上周20161021-20161028的任务还没有搞完,所以今天来填坑(微笑脸) ××××××××××××××××××××我是萌萌哒分割线××××××××××××××××××××××××××××××× 本文参考:https://bitbucket.org/biobakery/biobakery/wiki/metaphlan2 MetaPhlAn2是使用宏基因组鸟枪法测序数据描绘微生物群落组成的工具. ps: 与系统发育相关的图的表示 安装: 1. 下载并解压 2. 修改/etc/profile,…

先挖坑 因为这个软件需要memory>16G,所以应该要安装在服务器上…

好吧,这是本周(2016.10.21-28)的学习任务之一:安装bowtie2并学习其使用方法&参数设置 所以,啃文档咯,官方文档Version 2.2.9 http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/manual.shtml 以下是我的整理.我不生产文档,我只是文档的搬运工么么哒- Bowtie2适合将长度50-1000bp的reads比对到长的参考序列上.Bowtie 2 indexes the genome with an FM Index (bas…

主要参考http://www.3fwork.com/b211/000091MYM021616/ Step 1 : sudo gedit /etc/apt/sources.list 添加到末尾 deb http://mirrors.xmu.edu.cn/CRAN/bin/linux/ubuntu xenial/ 保存退出 Step 2: 下载公钥并更新 sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys 51716619E08…

装完Bowtie2,官方文档给出的栗子说可以玩一玩samtools,所以我入个坑 参考这篇http://m.010lm.com/roll/2016/0620/2343389.html Step 1: 安装libncurses5库(貌似和字符多色显示有关?生信人会玩=.=) sudo apt-get install libncurses5 libncurses5-dev Step 2: 安装zlib(压缩与解压,有教程说不装会报错=.=) sudo apt-get install zlib1g-d…

其实好多东西装过好多次,然而每次都要翻文档,经常掉进前面掉进过的坑...所以这里重新写一份指南,以防下次再装又忘了(魂淡我并不想再装了啊不要立flag) 1. 安装biopython 1.1 因为biopython目前支持的是python2,所以我先把python调到2 1.2 安装numpy (http://www.numpy.org/) NumPy is the fundamental package for scientific computing with Python. It cont…

环境:RHEL 6.4 + Oracle 11.2.0.4 需求:单机静默安装GI软件并创建ASM实例和ASM磁盘组,为后续迁移数据库文件到ASM做准备 1. 安装配置GI软件 2. 创建ASM实例 3. 创建ASM磁盘组DATA1 1. 安装配置GI软件 1.1 创建grid用户和相关组,创建目录,确认ASM磁盘权限,配置环境变量 -- 创建grid用户和相关组 groupadd asmadmin groupadd asmdba groupadd asmoper useradd -g oins…

我们都知道安装软件最简单的方法是apt-get install,但是卸载就不常用了,如何卸载呢?1.sudo apt-get remove xxxxxsudo apt-get autoremove2.对于用命令sudo aptitude install xxx安装的软件可以用sudo aptitude remove xxx卸载即可. 补充一点使用方法:一是从命令行启动 kchmviewer 二是让chm文件自动关联,这个在chm文件右键里选择一下就可以了.选择的名字是 kchmviewer.其实…

        Linux 中如何卸载已安装的软件. Linux软件的安装和卸载一直是困扰许多新用户的难题.在Windows中,我们可以使用软件自带的安装卸载程序或在控制面板中的“添加/删除程序”来实现.与其相类似,在Linux下有一个功能强大的软件安装卸载工具,名为RPM.它可以用来建立.安装.查询.更新.卸载软件.该工具是在命令行下使用的.在Shell的提示符后输入rpm,就可获得该命令的帮助信息. 软件的安装 Linux下软件的安装主要有两种不同的形式.第一种安装文件名为xxx.tar.g…

安装ubuntu 老毛桃进入win pe修复启动项 在win pe下面制作ubuntu的安装盘,只用的软件是ultraISO 参考博客下面的分区的那篇文章  http://jingyan.baidu.com/article/60ccbceb18624464cab197ea.html 此时win pe的启动盘成为了ubuntu的启动盘 在安装ubuntu的时候,原来装有win7的硬盘的格式是ntfs,就不要动那些盘了 其他的参考分区下面安装ubuntu的那个链接 安装ubuntu后要安装的软件,解…