通俗理解:带有荧光标记的DNA探针可以用于检测活体内特定基因的表达情况,活体成像. 荧光原位杂交方法是一种物理图谱绘制方法,使用荧光素标记探针,以检测探针和分裂中期的染色体或分裂间期的染色质的杂交.荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)是在20世纪80年代末在放射性原位杂交技术的基础上发展起来的一种非放射性分子细胞遗传技术,以荧光标记取代同位素标记而形成的一种新的原位杂交方法. FISH(fluorescence in situ hybri…

single-molecule RNA fluorescence in situ hybridization (RNA smFISH) 单分子荧光原位杂交(smFISH)是一种新的基因表达分析方法,能报告转录本丰度和空间定位.但到目前为止,smFISH还不能实现基因组范围的分析.…

操作代码:https://satijalab.org/seurat/ 依赖的算法 CCA CANONICAL CORRELATION ANALYSIS | R DATA ANALYSIS EXAMPLES MNN The Mutual Nearest Neighbor Method in Functional Nonparametric Regression Comprehensive Integration of Single-Cell Data 实在是没想到,这篇seurat的V3里面的整合…

EGFR: “Epidermal growth factor receptor”,表皮生长因子受体.别名:ErbB1,或 HER1 EGFR是ErbB基因家族的成员之一.ErbB基因家族包括了:EGFR(ErbB1).HER2(ErbB2).ErbB3.ErbB4.其中,HER2又称为ErbB2. EGFR是肿瘤靶向治疗当中最重要的靶子.其突变,会在很大程度上影响到多种靶向治疗有效性. 位于chr7  短臂 ,蛋白分子量170KDa,跨膜蛋白 定位于细胞膜上,细胞膜外的部分,负责与各种配体相结合…

推荐关注微信公众号:AIPuFuBio,和使用免费生物信息学资源和工具AIPuFu:http://www.aipufu.com. [Circular RNA的产生机制] Circular RNA,缩写为circRNA,中文名为环状RNA,属于非编码RNA,是近年的一个重要研究热点. CircRNA主要是通过backsplicing的方式产生,明显不同于线性RNA(linear RNA)经典的5′–3′的模式.因此,circRNA不含有线性RNA的经典结构,如5′端加帽,3′端有poly A尾巴等…

导读: ALK融合是非小细胞肺癌的关键驱动机制之一,在NSCLC患者中发生的频率约为3-7%.针对ALK融合的抑制剂克唑替尼.色瑞替尼以及Alectinib在治疗ALK融合阳性的NSCLC患者中都取得了巨大成功,而ALK融合检测是靶向ALK治疗的前提. 1．传统ALK检测技术的特点及不足之处 目前对ALK融合的检出方法包括传统的荧光原位杂交(FISH),基于PCR扩增技术(RACE-PCR或RT-PCR联合测序技术.qRT-PCR等)和免疫组织化学法(IHC),这些传统方法各有其优缺点(表1).…

生物医学大数据 Methyl-SeqDNA的甲基化图谱 DNase I-Seq全基因组染色质DNA的开放程度.非基因编码区的调控元件的分布 DNase I高敏感位点:基因处于转录活性状态时,其染色质结构处于相对松散的状态,DNaseⅠ易于接触到染色体DNA,这个区域的DNA对DNase I敏感性就比无转录活性的区域高 eg:小鼠和human比对有同源性,OR gene family DNase I图谱技术 传统方法:Southern blot 细胞核提取--核酸酶提取---富集--识别 Sout…

目录:1.2.3.4 poct市场 荧光免疫技术(特点:灵敏性.可做仪器很小) 意义 国内外现状:万福.天宝 研究内容1.2.3. 一.意义与背景 二.内容(测量原理) 目标 三.仪器设计 1.基本测量原理 2.硬件设计(几个部分.框图) 3.软件设计 光学系统设计结构(不同方法比较选用激光的原因) 软件(驱动.应用层) 四.性能评价:目录 1.评价内容 2.评价方法 测量方法,有效数字位注意 哪几个评价指标 3.评价结果(是否符合,用表显示) 评价先看硬件(用电位计输入信号.用电机运动测稳定性…

