awk 筛选特定长度的序列】的更多相关文章

awk '/^>/ {printf("\n%s\t",$0);next;} {printf("%s",$0);} END {printf("\n");}' < assembly.fasta | egrep -v '^$' | tr "\t" "\n" | awk '!/^>/ { next } { getline seq } length(seq) > 200 { print $0…
输入 input.txt ATTCGATTATAAGCTCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATCGATC ATTCGATTATAAGCACTGATCGATCGATCGATCGATCGATGCTATCGTCGT ATTCGATTATAAGCATCGATCACGATCTATCGTACGTATGCATATCGATATCGATCGTAGTC ATTCGATTATAAGCACTATCGATGATCTAGCTACGATCGTAGCTGTA ATTCGATTATAAGCACT…
strncmp函数用于比较特定长度的字符串. 头文件:string.h. 语法  int strncmp(const char *string1, const char *string2, size_t count); strncmp函数的语法参数说明如表2.4所示. 表2.4  参数说明 参    数描    述string1 给定的字符串string2 给定的字符串count 要进行比较的长度 返回值:当string1大于string2时,返回1:等于时,返回0:小于时,返回-1. 示例 …
原文地址:http://blog.sina.com.cn/s/blog_d38f8be50102wczk.html 函数原型: tuple_gen_const(: : Length, Const : Newtuple) 函数作用: 生成特定长度的元组及初始化元素,参数Length为新元组的元素个数,如果输入Length是浮点型,只取其整数部分. 新元组生成的个数及值是由输入参数Const决定的,Const只由一个元素组成.元组中所有的元素的数据类型和值同于参数Const. 参数列表: Lengt…
企业Shell面试题8:筛选符合长度的单词案例 利用bash for循环打印下面这句话中字母数不大于6的单词(某企业面试真题). I am oldboy teacher welcome to oldboy trainingclass 解答: [root@jenkins scripts]# sh danci.sh I am to [root@jenkins scripts]# cat danci.sh #!/bin/bash ####################################…
Application.StartupPath获取执行文件路径substring()取特定长度字符串取得根目录 2012-07-20 10:48 257人阅读 评论(0) 收藏 举报 path using System.Windows.Forms; 控制台程序添加System.Windows.Forms; 因为是控制台应用程序,还要去添加引用 //获取了应用程序路径,不包括可执行文件名称. string path1 = Application.StartupPath; Console.Write…
#在某个目录下,由于有些是缓存文件,它们的共同点就是长度大于3, 找到它们,然后用rm 命令删除#ls abc.pyabcd.py.... #ls | awk 'length($1) > 3 {print $1} ' | xargs rm…
回到: Linux系列文章 Shell系列文章 Awk系列文章 awk数据筛选示例 筛选行 # 1.根据行号筛选 awk 'NR==2' a.txt # 筛选出第二行 awk 'NR>=2' a.txt # 输出第2行和之后的行 # 2.根据正则表达式筛选整行 awk '/qq.com/' a.txt # 输出带有qq.com的行 awk '$0 ~ /qq.com/' a.txt # 等价于上面命令 awk '/^[^@]+$/' a.txt # 输出不包含@符号的行 awk '!/@/' a…
# C:\Users\lenovo\Desktop\总结\Python # 读取 Excel 文件并进行筛选 import pandas as pd # 设置列对齐 pd.set_option("display.unicode.ambiguous_as_wide",True) pd.set_option("display.unicode.east_asian_width",True) # 读取工号姓名时段交易额,使用默认索引 dataframe = pd.read_…
len() 求序列的长度 print(len("beimenchuixue")) print(len([1, 2, 3])) __len__ 对象中实现这个方法,则 len() 方法调用对象中 __len__方法 class BeiMenChuiXue: def __init__(self, name): self.name = name def __len__(self): return len(self.name) if __name__ == '__main__': name =…
