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前言: 在前面介绍了R的基础入门语法之后,现也将最近整理好的一些R的基础绘图实例提供给需要的朋友参考.(温馨提示:代码慎用!按照本博文实例进行练习的话最好能做到举一反三.代码多敲方为上策,切不可隔岸观火!) #基础R绘图 x <- : y <- + x* windows(,);plot(y) #默认情况绘制散点图type="p" windows(,);plot(y,type="l") #"l"即 line首字母 #正态分布随机数图 x…
R绘图命令分为三种类型: 高级绘图命令在图形设备上产生一个新的图区,它可能包括坐标轴,标签,标题等等. 低级画图命令会在一个已经存在的图上加上更多的图形元素,例如额外的点,线和标签. 交互式图形命令允许你交互式的用定点设备(如鼠标)在一个已经存在的图上添加图形信息或者提取图形信息. 基本图库graphics包: 高级绘图函数: plot函数: 这个函数主要用来画散点图. 因为plot() 函数默认启动一个新的页面,所以你需要禁止该操作,因此设定选项newpage = FALSE. plot(x,…
一,布局 R绘图所占的区域,被分成两大部分,一是外围边距,一是绘图区域. 外围边距可使用par()函数中的oma来进行设置.比如oma=c(4,3,2,1),就是指外围边距分别为下边距:4行,左边距3行,上边距2行,右边距1行.很明显这个设置顺序是从x轴开始顺时针方向.这里的行是指可以显示1行普通字体.所以当我们使用mtext中的line参数时,设置的大小就应该是[0,行数)的开区间.当我们使用mtext在外围边距上书写内容时,设置mtext中的outer=TRUE即可. 绘图区域可使用par(…
COS论坛里面经常会遇到的一个问题就是绘图时中文字体怎么解决.最初,一个流行的方法是使用family = "GB1",但一般这样做出来的图比较难看,而且并没有完全解决问题.后来发现了Cairo包,喜大普奔,但后来又发现它选字体的时候不太明确,也就是说我不知道怎样才能选中我想要的那个字体.再然后,Winston Chang写了extrafont包,功能很完善,但需要系统里面安装Ghostscript.我是懒人,不想花时间在配置Ghostscript上,于是写了一个叫做showtext的包…
散点图用于描述两个连续性变量间的关系,三个变量之间的关系可以通过3D图形或气泡来展示,多个变量之间的两两关系可以通过散点图矩阵来展示. 一,添加了最佳拟合曲线的散点图 使用基础函数plot(x,y)来绘制散点图,其中x和y是数值型向量,代表着图形中的点(x,y) attach(mtcars) plot(wt,mpg, main='Basic Scatter plot of MPG vs Weight', xlab='Car Weight(1bs/1000)', ylab='Miles Per G…
1.首先安装R的绘图包Cairo 下载地址:http://www.rforge.net/Cairo/files/ [root@Hadoop-NN-01 mysofts]# R CMD INSTALL Cairo_1.5-9.tar.gz 2.检查 > library(Cairo) # 加载Cairo包 > Cairo.capabilities() # 检查Cairo包支持的图片格式 png jpeg tiff pdf svg ps x11 win raster TRUE TRUE FALSE…
ggplot2包中绘制点图的函数有两个:geom_point和 geom_dotplot,当使用geom_dotplot绘图时,point的形状是dot,不能改变点的形状,因此,geom_dotplot 叫做散点图(Scatter Plot),通过绘制点来呈现数据的分布,对点分箱的方法有两种:点密度(dot-density )和直方点(histodot).当使用点密度分箱(bin)方式时,分箱的位置是由数据和binwidth决定的,会根据数据进行变化,但不会大于binwidth指定的宽度:当使用…
在R语言中,对于图中的点来说,有很多种坐标系来进行定位 举个例子: par(omi = c(1, 1, 1, 1), mai = c(1, 1, 1, 1), mfrow = c(1, 2)) plot(1:5) box(which = "plot", col = "red", lwd = 2) box(which = "figure", col = "red", lwd = 2) plot(1:5) box(which =…
在R语言的基础绘图系统中,有plot, figure, outer, inner 共4种边框: 这四种边框实际上明确了整个绘图设备的布局 1) outer,  当我们声明一个绘图设备的时候,outer 指的就是这个设备上,下,左,右4个边框 代码示例: plot(1:5) box(which = "outer", col = "red", lwd = 10) 生成的图片如下: 可以看到 outer 边框为整个绘图设备最外圈的边框 2) inner : outer 是…
相信很多人都看到过上面这种方块图,有点像"华夫饼图"的升级版,也有点像"热图"的离散版.我在一些临床多组学的文章里面看到过好几次这种图,用它来展示病人的临床信息非常合适,我自己也用R包或者AI画过类似的图.今天给大家演示一下,如何用ggplot2里面的geom_tile函数画这种图. 先构造一个练习数据集,假设有15个病人,每个病人有年龄.性别.症状.是否有RNA-seq和WES测序等信息. library(ggplot2) library(tidyverse) l…