临床预测模型也是大家比较感兴趣的,今天就带着大家看一篇临床预测模型的文章,并且用一个例子给大家过一遍做法. 这篇文章来自护理领域顶级期刊的文章,文章名在下面 Ballesta-Castillejos A, Gómez-Salgado J, Rodríguez-Almagro J, Hernández-Martínez A. Development and validation of a predictive model of exclusive breastfeeding at hospital…

之前给大家写过一个临床预测模型:R数据分析:跟随top期刊手把手教你做一个临床预测模型,里面其实都是比较基础的模型判别能力discrimination的一些指标,那么今天就再进一步,给大家分享一些和临床决策实际相关的指标,主要是校准calibration和决策曲线Decision curve analysis. 校准曲线 做预测模型都应该报告校准曲线的: Reporting on calibration performance is recommended by the TRIPOD (Tran…

一.数据分析 1.数据分析的多层模型 常用的统计量 常用的算法 常用的数据分析工具 常见的报表 二.R语言 1.什么是R语言?     R是用于统计分析.绘图的语言和操作环境.R是属于GNU系统的一个自由.免费.源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具.     R与spss几乎是一样的.     R是一套完整的数据处理.计算和制图软件系统.其功能包括:数据存储和处理系统:数组运算工具(其向量.矩阵运算方面功能尤其强大):完整连贯的统计分析工具:优秀的统计制图功能:简便而强大的…

本文首发于“生信补给站”公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/ZEjaxDifNATeV8fO4krOIQ更多关于R语言,ggplot2绘图,生信分析的内容,敬请关注小号. 为了能更方便的查看,检索,对文章进行了精心的整理.建议收藏,各取所需,当前没用也许以后就用到了呢! 一 R资料+计划 R语言精品资料年中无套路赠送 R-plotly|交互式甘特图(Gantt chart)-项目管理/学习计划 二 Bioinfo R|fastqcr QC数据处理 :测序结果的数据质控及…

最近看了好多潜类别轨迹latent class trajectory models的文章,发现这个方法和我之前常用的横断面数据的潜类别和潜剖面分析完全不是一个东西,做纵向轨迹的正宗流派还是这个方法,当然了这个方法和潜增长和增长曲线模型在做法并没有实际区别,都是用的hlme这个函数.但是文献中的叫法和花样就比较多了. 像本文写的latent class trajectory models,之前写的潜类别增长模型LCGA和增长曲线模型GMM都是潜类别线性混合模型latent class linear…

今天给大家写广义混合效应模型Generalised Linear Random Intercept Model的第一部分 ,混合效应logistics回归模型,这个和线性混合效应模型一样也有好几个叫法: Mixed Effects Logistic Regression is sometimes also called Repeated Measures Logistic Regression, Multilevel Logistic Regression and Multilevel Bina…

之前给大家写过一篇数据清洗的文章,解决的问题是你拿到原始数据后如何快速地对数据进行处理,处理到你基本上可以拿来分析的地步,其中介绍了如何选变量如何筛选个案,变量重新编码,如何去重,如何替换缺失值,如何计算变量等等------R数据分析:数据清洗的思路和核心函数介绍 今天呢,就更进一步,对于一个处理好的数据,我们就可以进行统计分析了,本文的思路就是对照期刊论文的一般流程写写如何快速的实现一篇论文的统计过程并简洁高效地展示结果.依然提醒大家,请先收藏本文再往下读哈. 先做描述统计 基本上文章结果部分…

R语言与数据挖掘:公式:数据:方法 R语言特征 对大小写敏感 通常,数字,字母,. 和 _都是允许的(在一些国家还包括重音字母).不过,一个命名必须以 . 或者字母开头,并且如果以 . 开头,第二个字符不允许是数字. 基本命令要么是表达式(expressions)要么就是 赋值(assignments). 命令可以被 (;)隔开,或者另起一行. 基本命令可以通过大括弧({和}) 放在一起构成一个复合表达式(compound expression). 一行中,从井号(#)开始到句子收尾之间的语句就…

主要分成三大类: r 和 r+     "读"功能 r  只读 r+ 读写(先读后写) 辨析:对于r,只有读取功能,利用光标的移动,可以选择要读取的内容. 对于r+,同时具有读和写的功能,默认光标一开始停在开头,当进行一个操作后(无论是读还是写)光标将自动移动到末尾.写的功能如果在末尾就是添加;如果在原文本中就是修改!!! w 和 w+   "写"功能 w 只写 w+       写读(先写后读) 辨析:两个都有写的功能,只要进行操作,一定是先自动清空,再写入,慎用…

*** glibc detected *** /usr/lib64/R/bin/exec/R: free(): invalid next size (fast): 0x000000000263a420 *** ======= Backtrace: ========= /lib64/libc.so.6[0x313a47dda6] /lib64/libc.so.6[0x313a47f08e] /home/phoxis/Documents/Works/Programming/R/libmetis.so…