实验设计中,一般会做三个生物学重复来确保结果的准确性,尤其在下游分析中.但有时会遇到没有生物学重复,而又需要进行差异分析的情况,这时一般建议考虑foldchange即可,因为根本无法进行T-test等统计学方法嘛.但是如果必须要算一个P值(个人觉得没啥必要...),那么不同组学有各自处理的方法(虽然并不是靠谱),比如NGS的转录组的一些软件会预估一个离散度做校正,而质谱的蛋白组则是用Significance A/B算法,这篇文章主要讲下Significance A/B是怎么来的 一般在网上搜Si…

题目原意很简单,就是解一个三元一次方程组 直接高斯消元解方程组,枚举最后一列的倍数(k) 注意double的精度,有很多细节需要处理 /* PROB:ratios LANG:C++ */ #include <stdio.h> #include <math.h> #include <algorithm> #include <iostream> using namespace std; #define maxn 5 ][],a[][]; typedef doub…

P2729 饲料调配 Feed Ratios 36通过 103提交 题目提供者该用户不存在 标签USACO 难度普及/提高- 提交  讨论  题解 最新讨论 暂时没有讨论 题目背景 农夫约翰从来只用调配得最好的饲料来喂他的奶牛.饲料用三种原料调配成:大麦,燕麦和小麦.他知道自己的饲料精确的配比,在市场上是买不到这样的饲料的.他只好购买其他三种混合饲料(同样都由三种麦子组成),然后将它们混合,来调配他的完美饲料. 题目描述 给出三组整数,表示 大麦:燕麦:小麦 的比例,找出用这三种饲料调配 x:y…

直接暴力搜 /* ID: yingzho1 LANG: C++ TASK: ratios */ #include <iostream> #include <fstream> #include <string> #include <map> #include <vector> #include <set> #include <algorithm> #include <stdio.h> #include <q…

直接枚举到100水过 /* ID: shangca2 LANG: C++ TASK: ratios */ #include <iostream> #include<cstdio> #include<cstring> #include<algorithm> #include<stdlib.h> using namespace std; #define INF 0xfffffff ][]; int main() { freopen("rat…

最早关注蛋白质互作网络,是在来GDMC第一年的时候,中间停了半年看互作-各种算法,网络分析停滞不前,没想到搞到最后,还是和网络碰到了一起,我总是会潜意识走近给自己第一印象不错的object,包括人.用PPI来做证据,当然要选择证据性最强的网站,先列表如下:1. DIP (database of interacting proteins)    http://dip.doe-mbi.ucla.edu/dip/Main.cgi 在页面点击   Search by:[protein] [sequenc…

参考:Add P-values and Significance Levels toggplots 多组比较,挑选感兴趣的显示显著性. data("ToothGrowth") head(ToothGrowth) library(ggpubr) my_comparisons <- list( c("0.5", "1"), c("1", "2"), c("0.5", "2&q…

Section 1: Preparing the PDB file 1EMA是本次教程所用的pdb,可以在PDB数据库下载. pdb4amber -i 1EMA.pdb -o gfp.pdb --dry --reduce pdb4amber命令用于amber输入pdb格式文件的准备. --dry会删除晶体结构中的水分子(WATER),--reduce会对pdb加氢(H).命令执行完成后需要对产生的gfp.pdb进行手工微调,1) 需要把文件中所有MSE更换为MET:2) 把所有SE 原子(Se)…

3.The significance of Books 书本的意义 (1)A bookless life is an imcomplete life.Books influence the depth and breadth of life.They meet the natural desire for freedom,for expression,for creativity and beauty of life.Learners,therefore,must have books,and…

1.Alpha Level (Significance Level,显著水平): What is it? 显著性水平α是指当零假设是正确的,但做出了错误决策的概率(即一类错误的概率).Alpha水平(有时称为“显著性水平”)用于假设测试.通常,这些测试的alpha值为0.05(5%),但是其他常用的值是0.01和0.10. The significance level α is the probability of making the wrong decision when the null…