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NCBI(National Center for Biotechnology Information,美国国家生物技术信息中心)除了维护GenBank核酸序列数据库外,还提供数据分析和检索资源.NCBI资源包括Entrez.Entrez编程组件.MyNCBI.PubMed.PudMed Central.PubReader.Gene.the NCBI Taxonomy Browser.BLAST.Pimer-Blast.COBALT.RefSeq.UniGene.HomoloGene.ProtES…
目录 1. eggNOG简介 2. eggNOG-Mapper注释原理 3. eggNOG 5.0数据资源 4. eggNOG-Mapper使用 5. NOG.KOG.COG.KEGG.GO区别? 1. eggNOG简介 最近考虑到所用的一些数据库太旧了,需要更新.在整理的时候发现eggNOG数据库在去年的时候已经做了一次更新eggNOG 5.0: a hierarchical, functionally and phylogenetically annotated orthology reso…
第1章 数据库介绍及mysql安装 1.1 数据库简介 数据库,简而言之可视为电子化的文件柜——存储电子文件的处所,用户可以对文件中的数据运行新增.截取.更新.删除等操作. 所谓“数据库”系以一定方式储存在一起.能予多个用户共享.具有尽可能小的冗余度.与应用程序彼此独立的数据集合. 1.1.1 什么是数据 数据是指对客观事件进行记录并可以鉴别的符号,是对客观 事物的性质.状态以及相互关系等进行记载的物理符号或这些物 理符号的组合.它是可识别的.抽象的符号. 1.1.2 数据库管理系统 非关系型数…
二.部署在本地服务器 在上次的学习过程中,我们主要进行了MongoDB运行环境的搭建和可视化工具的安装.此次我们将学习MongoDB有关的基本概念和在adminmongo上的基本操作.该文档中的数据库.集合等名称均无特殊意义,只是代指. 2.1配置环境变量 在文件资源管理器中找到可执行文件mongod.exe的路径,4.0版本默认路径为C:\Program Files\MongoDB\Server\4.0\bin. 我的电脑/此电脑(右键)→属性→高级系统设置→环境变量→系统变量(S) 找到系统…
[转]数据库介绍(MySQL安装 体系结构.基本管理) 第1章 数据库介绍及mysql安装 1.1 数据库简介 数据库,简而言之可视为电子化的文件柜——存储电子文件的处所,用户可以对文件中的数据运行新增.截取.更新.删除等操作. 所谓“数据库”系以一定方式储存在一起.能予多个用户共享.具有尽可能小的冗余度.与应用程序彼此独立的数据集合. 1.1.1 什么是数据 数据是指对客观事件进行记录并可以鉴别的符号,是对客观 事物的性质.状态以及相互关系等进行记载的物理符号或这些物 理符号的组合.它是可识别…
数据库介绍 数据库(Database)是按照数据结构来组织.存储和管理数据的仓库,每个数据库都有一个或多个不同的API接口用于创建,访问,管理,搜索和复制所保存的数据. 我们也可以将数据存储在文件中,但是在文件中读写数据速度相对较慢,所以现在我们使用关系型数据库管理系统(RDBMS)来存储和管理的大数据量. 所谓的关系型数据库,是建立在关系模型基础上的数据库,借助于集合代数等数学概念和方法来处理数据库中的数据.   RDBMS即关系数据库管理系统(Relational Database Mana…
引言 redis是一个开源的.使用C语言编写的.支持网络交互的.可基于内存也可持久化的Key-Value数据库. redis数据结构 redis是一种高级的key:value存储系统,其中value支持五种数据类型: 字符串(strings) 字符串列表(lists) 字符串集合(sets) 有序字符串集合(sorted sets) 哈希(hashes) 而关于key,有几个点要提醒大家: key不要太长,尽量不要超过1024字节,这不仅消耗内存,而且会降低查找的效率: key也不要太短,太短的…
删除mysql数据库某一张主键表的所有外键关系 SELECT CONCAT('alter table ', TABLE_NAME , ' drop foreign key ', constraint_name, ';') FROM information_schema.KEY_COLUMN_USAGE a WHERE a.TABLE_SCHEMA='某一个数据库的名称' AND a.constraint_name LIKE 'FK_Reference_%' AND REFERENCED_TABL…
Mysql数据库介绍.安装和配置文件 MySQL数据库介绍 mysql是开源关系型数据库,遵循GPL协议. mysql的特点是性能卓越且服务稳定,开源,无版本限制,成本低,单进程多线程,多用户,基于C/S(客户端/服务端)架构,安全可靠,插入式存储引擎. mysql的另个版本为MariaDB,MariaDB是单进程,多线程的,提供了诸多扩展和新特性,提供了较多测试组件并且同样开源. mysql系统结构 一.逻辑模块组成 MySQL 可以看成是二层架构. 第一层我们通常叫做SQL Layer,在M…
- 数据库介绍: 1.随意存放在一个文件中的数据,数据的格式千差万别 tank|123 jason:123 sean~123 2.软件开发目录规范 - Project: - conf - bin - core - db: 存放一个个的文件 1.2都是从本地读取的数据. 3.将所有数据存放到一个第三方的公共位置,同一个软件凡是需要操作数据的,就必须去这个共享的位置操作. - 第三方的公共位置(数据库) - 数据库集群: 将同一个数据库中的数据,复制到不同的服务器中. 4. MySQL数据: C -…