详细了解GC中的变化. 打开-XX: + PrintGCTimeStamps开关,可以了解这些垃圾收集发…
日志分析工具ELK配置详解 一.ELK介绍 1.1 elasticsearch 1.1.1 elasticsearch介绍 ElasticSearch是一个基于Lucene的搜索服务器.它提供了一个分布式多用户能力的全文搜索引擎,基于RESTful web接口.Elasticsearch是用Java开发的,并作为Apache许可条款下的开放源码发布,是第二流行的企业搜索引擎.设计用于云计算中,能够达到实时搜索,稳定,可靠,快速,安装使用方便. 1.1.2 elasticsearch几个重要术语…
Web 流量分析工具多不胜数,从 WebTrends 这样专业而昂贵的,到 Google Analytics 这样强大而免费的,从需要在服务器端单独部署的,到可以从前端集成的,不一而足.本文收集并介绍了10个功能强大的开源 Web 流量分析工具,因为是开源的,因此可以免费部署到你的网站. TraceWatch TraceWatch 是一个开源 Web 流量分析程序,支持实时分析,可以提供深度分析报告. SlimStat 基于 PHP-MySQL,同时,可以像 Google Analytics 那…