常见camera测试卡     版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载. https://blog.csdn.net/luckywang1103/article/details/8716603 一.ISO12233 Camera Resolution ChartISO12233分辨率测试标板遵照ISO12233的标准“摄影-电子照相画面-衡量方法".这个测试标板在1 X 大小的这个活动区域,测量20 cm 高度只有约0.1毫米的误差.他具有几乎大部分解析度卡所具有的特征.是数码相机与…

解析LED发光效率 来源:--作者:--浏览:532时间:2016-08-10 14:18 关键词: 发光效率为评测光源效率的指标,用光源发出的光通量 (lm)与向光源输入的电力(W)之比表示.单位为lm/W.       最近,白色LED 的发光效率超过了100lm/W.作为有望继白炽灯和荧光灯之后成为新一代光源的白色LED,其发光效率能否达到与直管型荧光灯的综合效率相同的100lm/W备受关注.发光效率只表示光 发光效率为评测光源效率的指标,用光源发出的光通量 (lm)与向光源输入的电力(W…

发表时间:(2019年4月) 一. 概述: 本文报道了一种可研究人类大脑组织中特定神经细胞的蛋白质组学的方法.作者通过激光捕获显微切割技术(LCM)从逝者大脑中分离出目的神经元细胞,接着尝试了一系列不同的样品收集方法,裂解液和酶解方法,最终从10 um厚,60,000 um2大小的小脑分子切片中鉴定到了稳定重复的1500蛋白.用此方法,作者从分出的贝兹细胞(Betz)和浦肯野细胞(Purkinje)分别得到了高度特异表达的2800-3600个蛋白. 二. 研究背景: 蛋白质组学研究通常需要毫克级…

DNA拷贝数变异CNV检测——基础概念篇   一.CNV 简介 拷贝数异常(copy number variations, CNVs)是属于基因组结构变异(structural variation),根据大小可分为两个层次:显 微水平(microscopic)和亚显微水平(submicroscopic).显微水平 的基因组结构变异主要是指显微镜下可见的染色体畸变, 包括 整倍体或非整倍体.缺失.插入.倒位.易位.脆性位点等结构变 异.亚微水平的基因组结构变异是指 DNA 片 段 长 度 在 1K…

单细胞RNA测序技术之入门指南 [字体: 大 中 小 ] 时间:2018年09月12日 来源:生物通   编辑推荐: 在这个飞速发展的测序时代,DNA和RNA测序已经逐渐成为“实验室中的家常菜”.若要评选出目前最受欢迎的一道菜,那恐怕非单细胞RNA测序莫属. 在这个飞速发展的测序时代,DNA和RNA测序已经逐渐成为“实验室中的家常菜”.若要评选出目前最受欢迎的一道菜,那恐怕非单细胞RNA测序莫属. 以往,研究人员通常利用RNA测序(RNA-seq)来检测样本中的所有RNA转录本,以发现新型RNA…

生命组学 按照功能分类遗传物质,可能的分类有系统流.操作流.平衡流等等.下面是使用该理论解释DNA与RNA的关系: DNA和RNA有很大不同,DNA存储遗传信息,作为生命活动的最内核物质,如同操作系统内核一样,因而被称为系统流.依据中心法则得到的翻译得到RNA,RNA再翻译成蛋白质,蛋白质用于生命活动,所以RNA是随着生命活动不断转移和改变的,故被称为操作流.为了满足不同生命活动的需要,RNA变得比DNA灵活许多.但是DNA作为遗传物质的内核,必须保证一定的稳定性,否则生物形态就不可能在一段时间…

