根据一个打分系统,怎么样排对起来打分能够最大.就认为历史上应该是这样子的. 数据同源搜索软件Fasta和Blast 是目前功能最全,使用最广的同源性数据库搜索软件包.他们在Needleman的动态算法的基础上做了很多技术上的改进,如采用启发式算法.使得在精确度牺牲较小的情况下,速度快了很多.   FASTA.是1985年提出的一个全局联配算法. BLAST.是1990年提出的.最初被设计用于序列局部比对. BLAST更适合于protein序列比较,FASTA更适用于DNA序列比较.…

我生信入门,老师就要求我学好blast比对,说得也确实是很有道理,是个人都知道比对是最基本的东西,现在再想想那老师的建议,也只能呵呵一笑. 北大生物信息公开课有一章专门讲得序列数据库搜索,可以好好看看,快速入门. 序列数据库搜索 BLAST算法 Basic Local Alignment Search Tool BLAST使用…

1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索引而进行全表扫描, Sql 代码 : select id from t where num is null; 可以在 num 上设置默认值 0,确保表中 num 列没有 null 值,然后这样查询: Sql 代码 : select id from t where num=0; 3.应尽量避免在 wh…

优化数据库的方法: 1.关键字段建立索引. 2.使用存储过程,它使SQL变得更加灵活和高效. 3.备份数据库和清除垃圾数据. 4.SQL语句语法的优化.(可以用Sybase的SQL Expert,可惜我没找到unexpired的序列号) 5.清理删除日志. SQL语句优化的原则: ◆1.使用索引来更快地遍历表 缺省情况下建立的索引是非群集索引,但有时它并不是最佳的.在非群集索引下,数据在物理上随机存放在数据页上.合理的索引设计要建立在对各种查询的分析和 预测上.一般来说:①.有大量重复值.且经常…

1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索引而进行全表扫描, Sql 代码 : select id from t where num is null; 可以在 num 上设置默认值 0,确保表中 num 列没有 null 值,然后这样查询: Sql 代码 : select id from t where num=0; 3.应尽量避免在 wh…

1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索引而进行全表扫描, Sql 代码 : select id from t where num is null; 可以在 num 上设置默认值 0,确保表中 num 列没有 null 值,然后这样查询: Sql 代码 : select id from t where num=0; 3.应尽量避免在 wh…

今天看了一下asp.net连接oracle数据库的方法,得到了如下代码.这段代码打开了MyTable表,并把操作员的名字列出.字段类型是OracleString.读取的时候用的是字段编号,我不知道怎么使用字段名来读取某字段的内容. 下面是代码://首先添加两条引用using System.Data.OracleClient;using System.Data; //在窗体上添加一个按钮,叫Button1,双击Button1,输入以下代码private void Button1_Click(obj…

一个防止误删MSSQL数据库的方法 环境:Windows2008 R2 .SQL 2012 今天发现一个有趣的现象,之前数据库服务器的其中几个数据库做过镜像,不过现在已经删除了,今天又要在那台服务器上为一个库搭建镜像 搭建镜像的过程中,把镜像机器的ip写成了自己的ip,结果发现命令成功执行 --备机上执行 USE [master] GO ALTER DATABASE [CT_DB] SET PARTNER = 'TCP://192.168.1.106:5022'; --主机服务器的ip 192.…

当你接手某个mysql数据库管理时,首先你需要查看维护的mysql数据库版本:当开发人员问你mysql数据库版本时,而恰好你又遗忘了,那么此时也需要去查看mysql数据库的版本...............下文总结一下Linux平台下查看mysql数据库的方法.个人觉得总结的比较全面了. 方法1:登录数据库时,你可以看到对应mysql数据库的版本信息,如下所示: [root@DB-Server ~]# mysql -u root -p Enter password: Welcome to the…

在测试服务器上使用shutdown immediate命令关闭数据库时,长时间无法关闭数据库,如下所示 1: [oracle@DB-Server admin]$ sqlplus / as sysdba 2:  3: SQL*Plus: Release 10.2.0.4.0 - Production on Thu Nov 21 13:55:13 2013 4:  5: Copyright (c) 1982, 2007, Oracle. All Rights Reserved. 6:  7:  8:…