最近搞数据库,为了把图片文件的信息导入数据库表中,我开始研究python列出图片文件,其中发现因为IE临时文件里有非常多的不需要的图片,就需要筛选掉一些文件. 最终用python输出了所有需要的图片文件的路径.文件名.时间到一个txt import os import time def IsObjfile( path , filename , suffix , shield ): #判断文件是否以suffix中的串结尾以及是否有不需要的文件路径 flag1 = False for tmp in…
(图片有点大,可右键新tab查看) User模型 class User extends Model { public function profile() { return $this->hasMany(UserProfile::class); } } 使用with查询某个user及其的profile User::with(['profile' => function($query) { $query->select(['id']); }])->find(4)->toArra…
PHP中,md5().uniqid()函数可以返回32位和13位不重复的字符串,但是这些字符串都可能包含有数字.如果需要纯字母的字符串,而且长度不定,比如8位,那么直接用这两个函数无法达到效果. 这时可以考虑从ASCII码加mt_rand()函数的角度考虑,因为A~Z的ASCII码是65~90,a~z的ASCII码是97~122,所以程序可以这么写: // 生成纯字母字符串函数 function rand_string($length = 8) { $randstr = ""; for…
在一行中,查找字段包含exe的: ###########awk.awk######## { for(i=1;i<NF;i++) { if($i ~ /exe/) { print $i } } } test_to_process是要处理的文件,执行如下命令: awk -f awk.awk text_to_process…
<p>显示 .xls, .xlsx, .csv 文件...</p> <input type="file" accept=".csv, application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet, application/vnd.ms-excel" ID="fileSelect" runat="server" /> <…
<p>显示 .xls, .xlsx, .csv 文件...</p><input type="file" accept=".csv, application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet, application/vnd.ms-excel" ID="fileSelect" runat="server" /> <…
Musical Theme Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 30000K Total Submissions: 33820   Accepted: 11259 Description A musical melody is represented as a sequence of N (1<=N<=20000)notes that are integers in the range 1..88, each representing a key on the…
传送门 仔细观察可以发现,如果在一个\(> 1\)的数后面放一个\(> 1\)的数,那么后面的序列也就确定了,所以我们考虑dp出特定长度的序列,然后在后面加上能确定序列的数来贡献答案 为了凑出这样的序列,用来填充的东西是单个的\(1\),或者长度为\(x+1(x>1)\)的 \(x\)加\(x\)个\(1\),所以转移就是\(f_i=\sum_{j=0}^{i-1}[j\ne i-2]f_j\),注意不能加上\(f_{i-2}\),因为\(1\ 1\)会和\(1\)加\(1\)算重 然后…
在介绍summary.seqs的用法之前,我们首先需要搞清楚两个概念: 1)ambiguous bases 中文叫做模糊碱基,对于DNA序列来说,只有ATCG 4种碱基,在IUPAC定义的碱基标准中,出了上述4种碱基之外,还包括其他的碱基,可以代表不同类型的碱基 代码 英文含义 中文含义 G   Guanine 鸟嘌啉 A   Adenine 腺嘌啉 T (U) Thymine (Uracil) 胸腺嘧啶 (尿嘧啶) C   Cytosine 胞嘧啶 R (A or G) PuRine 嘌啉 Y…
超实用的. awk1line_zh-CN.txt 可惜中文版的网址好像不能访问了.. HANDY ONE-LINE SCRIPTS FOR AWK 30 April 2008 Compiled by Eric Pement - eric [at] pement.org version 0.27 Latest version of this file (in English) is usually at: http://www.pement.org/awk/awk1line.txt This fi…
