外泌体 (exosomes) 是由哺乳动物细胞通过"内吞-融合-外排"等机制,主动向胞外释放的纳米级 (直径40~60 nm) 双层囊泡小体,携带蛋白质.核酸.脂质等多种生物活性分子.越来越多的证据表明,外泌体是细胞间交流的重要媒介,它们可以将功能性分子转移到受体细胞中,或参与受体细胞膜受体介导的信号传导 .此外,由于外泌体在体液中很容易获得,常作为非侵入性液体活检的重要内容,以帮助识别疾病和评估治疗反应.而外泌体的天然分子转运特性以及良好的生物相容性,也令其在药物载体.递送.治疗等领…

文献名:Alterations of brain quantitative proteomics profiling revealed the molecular mechanisms of diosgenin against cerebral ischemia reperfusion effects(大脑的定量蛋白质组学揭示了薯蓣皂苷元对脑缺血再灌注效应的分子机制) 期刊名:J. Proteome Res 发表时间:(2020年3月) IF:3.78 (2018) 单位: 西安交通大学 中科院…

期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:(2019年12月) IF:4.828 单位:1德国海德堡大学附属医院2德国汉诺威医科大学3德国亥姆霍茲感染研究中心4德国马克斯·普朗克生化研究所5瑞典于默奥大学6葡萄牙波尔图大学7德国&柏林健康研究所 8法国里昂大学 物种:人 技术:非标定量蛋白质组学,免疫共沉淀,病毒化验 一. 概述: 该研究使用免疫共沉淀-非标定量蛋白质组学的方法发现了高尔基转运相关蛋白GBF1与乌库涅米病毒(UUKV)的感染有关.通过…

期刊名:MCP 发表时间:(2020年4月) IF:4.828 单位:Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, University of California San Diego 物种:人 技术:LC-MS/MS Tandem Mass Spectrometry; label free quantitation 一. 概述:(用精炼的语言描述文章的整体思路及结果) 本研究以人iPSC神经元合成的外泌体为实验材料,进行LC-MS…

期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:(2019年10月) IF:3.78 单位: 里约热内卢联邦大学 坎皮纳斯州立大学 坎皮纳斯州立大学神经生物学中心 卡拉博大学 慕尼黑大学 物种:人类脑部眶额叶皮层组织 技术:iTRAQ标记非靶相对定量,SRM靶向相对定量   一. 概述: 该研究选取了12例精神分裂病人和8例对照健康人群的眶额叶皮层(OFC)组织,通过iTRAQ标记非靶相对定量以及SRM靶向相对定量,进行了组织细胞中线粒体,粗提细胞核以及细胞质三大类亚…

蛋白质翻译后修饰(PTM)在控制植物生长发育以及逆境适应方面发挥着重要的作用.发生在半胱氨酸巯基的亚磺酰化修饰(R-SOH)是一种可逆的氧化修饰类型,可以通过与其他修饰形态形成二硫键的形式来保护蛋白不被氧化损伤,是调控蛋白功能.代谢通路以及激素信号的重要方式.蛋白的氧化还原修饰被认为是ROS信号在细胞内和细胞间传递的重要途径.​ 2021年8月4日,华中农业大学油菜团队郭亮课题组在国际知名期刊Plant, Cell & Environment (IF=7.228)上发表了题为 "Prot…

文献名:Proteomic Profiling of Rhabdomyosarcoma-Derived Exosomes Yield Insights into Their Functional Role in Paracrine Signaling(源于横纹肌肉瘤的外泌体的蛋白质组学分析用于深入了解其在旁分泌信号转导中的作用) 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间: (2019年8月) IF:3.78 单位: 黎巴嫩大学,黎巴嫩 贝鲁特美国大学儿童和青少年…

文献名:Label-Free Proteomic Analysis of Exosomes Secreted from THP-1- Derived Macrophages Treated with IFN‑α Identifies Antiviral Proteins Enriched in Exosomes 期刊名:Journalof Proteome Research 发表时间:December 14, 2018 DOI: 10.1021/acs.jproteome.8b00514 单位:…

题目:Cancer cell derived small extracellular vesicles contribute to recipient cell metastasis through promoting HGF/c-Met pathway 期刊:MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS 发表时间:June 13, 2019 DOI:10.1074/mcp.RA119.001502 分享人:廖文丽 内容与观点: 一.概述 本研究旨在揭示小细胞外囊泡蛋白(sEV…

大家好,本周分享的是发表在Molecular & Cellular Proteomics 上的一篇关于人胃肠道间质瘤亚群蛋白质组图谱的文章,题目是Proteomic maps of human gastrointestinal stromal tumor subgroups,通讯作者是四川大学生物治疗国家重点实验室的戴伦治. 胃肠道间质瘤(Gastrointestinal stromal tumor, GIST)是一种起源于胃肠道间叶组织的肿瘤,也是最为常见的胃肠道肉瘤(Gastrointest…