如何在转录水平分类所有RNA分子?可以罗列所有的可能性.技术策略和终极目标. 可能性:见纸 技术策略:RNA单细胞直测技术 终极目标:单细胞水平RNA直测技术决定新的人类RNA组和人类表观组学两个核心计划的启动 具体而言是建立细胞RNA组(实现免扩增和全部RNA的定量).建立单细胞RNA组(逾两百种人类细胞 )和人类细胞异质化RNA组(生理+病理状态)…

针对PacBio单分子测序——第三代测序技术的测序原理和读长     DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业.测序技术的应用也扩展到了生物.医学.制药.健康.农林.园艺.花卉.环保.法医等许多领域,并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业.据最新统计,2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿,按最近几年增长速度,预计2017年市场产值将加倍.因此可以说,基因测序在我国生物科技领域具有非常重要的战略意义.        “第三代测序技术”的…

qRT-PCR是指先由RNA进行反转录生成cDNA,然后以cDNA为模板进行检测,检测的是该cDNA的含量,而cDNA由特定的RNA逆转录而来,所以间接地检测了RNA的含量. 基因表达: 转录:DNA到RNA 翻译:RNA到氨基酸.蛋白 一般认为RNA, mRNA的量和最后的蛋白量一致「不考虑转录后调控」: 当然目前绝大数研究基因表达的都是qPCR和WB一起来. 基因表达水平一定意义上就是转录水平,转录出来的RNA经反转录成cDNA,荧光定量PCR时经多次复制扩增,使得其含量到达一定值, 所以复…

什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 随着ome为词尾的各种组学的出现,转录组学已经成为了人们了解生物信息的一个重要组成部分.人们使用了许多办法来掌握转录组的情况,主要分为两类,一类是基于杂交,一类是基于下一代测序技术(Next Generation Sequencing, NGS). 基于杂交的办法,主要是依靠印刷有荧光标记探针的基因芯片来实现.比如说基因组芯片,它高密度的集成了分辨率高达几bp~100bp的探针,通过与样品杂交荧光显色的…

解读生命密码的基本手段 ——DNA测序技术的前世今生 任鲁风  于军 (中国科学院基因组科学及信息重点实验室,北京基因组研究所) DNA(脱氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)是生命体的两种最基本组成物质,其序列的组成和变化造就了形形色色的生命世界.这两种承担了生命体遗传信息载体功能的物质,一方面在生命的不断繁衍中保持了各个物种的独特面目,另一方面又通过不断的演变改变着自身性状,同时又影响着与之相关的物种,这一规律在生命科学领域被归纳为“中心法则”.笼统而言,几乎全部的生命现象均来源于A.T.C.G…

    转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合.转录组研究能够从整体水 平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理,已广泛应 用于基础研究.临床诊断和药物研发等领域.基于 Illumina 高通量测序平台的转录组测序技术使 能够在单核苷酸水平对任意物种的整体转录活动进行检测,在分析转录本的结构和表达水平的同 时,还能发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点以及 cSNP(编码序列单核苷 酸多态性),提供最全面的转录组信息.相对于传统的芯片…

生物医疗大数据-DNA element functions and identification Genetic vs epigenetic GENETICS  遗传学 DNA Code: 64 triplets of nucleotides encode for 20 amino acids and 3 stop codons. EPIGENETICS  表观遗传学 RNA Code: Non-coding RNA, miRNA, Alternative Splicing CpG Code:…

Knockout允许您实现复杂的客户端交互性,但几乎所有Web应用程序还需要与服务器交换数据,或至少将本地存储的数据序列化. 最方便的交换或存储数据的方式是JSON格式 - 大多数Ajax应用程序今天使用的格式. 加载或保存数据 Knockout不强制您使用任何一种特殊技术来加载或保存数据. 您可以使用任何适合您所选择的服务器端技术的机制. 最常用的机制是jQuery的Ajax方法,例如getJSON,post和ajax. 您可以从服务器获取数据: $.getJSON("/some/url&qu…

