poj3691 DNA repair[DP+AC自动机]】的更多相关文章

$给定 n 个模式串,和一个长度为 m 的原串 s,求至少修改原串中的几个字符可以使得原串中不包含任一个模式串.模式串总长度 ≤ 1000,m ≤ 1000.$ 先建出模式串的AC自动机,然后考虑怎么求最优解.考虑AC自动机上DP,设$f_{i,j}$走了$i$步之后在$j$节点时候的最少修改次数. 标记处所有不能走到的点(即走到就匹配了的点,即后缀为某一模式串的所有点),走点的时候应当回避这些点,转移的时候向合法的状态转移,分两种. 一种沿着原串$s_i$走,$f_{i+1,to_j}\lef…
题意:给你几个模式串,问你主串最少改几个字符能够使主串不包含模式串 思路:从昨天中午开始研究,研究到现在终于看懂了.既然是多模匹配,我们是要用到AC自动机的.我们把主串放到AC自动机上跑,并保证不出现模式串,这里对AC自动机的创建有所改动,我们需要修改不存在但是符合要求的节点,如果某节点的某一子节点不存在,我们就把这个子节点指向他父辈节点存在的该节点(比如k->next[1]不存在,k->fail->next[1]存在,我们就把他改为k->next[1] = k->fail-…
DNA repair Time Limit: 2000MS Memory Limit: 65536KB 64bit IO Format: %I64d & %I64u Description Biologists finally invent techniques of repairing DNA that contains segments causing kinds of inherited diseases. For the sake of simplicity, a DNA is repr…
DNA repair Time Limit: 5000/2000 MS (Java/Others)    Memory Limit: 32768/32768 K (Java/Others)Total Submission(s): 940    Accepted Submission(s): 500 Problem Description Biologists finally invent techniques of repairing DNA that contains segments cau…
题目一串DNA最少需要修改几个基因使其不包含一些致病DNA片段. 这道题应该是AC自动机+DP的入门题了,有POJ2778基础不难写出来. dp[i][j]表示原DNA前i位(在AC自动机上转移i步)且后缀状态为AC自动机结点j的最少需要修改的基因数 转移我为人人型,从dp[i][j]向ATCG四个方向转移到dp[i+1][j'],如果结点被标记包含致病基因就不能转移. #include<cstdio> #include<cstring> #include<queue>…
题意: 生物课上我们学到,DNA序列中只有A, C, T和G四种片段. 经科学发现,DNA序列中,包含某些片段会产生不好的基因,如片段"ATC"是不好片段,则"AGATCC", "CATCAA", "ATCATC"都是不好的DNA序列,这些不好片段我们可以称为病毒片段. 现在已知m个病毒片段, 然后给定一个DNA串,问如果使用最少的修改(将DNA中的某个字母,变为其他字母,比如A变T,但变的字母也只能是"ACTG&q…
咕咕(数位dp+AC自动机) 若一个字符串的字符集合是0~m-1,那么称它为m进制字符串.给出n个m进制字符串\(s_i\),每个字符串的权值为\(v_i\).对于另一个m进制字符串\(S\),设\(s_i\)在S中的出现次数是\(cnt_i\),那么\(s_i\)对\(S\)的价值的贡献就是\(v_i*cnt_i\).因此,\(V_S=\Sigma_{i=1}^kcnt_i\times v_i\).求在区间\([l, r]\)中,有多少字符串的价值不超过k.\(\Sigma_{i=1}^n|s…
正解:$dp$+$AC$自动机+搜索 解题报告: 传送门$QwQ$ 首先显然先建个$AC$自动机,然后考虑设$f_{i,j,k}$表示长度为$i$,现在在$AC$自动机的第$j$个位置,已经表示出来的串的状态为$k$的方案数,直接转移就好. 然后考虑输出方案.首先一定不存在可以随便填的位置. 挺显然的随便说下昂,首先如果有一个可以随便填的位置,就有26种可能.然后可以给这个位置和字符串交换位置,就至少有2种可能,这时候就已经至少有$2\times 26=52$了,所以一定不存在可以随便填的位置.…
DNA repair Time Limit: 2000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 4815   Accepted: 2237 Description Biologists finally invent techniques of repairing DNA that contains segments causing kinds of inherited diseases. For the sake of simplicity, a…
http://blog.csdn.net/kk303/article/details/6929641 http://blog.csdn.net/human_ck/article/details/6577142 建立AC自动机以后,把所有单词结点标记出来,不要忘记,如果某个结点虽然原本不是单词结点,但其fail指针指向了一个单词结点,那么其也需要被标记为单词结点. 然后对于每个空的儿子本来应该在Trie上跳跃,但是我们可以直接让空的儿子指向其父的fail的那个对应的儿子,就没必要跳了,这样可以不用…