在使用Netty的过程中,你将会遇到需要解码器的基于分隔符和帧长度的协议.本节将解释Netty所提供的用于处理这些场景的实现. 基于分隔符的协议 基于分隔符的(delimited)消息协议使用定义的字符来标记的消息或者消息段(通常被称为帧)的开头或者结尾.由RFC文档正式定义的许多协议(如SMTP.POP3.IMAP以及Telnet名称)都是这样的.此外,当然,私有组织通常也拥有他们自己的专有格式.无论你使用什么样的协议,下面列出的解码器都能帮助你定义可以提取由任意标记(token)序列分隔的帧…
序列是具有先后关系的一组数据,是一维元素向量,元素类型可以不同,类似数学元素序列,元素间由序号引导,通过下标访问序列的特定元素.序列类型是一个基类类型,字符串类型,元祖类型,列表类型都属于序列类型. 序号定义,正向递增序号,反向递减序号.A[0]-A[5]   A[-6] - A[-1] 序列类型操作: x in S x not in S s+t s*n或n*s s[i] s[i:j:k]或s[i:j] s[::-]序列反序 序列类型函数和方法: len(s) min(s) max(s) s.i…
废话不多说,简单了解一下 awk - 强大的文本分析工具,也就是分析日志 最常用的就是分析日志了吧,做统计什么,这里也拿 nginx 日志来做分析 1:统计出现次数 - 比如状态码出现次数 - 先直接上命令 awk '{print $9}' access_log | sort | uniq -c | sort -rn - 可能会有一些疑惑,这个$9 是什么? - 我们拿出一条日志来看一下先 /Oct/::: +] 123.124.16.83 192.168.240.255 - 我们可以看到我们需…
gsub函数有点类似于sed查找和替换.它允许替换一个字符串或字符为另一个字符串或字符,并以正则表达式的形式执行.第一个函数作用于记录$0,第二个gsub函数允许指定目标,然而,如果未指定目标,缺省为$0.index(s,t)函数返回目标字符串s中查询字符串t的首位置.length函数返回字符串s字符长度.match函数测试字符串s是否包含一个正则表达式r定义的匹配.split使用域分隔符fs将字符串s划分为指定序列a.sprint函数类似于printf函数(以后涉及),返回基本输出格式fmt的…
AWK单行脚本快速参考 2008年4月28日编辑: Eric Pement eric [at] pement.org 版本 0.26翻译: 董一粟 yisudong [at] gmail.com 最新英文版本文件发布在以下地址: http://www.pement.org/awk/awk1line.txt 最新中文翻译版本文件发布在以下地址: http://ximix.org/translation/awk1line_zh-CN.txt 翻译问题欢迎联系我: http://hi.baidu.co…
5.1循环序列模型 觉得有用的话,欢迎一起讨论相互学习~Follow Me 1.5不同类型的循环神经网络 上节中介绍的是 具有相同长度输入序列和输出序列的循环神经网络,但是对于很多应用\(T_{x}和T_{y}\)并不一定相等. 在此节会介绍不同的能够处理不同问题的循环神经网络. 多对多循环神经网络 对于命名实体识别的问题中,RNN的输出和输入序列长度一致--\(T_{x}=T_{y}\). 则在每读一个单词时都输出预测的值\(\hat{y}\) 这是一个典型的多对多的问题. 多对一循环神经网络…
awk的基本结构 awk 'BEGIN{} pattern {} END {}' #pattern {} 部分是针对每行进行循环处理的,有pattern表示对匹配到的行处理,没有pattern表示对所有行处理 [root@test88 etc]# echo -e "line1\nline2" | awk 'BEGIN {print "Start"} {print} END {print "End"}' Start line1 line2 End…
一.字符串拼接问题 由于 String 类的对象内容不可改变,所以每当进行字符串拼接时,总是会在内存中创建一个新的对象. Demo: public class StringDemo { public static void main(String[] args) { String s = "Hello"; s += "World"; System.out.println(s); } } 上面这段代码,总共产生了三个字符串,即“Hello”,“world” 和 “He…
概述 简述 shell 命令行工具 cut 背景 偶尔需要用 awk 来筛选特定的列 awk 很是强大 但是强大的背后, 却伴随着复杂 其实同样的功能, awk 也没有复杂多少 如果是 简单的任务, cut 工具完全是可以胜任的 切割行内的特定位置 切割行内的特定字段 描述可能不是很准确, 下面会有例子 1. 准备 os centos7 文件 cutdemo01 1:2:3:4:5 1:2:3:4:5 1:2:3:4:5 cutdemo02 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4…
CRF 许多随机变量组成一个无向图G = {V, E},V代表顶点,E代表顶点间相连的边, 每个顶点代表一个随机变量,边代表两个随机变量间存在相互影响关系(变量非独立), 如果随机变量根据图的结构而具有对应的条件独立性, 具体来说,两个没有边连接随机变量V1.V2,在其它随机变量O都确定的情况下,是独立的. 即 P(V1, V2 | O) = P(V1 | O) * P(V2 | O) 那么这被称为[成对马尔科夫性],另有不同定义的[局部马尔科夫性].[全局马尔科夫性],它们互为充要条件(此处无…