Linux文件排序和FASTA文件操作】的更多相关文章

文件排序 seq: 产生一系列的数字; man seq查看其具体使用.我们这使用seq产生下游分析所用到的输入文件. # 产生从1到10的数,步长为1 $ seq 1 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 # 产生从1到10的数,步长为1,用空格分割 $ seq -s ' ' 1 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 # 产生从1到10的数,步长为2 # 如果有3个数,中间的数为步长,最后一个始终为最大值 $ seq -s ' ' 1 2 10 1 3 5 7 9 $ cat…
sort是排序工具,它完美贯彻了Unix哲学:"只做一件事,并做到完美".它的排序功能极强.极完整,只要文件中的数据足够规则,它几乎可以排出所有想要的排序结果,是一个非常优质的工具. 虽然sort很强大,但它的选项很少,使用方法也很简单.更让人觉得它成功的地方在于:即使想要实现复杂.完整的sort功能,所使用的选项和一般使用时的选项没什么不同.只不过要实现复杂功能时,必须得理解sort是如何工作的. 也就是说,没搞懂sort工作机制时,它也能完成任务,指哪就能打哪,但没被指到的地方难免…
对于刚刚接触Linux的人来说,一定会给Linux下一大堆各式各样的文件名给搞晕.别个不说,单单就压缩文件为例,我们知道在Windows下最常见的压缩文件就只有两种,一是,zip,另一个是.rap.可是Linux就不同了,它有.gz..tar.gz.tgz.bz2..Z..tar等众多的压缩文件名,此外windows下的.zip和.rar也可以在Linux下使用,不过在Linux使用.zip和.rar的人就太少了.本文就来对这些常见的压缩文件进行一番小结,希望你下次遇到这些文件时不至于被搞晕.…
1. df -lh 2. du -s /usr/* | sort -rn这是按字节排序 3. du -sh /usr/* | sort -rn这是按兆(M)来排序 4.选出排在前面的10个du -s /usr/* | sort -rn | head 5.选出排在后面的10个du -s /usr/* | sort -rn | tail du -h –-max-depth=0 userdu -sh –-max-depth=2 | more 本文具体介绍了linux中du命令參数的用法,并用演示例子进…
一:ls命令是最常用的linux命令了:下面是ls --help里面的用法 在提示符下输入ls --help ,屏幕会显示该命令的使用格式及参数信息: 先介绍一下ls命令的主要参数: -a 列出目录下的所有文件,包括以 . 开头的隐含文件. -A 显示除 “.”和“..”外的所有文件 -b 把文件名中不可输出的字符用反斜杠加字符编号的形式列出. -B 不输出以 “~”结尾的备份文件. -c 输出文件的 i 节点的修改时间,并以此排序. -C 按列输出,纵向排序. -d 将目录象文件一样显示,而不…
本文介绍下,在linux系统中,查找文件的命令用法,以及按时间排序找到的目标文件的方法. 1.例如:查找当前目录下所有.ini文件,并按时间排序 示例: find ./  -name *.ini   |xargs ls –lta   2.按时间的排序显示并显示器条数 示例: ls  -lt  |head –n 10 3. 查看文件内容 示例:cat  po-test1-2014-01-23-15.txt |less 其它方法: cat po-test1-2014-01-23-15.txt |mo…
问题 我们常使用linux以下命令 cd 进入目录 ls 列出目录中的文件 或者直接打开目录中的文件 以上操作对于目录权限位的设置来说,是有一定迷惑性的,如表格所示   cd进入该目录 cd进入该目录内目录 ls列出该目录内文件 操作该目录内文件(读/写已存在文件) 操作该目录内文件(新建) r-- No No No No No -w- No No No No No --x Yes Yes No Yes No r-x Yes Yes Yes Yes No 1.可以看见,当目录只有读取权限的时候,…
减少文件大小有两个明显的好处,一是可以减少存储空间,二是通过网络传输文件时,可以减少传输的时间.gzip是在Linux系统中经常使用的一个对文件进行压缩和解压缩的命令,既方便又好用.gzip不仅可以用来压缩大的.较少使用的文件以节省磁盘空间,还可以和tar命令一起构成Linux操作系统中比较流行的压缩文件格式.据统计,gzip命令对文本文件有60%-70%的压缩率. 1.命令格式: gzip[参数][文件或者目录] 2.命令功能: gzip是个使用广泛的压缩程序,文件经它压缩过后,其名称后面会多…
---- 今天分享一下在linux系统在实现对文件读写一些基本的操作,在这之前我们要掌握一些基本的技能在Linux环境下.比如查看命令和一个函数的具体用法,就是相当于查手册,在Linux下有一个man手册非常有用:man查询手册man 1 +命令 这里的1表示为查询的是Linux命令man 2 xxx 这里的2表示为查询的是linux apiman 3 xxx 这里的3表示为查询的是c库函数在了解了这个后我们就可以开始来实现标题说的操作了.一.在linux环境下常用文件接口函数:open.clo…
https://blog.csdn.net/qq_28766327/article/details/78069989 在服务器开发中,我们经常会写入大量的日志文件.有时候我们需要对这些日志文件进行统计.Linux中我们可以利用以下命令简单高效的实现这一功能. 需要用到的命令简介 cat命令 cat命令主要有三大功能 1.一次显示整个文件 cat filename 2.创建一个文件 cat > fileName 3.将几个文件合并为一个文件 cat file1 file2 > file 参数: …