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农业的组学技术应用虽然落后于人的研究,这是什么意义的问题,但有时农业基因组有自己无可比拟的优势,那就是材料.下面介绍GWAS应用. GWAS(Genome-wide association study),即全基因组关联分析,是通过扫描基因组中数以百万计的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)分子标记,进行基因型和表型间相关性分析,筛选出影响复杂性状的基因变异的一种策略. 应用方向 多性状定位 在全基因组水平上同时且广泛地挖掘与多个目标性状变异显著…
一. 源起于Faster 深度学习于目标检测的里程碑成果,来自于这篇论文: Ren, Shaoqing, et al. "Faster R-CNN: Towards real-time object detection with region proposal networks." Advances in Neural Information Processing Systems. 2015. 也可以参考:[论文翻译] 虽然该文章前面已经讲过,但只给出了很小的篇幅,并没有作为独立的一篇…
之所以叫书摘,是因为翻译不像翻译,书评不像书评,更像是把觉得有意义的部分摘抄下来. 第一章,未来的挑战 如何定义未来? 大部分人定义的未来都只是现在的简单延伸而已,其实技术的改变是人们无法预料的.   简单来说,没有质变的话,时间再久也不能叫未来.比如60年代的人想像21世纪,大部分都觉得人们会在太空旅行,或者当时的某些科技更发达了,这些东西的来源其实只是当时的影视剧,又或者是当时已经有的东西的简单扩展.实际上现在最大的发展却是手机和互联网,这是当时无论如何也想不到的,这就是量变和质变的区别.这…
37款传感器与执行器的提法,在网络上广泛流传,其实Arduino能够兼容的传感器模块肯定是不止这37种的.鉴于本人手头积累了一些传感器和执行器模块,依照实践出真知(一定要动手做)的理念,以学习和交流为目的,这里准备逐一动手尝试系列实验,不管成功(程序走通)与否,都会记录下来---小小的进步或是搞不定的问题,希望能够抛砖引玉. [Arduino]168种传感器模块系列实验(资料+代码+图形+仿真) 实验五十八: HC-SR04超声波测距传感器模块(5针宽电压) 超声波探头是在超声波检测过程中发射和…
目录 一.来源 研究一:Draft genome sequence of adzuki bean, Vigna angularis 研究二:Genome sequencing of adzuki bean (Vigna angularis) provides insight into high starch and low fat accumulation and domestication 二.研究一(小豆基因组草图) 基因组组装 基因与重复序列预测 小豆驯化痕迹 标记开发及育种应用 红豆基因…
目录 1.GWAS模型 1.1卡方检验 1.2 相关性系数的t检验 1.3 一般线性模型GLM 1.4 混合线性模型MLM 1.5 压缩混合线性模型CMLM 1.6 SUPER 1.7 FarmCPU 1.8 Blink 2.GS模型 2.1 MAS 2.2 GBLUP 2.3 GBLUP的扩展(ssBLUP,sBLUP,cBLUP) 2.4 rrBLUP 2.5 rrBLUP的扩展(Bayes类) 2.6 BLUP vs Bayes 3.GWAS和GS模型比较 最近看了不少统计基因组方面的资料…
相关文章:随笔<一个程序猿的生命周期>- 逆潮流而动的“叛逆者”        15年前,依稀记得走出大山,进城求学的场景.尽管一路有父亲的陪伴,但是内心仍然畏惧.当父亲转身离去.准备回到大山里的时候,使我深深感到彷徨.迷茫.无助.......一切的一切都得靠自己,同时我也深深的知道从此离开了封闭的.面朝黄土背朝天的命运.难道他们不曾想过改变这种命运吗?他们把希望都寄托在了孩子身上,我的逃离对于他们是一种寄托.         父母咨询别人,给我选择了计算机专业,对于我来讲完全陌生:第二年(2…
林牧 + 原创作品转载请注明出处 + <软件工程(C编码实践篇)>MOOC课程http://mooc.study.163.com/course/USTC-1000002006 软件工程的理解:       软件工程是一门研究用工程化方法构建和维护有效的.实用的和高质量的软件的学科.它涉及到程序设计语言.数据库.软件开发工具.系统平台.标准.设计模式等方面.在现代社会中,软件应用于多个方面.典型的软件有电子邮件.嵌入式系统.人机界面.办公套件.操作系统.编译器.数据库.游戏等.同时,各个行业几乎…
GWAS的数据形式:SNP数据,即各个SNP位点的aa,Aa,AA基因型与疾病状态(0正常,1患病)的样例-对照数据. 在遗传流行病学上,全基因组关联研究(Genome Wide Association Studies,GWAS)是一种检测特定物种中不同个体间的全部或大部分基因,从而了解不同个体间的基因变化有多大的一种方法.不同的变化带来不同的性状,如各种疾病的不同. 这些研究通常比较两组参与者的DNA:有疾病的人(病例)和相同条件的无该疾病的人(对照).每个人都提供些作为样本的细胞,如从口腔内…
事件简单回顾: 1.2017年8月28日,大疆宣布“大疆威胁识别奖励计划”,最高3万美元: 2.然而在此之前,大疆农业事业部某员工将企业私有源代码上传到了github: 3.就职于大疆竞对公司Department13公司的美国人Kevin Finisterre向大疆提交了一份31页的报告,列出了他与其同事找到的漏洞,包括通过github找到的大疆AWS的SSL凭证密钥的漏洞: 4.Finisterre表示,在系统中他能够获取的资料包括“未加密的飞行日志,护照,驾驶许可证以及个人身份证明”: 5.…