参考:产品手册 PacBio三代全长转录组有什么优势? 近年来,随着高通量测序技术的发展,转录组测序已经成为研究基因表达调控的主要手段.但二代的转录本重构准确率很低,三代可以直接得到全长转录本,无需组装.可改善基因表达定量结果,发现新的基因和转录异构体,鉴定可变剪切及基因融合现象. Google第一个就是官网介绍,可以立马理解Iso-Seq的字面意思了. Iso-Seq 就是 isoform sequencing,中文就是同源异构体测序,其实也是一种 RNA 测序技术. The challeng…

缓存功能是大型网站设计一个很重要的部分.由数据库驱动的Web应用程序,如果需要改善其性能,最好的方法是使用缓存功能.可能的情况下尽量使用缓存,从内存中返回数据的速度始终比去数据库查的速度快,因而可以大大提供应用程序的性能.毕竟现在内存非常便宜,用空间换取时间效率应该是非常划算的.尤其是对耗时比较长的.需要建立网络链接的数据库查询操作等. 对于web页面的缓存,WebForm与ASP.NET MVC有不同的语法.在WebForm中, <%@ OutputCache Duration="60&…

(1).资讯 1.React Native 0.22_rc版本发布 添加了热自动重载功能 (2).技术文章 1.用 React Native 设计的第一个 iOS 应用 我们想为用户设计一款移动端的应用,却不知从何下手,我们只知道每一个人都希望做一款又酷又好玩儿体验又十分顺滑的应用,然而团队里没人有移动端的经验.于是,我们最终只好选择React Native作为我们的开发工具.结果证明,这是一个非常明智的选择,我们从开始到现在的所思所感. 2.使用 ListView 组件实现类似iPhone通讯…

1.简述 AOI技术在许多不同的制造业领域使用,自从电子影像技术开始发展,就被各种人利用在不同的应用领域.大家最熟悉的数字相机.数字摄影机是大家生活中最常用到的器材之一,而工业产品的生产也大量使用这些技术,所不同的是AOI系统除了影像产生之外,还多了比对.判断等等额外功能. 电子工业加速朝向于更小.更密.更快的先进构装发展,早期依赖人工检查产品的作法已经无法符合需求.业者大量引用AOI技术辅助生产工作,已经成为必然的趋势,如:电子组装使用进行锡膏印刷.漏件检查.接点状况判断等等工作就是大家耳熟能…

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本篇作为技术分享系列的第四篇,详细讲一下手绘视频中 Surface Pen 和 Surface Dial 的使用场景. 先放一张微软官方商城的图,Surface 的使用中结合了 Surface Pen 和 Surface Dial. Surface Pen 的使用场景不难想象,就像 iPad 和 Android Pad 配置的笔一样,Surface Pen 也在书写.书画和日常操作中发挥着很重要的作用.微软的 Surface Pro 和 Surface Book 系列中都重点强调了 Surfac…

纳米孔测序技术(又称第四代测序技术)是最近几年兴起的新一代测序技术.目前测序长度可以达到150kb.这项技术开始于90年代,经历了三个主要的技术革新:一.单分子DNA从纳米孔通过:二.纳米孔上的酶对于测序分子在单核苷酸精度的控制:三.单核苷酸的测序精度控制.目前市场上广泛接受的纳米孔测序平台是Oxford Nanopore Technologies(ONT)公司的MinION纳米孔测序仪.它的特点是单分子测序,测序读长长(超过150kb),测序速度快,测序数据实时监控,机器方便携带等.这篇综述重…

RNA测序的质量控制 发表评论 3,112 A+ 所属分类:Transcriptomics   收  藏 ENCODE项目向我们揭示,人类基因组中超过70%能得到转录,只不过不会发生在同一个细胞里.为了研究如此多样的转录本,研究人员开发了许多技术,其中RNA测序(RNA-seq)是最全面也最有效的. 许多人相信,未来基因组数据将会对患者的治疗产生重要的影响.不过也有不少专家质疑基因组分析的准确性和可靠性.为此,美国FDA牵头了RNA测序质量控制(SEQC)项目,评估了多个试验室RNA-seq数据…