Biopython 官网:https://biopython.org/ 安装 Biopython  https://biopython.org/wiki/Download 可以使用 pip 进行安装, 注意有时需要使用管理员权限,即管理员打开 cmd pip install biopython 验证安装是否成功 Biopython 官方教程 https://biopython.org/wiki/Documentation Biopython 的 API 文档 http://biopython.o…

本来是自学python,后来又了解到有biopython这个包,将想安装下来,结果折腾了我一上午...终于安装成了,哈哈哈,功夫不负有心啊 过程如下: 1.首先去http://biopython.org/wiki/Download现在一个biopython 因为我用的是win7,所以一开始我下载的是 biopython-1.68.win32-py3.5.exe 2Mb – 32 bit Windows .exe Installer for Python 3.5 and NumPy 1.11.1.…

其实好多东西装过好多次,然而每次都要翻文档,经常掉进前面掉进过的坑...所以这里重新写一份指南,以防下次再装又忘了(魂淡我并不想再装了啊不要立flag) 1. 安装biopython 1.1 因为biopython目前支持的是python2,所以我先把python调到2 1.2 安装numpy (http://www.numpy.org/) NumPy is the fundamental package for scientific computing with Python. It cont…

pip命令行安装(推荐) 打开cmd命令行 安装需要的第三方库如:pip install numpy 在安装python的相关模块和库时,我们一般使用“pip install  模块名”或者“python setup.py install”,前者是在线安装,会安装该包的相关依赖包:后者是下载源码包然后在本地安装,不会安装该包的相关依赖包.所以在安装普通的python包时,利用pip工具相当简单.但是在如下场景下,使用python setup.py install会更适合需求: 在编写相关系统时,…

1. 安装python2.7.13 因为涉及到安装到服务器,所以可能不能直接在usr/bin及usr/local/bin下安装,所以本文详解安装在自定义目录下. 下载安装包: $ wget https://www.python.org/ftp/python/2.7.13/Python-2.7.13.tgz 解压安装: $ tar zxvf Python-.tgz $ cd Python- $ ./configure --prefix=/home/wangq/Programs/Python-(你自…

转载Part 2  Biopython的重头戏-生物学中序列的处理 Biopyhton的Seq和Python中标准字符串有两大重要的不同之处:首先,他们的处理方法不同.Seq适用于很多不同字符串的用的方法,如translate(),但是又有所不同.而且Biopython中加入了不同字符处理中没有的方法,如reverse_complement(); 第二,Seq模块中加入了重要的特性alphabet,这个对象可以解释序列代表的意思,即这个序列是一个DNA序列还是蛋白质序等. 是alphabet对象…

Python数据分析必备: 1.Anaconda操作 Anaconda是一个用于科学计算的Python发行版,支持 Linux, Mac, Windows系统,提供了包管理与环境管理的功能,可以很方便地解决多版本python并存.切换以及各种第三方包安装问题.Anaconda利用工具/命令conda来进行package和environment的管理,并且已经包含了Python和相关的配套工具. conda可以理解为一个工具,也是一个可执行命令,其核心功能是包管理与环境管理.包管理与pip的使用类…

Bio库的安装并不是pip install bio,而是biopython. ./anaconda3/bin/pip3 install biopython -i https://pypi.douban.com/simple 结果:…

写在前面: 继续docker的学习,学习了docker的基本常用命令之后,我在docker上安装jdk,tomcat两个基本的java web工具,这里对操作流程记录一下. 软件准备: 1.jdk-7u79-linux-x64.tar.gz 2.apache-tomcat-8.0.36.tar.gz 下载centos镜像:(下载centos这个过程极其漫长) # 启动docker服务 service docker start # 检索centos镜像 docker search centos #…

如果你正在构建一个基于 gulp 的前端自动化开发环境,那么极有可能会用到 gulp-sass ,由于网络原因你可能会安装失败,因为安装过程中部分细节会到亚马逊云服务器上获取文件.本文主要讨论在不变更网络环境的前提下安装 gulp-sass / node-sass . 问题描述 执行 npm install 安装软件包 gulp-sass $ npm install gulp-sass 这个过程中会先安装 node-sass ,因为 gulp-sass 依赖于 node-sass .中间出现的错…