文献名:Quantitative proteomic analysis of small and large extracellular vesicles (EVs) reveals enrichment of adhesion proteins in small EVs(小型和大型胞外囊泡的定量蛋白质组学分析揭示小型胞外囊泡中粘附蛋白的富集) 期刊名:Journal of proteome research 发表时间:2019年1月 单位: 范德比尔特大学医学院 新墨西哥大学 莎拉坎农研究所…

题目:Quantitative Proteomics of Th-MYCN Transgenic Mice Reveals Aurora Kinase Inhibitor Altered Metabolic Pathways and Enhanced ACADM To Suppress Neuroblastoma Progression 期刊:Journal of Proteome Research 发表时间:September 27, 2019 DOI:10.1021/acs.jproteom…

阿尔茨海默症 (Alzheimer 's disease,AD) 是一种原发性的中枢神经系统退行性疾病.AD的主要临床症状是缓慢的认知功能减退,包括记忆.逻辑推理能力和语言功能的进行性丟失,最后发展为重度痴呆.目前,对AD尚缺乏早期诊断措施,当患者就诊时常常已经出现不可逆性脑损伤,导致治疗效果不佳.因此,发现早期高危因素对早期诊断和干预有重要意义.血小板与神经元在生物学上有诸多相似之处,因此,血小板是寻找中枢神经系统疾病外周生物标志物的理想基质. 近日,华中科技大学王建枝团队在衰老领域权威期刊A…

文献名:ComplexBrowser: a tool for identification and quantification of protein complexes in large-scale proteomics datasets(大规模蛋白组学数据集中鉴定和定量蛋白复合物) 期刊名:Mol Cell Proteomics 发表时间:(2019年11月) IF:4.828 单位:南丹麦大学生物化学与分子生物学系和VILLUM生物分析科学中心 物种:人和小鼠 技术:ComplexBrow…

巨噬细胞 (macrophage, Mϕ) 是先天免疫系统中重要的免疫细胞,也是血液.淋巴和所有哺乳动物组织类型中最常见的吞噬细胞,具有极强的功能多样性.其中,肿瘤微环境组织中存在的巨噬细胞也被称作肿瘤相关巨噬细胞 (tumor-associated macrophages, TAMs).一般来说,在不同生理病理因素刺激下,巨噬细胞可分化成两种极化状态,即经典活化的M1型和替代活化的M2型.其中,M1型参与促炎反应,同时也发挥抗肿瘤活性,而M2型则参与抗炎反应,并能通过肿瘤免疫抑制等作用促进肿瘤…

发表时间:(2019年4月) IF:3.95 单位: 维也纳医科大学: 欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI): 分子病理学研究所: 奥地利科学院分子生物技术研究所: Gregor Mendel分子植物生物学研究所. 对象:质谱无标记定量结果 技术:聚类分析 一. 概述:(用精炼的语言描述文章的整体思路及结果) 本文选择四个不同的数据集,分为基于谱图数计数和基于峰值强度计数的无标记定量两种情况,对谱图进行聚类算法分析,提高了低丰度蛋白的可检测性,并开发了可直接使用的聚类方法的PD节点. 二. 研…

文献名:Proteomic analysis of Rhizobium favelukesii LPU83 in response to acid stress.(酸胁迫下根瘤菌LPU83(Rhizobium favelukesii)的蛋白质组学分析) 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间: 2019年10月 IF:3.78 单位:国立拉普拉塔大学,阿根廷 物种:根瘤菌LPU83(Rhizobium favelukesii) 技术:非标定量蛋白质组学(Lab…

期刊:Clinical and Translational Medicine 发表时间:2021年7月19日 影响因子:11.492 角膜炎是一种眼科常见疾病,也是我国主要致盲眼病之一,其特征是炎性细胞的浸润和角膜结构的破坏.目前,角膜炎的临床治疗多使用抗炎药物或免疫抑制剂,但这些药物的选择有限,且可能会产生白内障.青光眼和角膜愈合延迟等较严重的副作用.因此寻找有效而安全的角膜炎新型治疗手段显得尤为重要.NLRP3炎症小体是一类监测细胞内稳态的大分子聚合物,可感知多种病原体源性.环境和内源性应激…

水稻是我国重要的粮食作物,稻曲病是水稻三大病害之一,不仅造成稻米产量损失,更重要的是稻曲球中的稻曲菌素的毒性和致畸作用,给人畜健康带来严重威胁.病原菌对植物的侵袭是由病原菌的毒力和植物免疫系统相互作用决定的.深入研究这种复杂的互作过程,对全面理解细菌如何引起植物病害以及植物如何保护自己免受病原菌侵染至关重要. 蛋白翻译后修饰(PTMs)在病原菌与植物互作过程中起关键作用.最新研究发现,组蛋白赖氨酸2-羟基异丁酰化(Khib)修饰是拟南芥.水稻.烟草等多种植物中保守的表观基因组标记,参与植物对暗诱…

