【BWT转换对字符串进行编码】的更多相关文章

BWT转换对字符串进行编码

今天看了下bowtie 的论文, 里面描述了BWT转换的过程和bowtie的比对算法: NGS测序数据的数据量非常大, 为了更快的处理, 通常需要对数据进行压缩:而BWT实际上就是一种数据转换方法, 将原始序列经过BWT转换后, 可以更方便的进行压缩:而且BWT转换是一个可逆的转换,能够根据转换后的序列还原出原始序列: BWT转换首先将序列进行在序列的末尾插入一个字符,并且规定按照字典序的排序的话, 这个字符小于序列中的任意字符: 比如原始序列: acaacg 首先在末尾添加一个$符号,变成 a…

中文字符串的编码转换(c实现)

中文字符串在c/c++中表示为字节序列,在分词的时候需要根据不同的编码方式进行分词,一般分词器需要转换成统一的编码方式再进行转换,有些分词器如ICTCLAS在分词的时候可以不显示定义编码方式,可以检测字符串的编码方式再进行转换,本文就项目中用到的几种编码转换方式进行总结,主要利用了iconv进行编码转换. const bchar_t zero[1] = {L'\0'}; void gbk_utf16le(char* inbuf, size_t inlen, char* outbuf) { ico…

java转换字符串的编码(转)

package com.Alex.base; import java.io.UnsupportedEncodingException; /** * 转换字符串的编码 */ public class ChangeCharset { /** 7位ASCII字符,也叫作ISO646-US.Unicode字符集的基本拉丁块 */ public static final String US_ASCII = "US-ASCII"; /** ISO 拉丁字母表 No.1,也叫作 ISO-LATIN-…

字符串js编码转换成实体html编码的方法（防范XSS攻击）

js代码在html页面中转换成实体html编码的方法一: <!DOCTYPE html><html> <head>    <title>js代码转换成实体html</title>    <meta charset="utf-8">    <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1.0&quo…

Python3中字符串的编码与解码以及编码之间转换(decode、encode)

一.编码 二.编码与解码 Python3中对py文件的默认编码是urf-8.但是字符串的编码是Unicode. 由于Unicode采用32位4个字节来表示一个字符,存储和传输太浪费资源,所以传输和存储时,采用非Unicode编码. 后续中..... 三.Util 后续....…

C#字节数组转换成字符串

C#字节数组转换成字符串 如果还想从 System.String 类中找到方法进行字符串和字节数组之间的转换,恐怕你会失望了.为了进行这样的转换,我们不得不借助另一个类:System.Text.Encoding.该类提供了 bye[] GetBytes(string) 方法将字符串转换成字节数组,还提供了 string GetString(byte[]) 方法将C#字节数组转换成字符串. System.Text.Encoding 类似乎没有可用的构造函数,但我们可以找到几个默认的 Encodin…

Python字符串的编码与解码(encode与decode)

首先要搞清楚,字符串在Python内部的表示是unicode编码,因此,在做编码转换时,通常需要以unicode作为中间编码,即先将其他编码的字符串解码(decode)成unicode,再从unicode编码(encode)成另一种编码. decode的作用是将其他编码的字符串转换成unicode编码,如str1.decode('gb2312'),表示将gb2312编码的字符串转换成unicode编码. encode的作用是将unicode编码转换成其他编码的字符串,如str2.encode('…

基于Visual C++2013拆解世界五百强面试题--题4-double转换成字符串

请用C语言实现将double类型数据转换成字符串,再转换成double类型的数据.int类型的数据 想要完成题目中的功能,首先我们的先对系统存储double的格式有所了解. 浮点数编码转换使用的是IEEE的编码标准. 类型 存储位数 ​ ​ ​ 偏置值 ​ ​ 数符(S) 阶码(E) 尾数(M) 总位数 十六进制 十进制 短浮点数(Single,float) 1位 8位 23位 32位 7FH +127 长浮点数(Double) 1位 11位 52位 64位 3FFH +1023 临时浮点数(扩…

python入门（9）字符串和编码

python入门(9)字符串和编码 字符串是一种数据类型,比较特殊的是字符串有一个编码问题. 因为计算机只能处理数字,如果要处理文本,就必须先把文本转换为数字才能处理. 最早的计算机在设计时采用8个比特(bit)作为一个字节(byte),所以,一个字节能表示的最大的整数就是255(二进制11111111=十进制255),如果要表示更大的整数,就必须用更多的字节. 比如两个字节可以表示的最大整数是65535,4个字节可以表示的最大整数是4294967295. 由于计算机是美国人发明的,因此,最早只…

python基础——字符串、编码、格式化

1.三种编码:ascii Unicode utf8 2.字符串和编码数字的两个函数:ord(字符转数字ord(‘A’)=65)和 chr(数字转字符chr(65)=A) 3.bytes存储编码,记住两个函数encode和decode 由于Python的字符串类型是str,在内存中以Unicode表示,一个字符对应若干个字节.如果要在网络上传输,或者保存到磁盘上,就需要把str变为以字节为单位的bytes. Python对bytes类型的数据用带b前缀的单引号或双引号表示. ‘ABC’.encod…