转自:https://wenku.baidu.com/view/8d6a95d20d22590102020740be1e650e52eacf2a.html 输出包含3个文件:转录组的组装.gtf      转录本表达水平.fpkm_tracking      基因表达水平.fpkm_tracking 1.转录组的组装.gtf   ——transcripts.gtf 转自:http://yangl.net/2016/06/03/cufflinks/ 1.chrX来源染色体名称 2.来源,产生此文件…

非原创 参考资料: 一文掌握GO和pathway分析 - 生物信息学讨论版 -丁香园论坛http://www.dxy.cn/bbs/thread/34904124#34904124 GO富集 GO是Gene ontology的缩写,GO数据库分别从功能.参与的生物途径及细胞中的定位对基因产物进行了标准化描述,即对基因产物进行简单注释,通过GO富集分析可以粗略了解差异基因富集在哪些生物学功能.途径或者细胞定位. Pathway Pathway指代谢通路,对差异基因进行pathway分析,可以了解实…

本文首发于“生信补给站”公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/ZEjaxDifNATeV8fO4krOIQ更多关于R语言,ggplot2绘图,生信分析的内容,敬请关注小号. 为了能更方便的查看,检索,对文章进行了精心的整理.建议收藏,各取所需,当前没用也许以后就用到了呢! 一 R资料+计划 R语言精品资料年中无套路赠送 R-plotly|交互式甘特图(Gantt chart)-项目管理/学习计划 二 Bioinfo R|fastqcr QC数据处理 :测序结果的数据质控及…

转自:http://blog.csdn.net/lifuxiangcaohui/article/details/37992725 最近因项目存在内存泄漏,故进行大规模的JVM性能调优 , 现把经验做一记录. 一.JVM内存模型及垃圾收集算法 1.根据Java虚拟机规范,JVM将内存划分为: New(年轻代) Tenured(年老代) 永久代(Perm) 其中New和Tenured属于堆内存,堆内存会从JVM启动参数(-Xmx:3G)指定的内存中分配,Perm不属于堆内存,有虚拟机直接分配,但可以…

loadrunner脚本中写入脚本输出log到外部文件,分析参数取值方式 分类: 心得 loadrunner 我的测试 2012-04-01 12:52 2340人阅读 评论(0) 收藏 举报 脚本loadrunnerstreamfilestring测试 .controller中运行脚本时无法查看输出log,可以手动写入代码输出log到外部文件,通过查看该log获得相关信息: 以下脚本是为了分析场景中多用户运行时参数列表如何取值(id,groupid,sid,uname),设置集合点后通过查看时…

使用NCBI进行目的基因的引物设计 全文概述 利用生信工具进行目的基因的引物设计,使用了NCBI进行筛选与设计引物,使用 idtdna对筛选出的DNA进行检查.本文分享了如何筛选出高质量的基因引物,帮助想通过生信进行引物设计的学生.从业者找出合适的基因,毕竟购买引物也比较烧钱,避免设计出的基因质量偏低. NCBI查找基因 1.查询目的基因:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=zbed3 备注:这里需要注意的是,要找到合适的目的基因!如果找智人,一…

一.背景 今天下午,正酣畅淋漓的搬砖,突然运维同事在群里通知,核心服务某个节点内存异常,服务假死.神经一下子紧张起来,赶紧跑到运维那边观察现象. 观察的结果是服务内存溢出,该服务是核心服务,分配了5G内存.运维在转存快照后,立刻重启服务后正常.在接下来的一段时间里,另一台服务节点也发生了同样的情况. 二.分析过程 这个服务是另外一个同事负责开发的,本着学习的态度,在拿到运维转存的dump文件后,就准备尝试着分析下问题,由于之前没有类似的经历,于是先在网上查了下一般怎么分析类似的问题. 首先尝试使…

linux实践之ELF文件分析 下面开始elf文件的分析. 我们首先编写一个简单的C代码. 编译链接生成可执行文件. 首先,查看scn15elf.o文件的详细信息. 以16进制形式查看scn15elf.o文件. 查看scn15elf.o中各个段和符号表的信息. 各个段的详细信息如下. 符号表的信息如下: 使用readelf命令查看各个段的详细信息: 段表信息如下: 符号表信息如下: 下面让我们开始分析文件头吧! 由于我的虚拟机是32位的,我下面就主要以32位的系统进行分析,就不比较32位机和64…

WinDbg使用有点麻烦,还要符号表什么的.试了下,感觉显示很乱,分析的也不够全面... 试试其他的吧!今天电脑蓝屏了,就使用其dump文件测试,如下: 1.首先,最详细的,要属Osr Online这个在线分析网站了: 打开其分析地址:http://www.osronline.com/page.cfm?name=analyze 下拉,找到上传按钮(上图),将需要分析的dump文件浏览上传即可...dump文件一般在C:\Windows\minidump下 分析完成后生成的内容非常多: 主要看第一…

一.文件分析流程 1.第一部分:Section Cross References 主要是各个源文件生成的模块之间相互引用的关系. stm32f10x.o(STACK) refers (Special) to stkheap2.o(.text) for __use_two_region_memory 比如上面这句话,stm32f10x.o是stm32f10x.s生成的目标文件模块,(STACK)是文件内定义的一个段,链接器把它视为一个Section,输入节.它引用了模块stkheap2.o输入节(…