Gromacs的命令非常多,下面我将我最近用到的先总结一下.标题上也写了这只是Chapter1,以后有新的会继续写Chapter2...等等. 下面这个网址http://manual.gromacs.org/programs/byname.html将所有的Gromacs命令按字母表顺序排列了出来,是官方文档.我的文章中部分可能取自这里,或者来自翻译文档的内容. pdb2gmx pdb2gmx是一个常用命令.遗憾的是我在网上没有找到专门介绍这个命令的文章,不过我还是觉得为Gromacs命令专门写一…

Gromacs的文件非常的多,这是官方文档地址:http://manual.gromacs.org/online/files.html. 本文章部分内容来自以下网址https://zhuanlan.zhihu.com/p/27279508 下面我仅做一简述,涉及到PDB,GRO,MDP的文件内部结构不在此介绍,而是单独开篇. 参数文件: mdp:其他篇单独讲解 m2p:暂时没用到 结构文件: gro:GROmacs format g96:gromacs-96 format pdb:Protein…

网络对抗技术课程学习 chapter1 渗透测试与metasploit 一.读书笔记 二.渗透测试 通过模拟恶意攻击者的技术与方法进行攻击,挫败目标系统安全控制措施,取得访问控制权,并发现具备业务影响后果安全隐患的一种安全测试与评估方式. 操作:对目标系统进行主动探测分析,对大量发现安全漏洞的主动渗透与入侵攻击. 目标:发现潜在的系统漏洞. 1. 基本类型 渗透测试的两种基本类型: - 黑盒测试 - 白盒测试 (1)黑盒测试 模拟对目标系统一无所知的攻击者所进行的渗透攻击. 真实:从一个远程网络…

In the previous lab,you created a service and client from scratch without leveraging the tools available to WCF developers. Although this helps you to understand the raw requirements for sending messages between clients and services,in reality,develo…

安装gitbook命令 前提:已经安装nodejs npm install -g gitbook-cli 查看版本号 gitbook -V gitbook命令 gitbook -h Usage: gitbook [options] [command] Commands: ls List versions installed locally current Display currently activated version ls-remote List remote versions avai…

Gromacs分子动力学模拟主要可以分为以下几个步骤,不同的体系步骤可能略有不同. 在开始之前,先简单了解一下预平衡: 分子动力学模拟的最终目的是对体系进行抽样,然后计算体系的能量,各种化学键,成分分析等等.打个比方说,我们有一个蛋白质,我们想将它放入一种溶液中(可能是水,也可能不是),然后看看这个体系的能量如何变化,蛋白质的化学键,与水分子形成的氢键等等信息,那么我们需要将蛋白质放入溶液中,映射到现实中就是讲溶剂放入溶剂中,然后等体系稳定后,观察其性质. 在MD中,这一过程不向现实中一样是自然…

cmder cmder是一个增强型命令行工具,不仅可以使用windows下的所有命令,更爽的是可以使用linux的命令,shell命令. 安装包 安装包链接 下载后,直接解压即用. 修改命令提示符λ为$ 进入解压后的cmder的目录,进入vendor,打开init.bat文件. 修改第15行的代码 @prompt $E[1;32;40m$P$S{git}{hg}$S$_$E[1;30;40m{lamb}$S$E[0m 改为: @prompt $E[1;32;40m$P$S{git}{hg}$S$…

 下面所列的是常见的参数(选项)义: --help,-h                              显示帮助信息 --version,-V                       显示版本信息 -v                                              繁琐模式(显示命令完整的执行过程) -i                                               交谈模式(指定界面) -l               …

2016年6月27日.NET Core & ASP.NET Core 1.0在Redhat峰会上正式发布,社区里涌现了很多文章,我也计划写个系列文章,原因是.NET Core的入门门槛相当高,很有必要写个深入浅出的系列文章,本节内容帮助你入门.我将可能用Windows做开发环境,也可能用Linux/Mac,但是所有的dotnet CLI命令都是跨平台的,我们在windows/Linux/mac平台上开发跨平台的应用. 安装.NET Core .NET Core 包括.NET Core Runti…

MVVM模式解析和在WPF中的实现(三) 命令绑定 系列目录: MVVM模式解析和在WPF中的实现(一)MVVM模式简介 MVVM模式解析和在WPF中的实现(二)数据绑定 MVVM模式解析和在WPF中的实现(三)命令绑定 MVVM模式解析和在WPF中的实现(四)事件绑定 MVVM模式解析和在WPF中的实现(五)View和ViewModel的通信 MVVM模式解析和在WPF中的实现(六)用依赖注入的方式配置ViewModel并注册消息 0x00 命令绑定要达到的效果 命令绑定要关注的核心就是两个方…