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ggplot2|玩转Manhattan图-你有被要求这么画吗？

本文首发于“生信补给站”,ggplot2|玩转Manhattan图-你有被要求这么画吗?更多关于R语言,ggplot2绘图,生信分析的内容,敬请关注小号. Manhattan图算是GWAS分析的标配图了,可参考Bio|manhattan图 进行绘制. 由于Manhattan点太多,后期AI/PS修改的话难度有点大,如果可以“个性化”绘制的话那是极好的! 一 载入R包,数据 1)载入数据处理的tidyverse包,使用qqman中gwasResults示例数据集 #载入R包#install.pac…

ggplot2在一幅图上画两条曲线

ggplot2在一幅图上画两条曲线 print(data)后的结果是 C BROWN.P MI.P 0 0.9216 0.9282 30 0.9240 0.9282 100 0.9255 0.9282 现想要在一张图中画两条曲线.横轴为C,纵轴分别为BROWN.P和MI.P,如何做? 其实很简单 p1<-ggplot(brown.results, aes(x=C)) + geom_point(aes(y=BROWN.P), ) + geom_line(aes(y=BROWN.P, , color…

初探ggplot2 geom__制作面积图

    大家大概都对如下信息图并不陌生,该图用100%堆积面积图的方式来表现不同时期不同国家人数所占的比例.这是一种很有意思的表达方式,而面积图也是很常用的数据图表,现在让我们一起来看看如何在R里用ggplot2和plot.area来制作一个面积图.                   在制作图表之前,首先我们先创建一些随机示例数据.R代码如下:   # 创建随机数 set.seed(3) # 创建时间序列(0-20的time step) t.step<-seq(0,20) # 创建十组变量名(…

ggplot2绘制Excel所有图

出处:https://brucezhaor.github.io/blog/2016/06/13/excel2ggplot/#%E5%89%8D%E8%A8%80 目录 前言 1.用到的包 2.数据准备 3.数据转换 柱形图 1.簇状柱形图 2.堆积柱形图 3.百分比堆积柱形图 4.三维簇状柱形图 5. 三维堆积柱形图 6.三维百分比堆积柱形图 7.三维柱形图——用分面替代 折线图 1.折线图 2.堆积折线图 3.百分比堆积折线图 4.带标记的折线图 5.带标记的堆积折线图 6.带标记的百分比堆积…

回忆那些年我玩过的ide,看看哪些你也玩过,看图回忆

闲来无聊,回忆一下这些年玩过的ide.看看哪些你也玩过. QBasic 第一个ide,兴奋程度也是最大的,从此进入了码农行列 VisualBasic 可以拖界面了,成就感爆棚 Turbo C c语言,真正开始写了写代码 C-Free 有界面的ied,终于摆脱了黑窗口 Visual C++ 6.0 开始进入windows编程,进入工作状态了 Visual Studio 2002 工作需要 Visual Studio 2005 工作需要 Visual Studio 2008 工作需要 Visual…

java图形化界面-------鼠标监听画圆----------使用匿名类

package com.aa; import java.awt.Color; import java.awt.Graphics; import java.awt.event.MouseAdapter; import java.awt.event.MouseEvent; //内部类,和接口的实现 import javax.swing.*; //现在实现用鼠标点击一下,画一个圆 class Circle extends JFrame { int x, y; public Circle() { ini…

R绘图 第六篇：绘制线图（ggplot2）

线图是由折线构成的图形,线图是把散点从左向右用直线连接起来而构成的图形,在以时间序列为x轴的线图中,可以看到数据增长的趋势. geom_line(mapping = NULL, data = NULL, stat = "identity", position = "identity", na.rm = FALSE, show.legend = NA, inherit.aes = TRUE, ...) 线图中的常用参数: group:线的分组 alpha:线的透明度…

R语言与医学统计图形-【17】ggplot2几何对象之热图

ggplot2绘图系统--heatmap.geom_rect 这里不介绍更常见的pheatmap包. 1.heatmap函数 基础包. data=as.matrix(mtcars) #接受矩阵 heatmap(data) heatmap(data,scale = 'column') heatmap(data,scale = 'column', col=terrain.colors(256), Colv = NA, Rowv = NA) 2.geom_tile ggplot2 中,热图可看作若干个…

玩转html5（二）----用canvas结合脚本在画布上画简单的图（html5又一强大功能）

在html5中可以使用canvas标签在画布上画图,先直接上代码,这篇文章先简单介绍一下canvas的使用方法,简单画几个圆,矩形,三角形,写字. 在代码中均给出了注释,在这里特别强调的一点是:使用canvas画图时有时候必须beginPath和colsePath,但有时不需要,为了防止出现问题,可以在每次重新画一个图时重新开启路径,画完后关闭路径. 这些代码是在猎豹浏览器上实现的,有些浏览器可能不支持. <!DOCTYPE html> <meta charset="utf-8…

R语言：ggplot2精细化绘图——以实用商业化图表绘图为例

本文版权归http://www.cnblogs.com/weibaar 本文旨在介绍R语言中ggplot2包的一些精细化操作,主要适用于对R画图有一定了解,需要更精细化作图的人,尤其是那些刚从excel转ggplot2的各位,有比较频繁的作图需求的人.不讨论那些样式非常酷炫的图表,以实用的商业化图表为主.包括以下结构: 1.画图前的准备:自定义ggplot2格式刷 2.画图前的准备:数据塑形利器dplyr / tidyr介绍 3.常用的商业用图: 1)简单柱形图+文本(单一变量) 2)分面柱形图…