ggplot2绘图系统--几何对象汇总 前面介绍了常见的几种基本的几何对象,并且介绍了scale.stat等其他要素.后续将介绍position.themes.coord和faceting等函数. 这里对ggplot2几何对象进行汇总. abline/area/bar/bin2d/boxplot/contour/crossbar/density/density2d/dotplot/errorbar/errorbarh/freqpoly/hex/histogram/hline/vline/jitt…

ggplot2绘图系统--扩展包ggrepel.ggsci.gganimate.ggpubr等 部分扩展包可在CRAN直接下载,有些需借助devtools包从Github下载. 1. ggrepel包 用来在图上添加文字和标签,相比geom_text和geom_label函数,能将重叠的标签分开,并添加指示短横线. library(ggrepel) ggplot(mtcars,aes(wt,mpg))+geom_point(color='red')+ geom_text_repel(aes(la…

ggplot2绘图系统--几何对象之条图(包括误差条图) 1.条图 格式: geom_bar(mapping = , data = , stat = 'count', #统计变换默认计数 position = 'stack', #默认堆栈 width = , #条形宽度 binwidth = , na.rm = FALSE, show.legend = , inherit.aes = TRUE) positon: dodge并排 fill堆叠填充标准化为1 stack堆栈 identity不做调…

ggplot2绘图系统--统计变换函数 在几何对象中以参数stat形式出现. 不同的几何对象对应不同的统计变换函数. 以直方图为例,几何对象geom_histogram(..., stat='bin')与stat_bin(.., stat='bar')的作用是一样的. 一般而言,我们不需要对数据进行额外的统计变换,使用默认的就好.但特殊情况时需要用到,如对数据进行log转换. 绘制QQ图 df <- data.frame(y=rt(200,df=5)) #随机生成t分布 ggplot(df,ae…

ggplot2绘图系统--几何对象之线图 曲线:点连线.路径曲线.时间序列曲线.模型拟合曲线...... 直线:水平直线.垂直直线.斜线. 1.曲线 对象及其参数. #路径图 geom_path(mapping = , data = , stat = 'identity', position = 'identity', lineend = 'butt', #线段两端样式,round/square linejoin = 'round', #线段交叉样式,mitre/bevel linemitre…

ggplot2绘图系统--几何对象之散点图 以geom开头的函数超过30个.几何对象和标度函数scale密不可分.只有在aes中传入某个变量,scale才能发挥作用. 所谓标度scale,就是图形遥控器,用于控制元素属性.相对于color/shape等参数而言,可以进行更多.更精确的设置. 颜色标度设置 颜色梯度(gradient)标度(scale)函数. #双色梯度函数 scale_color_gradient(...,high='#56B1F7',low='#132B43',...) sca…

ggplot2绘图系统--几何对象之直方图.密度图 1.直方图 参数. geom_histogram(mapping = , data = , stat = 'bin', #统计变换,概率密度为density position = 'stack', binwidth = , #条柱宽度 bins = , #条柱数目,默认30 na.rm = FALSE, show.legend = NA, inherit.aes = TRUE ) 示例. ggplot(diamonds,aes(carat))+…

ggplot2绘图系统--heatmap.geom_rect 这里不介绍更常见的pheatmap包. 1.heatmap函数 基础包. data=as.matrix(mtcars) #接受矩阵 heatmap(data) heatmap(data,scale = 'column') heatmap(data,scale = 'column', col=terrain.colors(256), Colv = NA, Rowv = NA) 2.geom_tile ggplot2 中,热图可看作若干个…

ggplot2绘图系统--几何对象之盒形图 参数: geom_boxplot(mapping = , #lower,middle,upper,x,ymax,ymin必须(有默认) #alpha/color/fill/linetype/shape/size/weight可选 data = , stat = 'boxplot', position = 'dodge', outlier.color = , #离群点颜色 outlier.shape = 19, outlier.size = 1.5, o…

张铁军,陈兴栋等 著 R语言基础绘图系统 基础绘图包之高级绘图函数--par函数 基础绘图包并非指单独某个包,而是由几个R包联合起来的一个联盟,比如graphics.grDevices等. 掌握par函数(作为20个主要统计图形函数之一)的主要参数.?par adj 微调图中字符位置.adj=c(x,y),相对左下角坐标点,一般不超过1. bg 绘图区域背景色.par(bg="green") bty 设置图形边框样式.包含o, l , 7, c, u, ]可选. bty <- c…