文献名:Quantitative Proteomics of Enriched Esophageal and Gut Tissues from the Human Blood Fluke Schistosoma mansoni Pinpoints Secreted Proteins for Vaccine Development(从人类血吸虫曼氏血吸虫中富集的食道和肠道组织的定量蛋白质组学确定了用于疫苗开发的分泌蛋白) 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:…

郑重声明:原文参见标题,如有侵权,请联系作者,将会撤销发布! Abstract 在中脑多巴胺能神经元的研究中取得了许多最新进展.要了解这些进步以及它们之间的相互关系,需要对作为解释框架并指导正在进行的实验探究的计算模型有深刻的理解.现在,理论和实验的这种相互交织非常清楚地表明,中脑多巴胺神经元的阶段性活动为突触改变提供了一个整体机制.这些突触改变反过来又为特定类别的强化学习机制提供了机械基础,而强化学习机制现在似乎已成为人类和动物行为的基础.这篇综述既描述了该结论的关键经验性发现,也描述了得出此…

------------------------------- Long noncoding RNAs are rarely translated in two human cell lines. (蛋白,多肽) Bánfai B, Jia H, Khatun J, Wood E, Risk B, Gundling WE Jr, Kundaje A, Gunawardena HP, Yu Y, Xie L, Krajewski K, Strahl BD, Chen X, Bickel P, Gi…

一.概述: 噬菌体是特异性感染并最终杀死其细菌宿主的病毒.他们在所有生态系统中发挥着关键的生态作用.尽管经过了几十年的研究,噬菌体与细菌宿主之间的相互作用仍然知之甚少.本研究使用无标记定量蛋白质组学来揭示乳酸乳球菌MG1363在噬菌体p2感染过程中的蛋白质组类型:还使用了CRISPR-Cas9技术选择特定的细菌基因进行敲除,以研究它们参与噬菌体复制的过程.此外,该研究同时检测并量化了78%的理论噬菌体蛋白质组,并鉴定了以前未检测到的噬菌体p2的许多蛋白质. 二.研究背景: 噬菌体无处不在,并具有…

文献名:Global Proteomic Analysis of Lysine Succinylation in Zebrafish (Danio rerio)(斑马鱼赖氨酸琥珀酰化的全球蛋白质组学分析(斑马鱼)) 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间: (2019年10月) IF:3.86 单位: 庆北国立大学 国立首尔科学技术大学 中国科学院上海药物研究所 物种:斑马鱼 技术:全蛋白质组学   一. 概述:(用精炼的语言描述文章的整体思路及结果) 本研究…

文献名:A Systems-Level Characterization of the Differentiation of Human Embryonic Stem Cells into Mesenchymal Stem Cells(人类胚胎干细胞到间充质干细胞的分化的系统性表征) 期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:(2019年10月) 单位: Camargo Cancer Center University of Southern Denmar…

文献名:Stress-induced changes in the S-palmitoylation and S-nitrosylation of synaptic proteins (压力诱导突触蛋白的S-棕榈酰化和S-亚硝基化的改变) 期刊名:Mol Cell Proteomics 单位:Laboratory of Cell Biophysics, Nencki Institute of Experimental Biology, Polish Academy of Science, 02-…

文献名:Multi-batch TMT reveals false positives, batch effects and missing values (多批次TMT定量方法中对假阳性率,批次效应,以及缺失值的研究) 期刊名:Molecular & Cellular Proteomics DOI:10.1074/mcp.RA119.001472 Online:https://www.mcponline.org/content/early/2019/07/22/mcp.RA119.001472…

文献名:Elevated Hexokinase II Expression Confers Acquired Resistance to 4-Hydroxytamoxifen in Breast Cancer Cells(升高的己糖激酶II表达使得乳腺癌细胞获得对他莫昔芬的抗性) 期刊名:Mol Cell Proteomics 发表时间:(2019年9月) IF:4.828 单位: 加州大学河滨分校 研究对象:乳腺癌细胞 技术:靶向蛋白组学   一. 概述: 本文应用了基于并行反应监测(PRM)…

郑重声明:原文参见标题,如有侵权,请联系作者,将会撤销发布! Nature 2020 汇报PPT: 链接:https://pan.baidu.com/s/1RWx6miX6iZUNgNfV9B69FQ 提取码:x5cz 基础概念: 分位数:https://www.zhihu.com/question/67763556 线性回归检验:https://www.cnblogs.com/tinglele527/p/12015449.html https://www.zhihu.com/question/…

N-糖基化修饰是真核生物中一种重要的蛋白质翻译后修饰,在许多生物学过程中起着关键作用,包括蛋白质折叠.受体-配体相互作用.免疫应答和疾病发病机制等.近年来,高精度质谱技术的出现促进了糖组和糖蛋白质组的大规模研究,为我们理解啮齿动物和人类细胞中蛋白质糖基化的分子结构和生物网络做出了重大贡献.不过在许多无脊椎动物,N-糖基化的研究仍然很少. 捻转血矛线虫(Haemonchus contortus)是寄生于反刍动物的一种吸血寄生线虫,在世界范围内广泛分布.先前的研究表明该寄生虫存在一系列哺乳动物缺失的…