Variation calling and annotation】的更多相关文章

Resequencing 302 wild and cultivated accessions identifies genes related to domestication and improvement in soybean 本文摘自<Resequencing 302 wild and cultivated accessions identifies genes related to domestication and improvement in soybean> Variation…
医学.机器学习等等,在统计结果时时长会用到这两个指标来说明数据的特性. 定义 敏感性:在金标准判断有病(阳性)人群中,检测出阳性的几率.真阳性.(检测出确实有病的能力) 特异性:在金标准判断无病(阴性)人群中,检测出阴性的几率.真阴性.(检测出确实没病的能力) 假阳性率:得到了阳性结果,但这个阳性结果是假的.即在金标准判断无病(阴性)人群中,检测出为阳性的几率.(没病,但却检测结果说有病),为误诊率. 假阴性率:得到了阴性结果,但这个阴性结果是假的.即在金标准判断有病(阳性)人群中,检测出为阴性…
转载:http://blog.csdn.net/soyabean555999/article/details/62235577 一.转录组还是基因组? map常用的工具有bowtie/bowtie2, BWA,SOAP1/SOAP2等.这个问题又会被分成两个问题,是基因组测序(DNA-seq)还是转录组测序(mRNA-seq).其中的区别是对于真核生物而言,mRNA序列与DNA序列并不完全相同,在经历了后剪切之后,成熟的mRNA可能是原基因的一部分,甚至顺序及个别碱基会产生变化.如果是mRNA测…
需要长期更新! 参考:生信修炼手册 enhancer的基本概念: 长度几十到几千bp,作用是提高靶基因活性,属于顺式作用原件,DNA作用到DNA,转录因子就是反式,是结合到DNA的蛋白. 1981年,Benerji发现SV40中某个140bp的序列可以显著提高血红蛋白融合基因的表达水平. 特性:远距离效应,无方向性. 如何鉴定enhancer区域: 对多个转录因子的peak区域进行聚类,识别增强子区域 将H3K4me1和K3K27ac这两种组蛋白修饰作为增强子区的mark 使用II型RNA聚合酶…
原文地址:http://hannesdorfmann.com/annotation-processing/annotationprocessing101 In this blog entry I would like to explain how to write an annotation processor. So here is my tutorial. First, I am going to explain to you what annotation processing is, w…
找的好辛苦呀 原文地址:https://dzone.com/articles/spring-annotation-processing-how-it-works If you see an annotation, there must be some code somewhere to process it. One of the things I emphasize when I teach Java classes is the fact that annotations are inert…
More info see: https://msdn.microsoft.com/en-us/library/hh916383.aspx Simply stated, SAL is an inexpensive way to let the compiler check your code for you. The Microsoft source-code annotation language (SAL) provides a set of annotations that you can…
http://www.concretepage.com/spring-4/spring-4-ehcache-configuration-example-with-cacheable-annotation   Spring 4 Ehcache Configuration Example with @Cacheable Annotation By Arvind Rai, March 16, 2015 In this page, we will learn Spring 4 Ehcache confi…
@Target(value={METHOD,ANNOTATION_TYPE}) @Retention(value=RUNTIME) @Documented public @interface Bean Indicates that a method produces a bean to be managed by the Spring container. Overview The names and semantics of the attributes to this annotation…
In computer science, a calling convention is an implementation-level (low-level) scheme for how subroutines receive parameters from their caller and how they return a result. Differences in various implementations include where parameters, return val…
SpringBoot集成Shiro报错 UnavailableSecurityManagerException: No SecurityManager accessible to the calling code [已解决] 调试了好久,网上找了很多方法,,哎,太特么难受了,当知道原因的时候,,一万只草泥马在奔腾... 废话不多说,言归正传: 1.报错日志信息 org.apache.shiro.UnavailableSecurityManagerException: No SecurityMan…
原文地址:https://www.javacodegeeks.com/2015/04/spring-enable-annotation-writing-a-custom-enable-annotation.html Spring provides a range of annotations with names starting with Enable*, these annotations in essence enable certain Spring managed features t…
After you understand how C-level extensibility works in Dreamweaver and its dependency on certain data types and functions, it’s useful to know how to build a library and call a function. The following example requires the following five files, locat…
Java注解是附加在代码中的一些元信息,用于一些工具在编译.运行时进行解析和使用,起到说明.配置的功能.注解不会也不能影响代码的实际逻辑,仅仅起到辅助性的作用 下面我们来详细说说这个注解,到底是怎么一回事,一步一步看下去,总会后收获. 注解起源:Annotation(注解)是JDK5.0及以后版本引入的.在java.lang.annotation包中. 注解作用:它可以用于创建文档,跟踪代码中的依赖性,甚至执行基本编译时检查. 注解格式:注解是以‘@注解名’在代码中存在的 注解分类:标记注解.单…
前言: 最近学习了EventBus.BufferKinfe.GreenDao.Retrofit 等优秀开源框架,它们新版本无一另外的都使用到了注解的方式,我们使用在使用的时候也尝到不少好处,基于这种想法我觉得有必要对注解有个更深刻的认识,今天中午把公司的项目搞完了,晚上加个班学习总结一下Java的注解. 什么是注解? 对于很多初次接触的开发者来说应该都有这个疑问?Annontation是Java5开始引入的新特征,中文名称叫注解.它提供了一种安全的类似注释的机制,用来将任何的信息或元数据(met…
@(Java)[Annotation|Java] Java Annotation概述 用途 编译器的相关信息,如用于检测错误和一些警告 编译时和部署时的处理,如一些软件用于自动生成代码之类的 运行时处理 自定义注解 和接口的定义类似,只是用@interface来标识,注解中包含的属性可以具有默认值,如下: @Retention(RetentionPolicy.RUNTIME) @Target(ElementType.FIELD) public @interface ActivityMetadat…
一.新建一个工程hibernate_02_HelloWorld_Annotation(复制01工程并重命名); 二.新建一个实体类teacher.java,数据库中新建teacher表; import javax.persistence.Column; import javax.persistence.Entity; import javax.persistence.GeneratedValue; import javax.persistence.Id; import javax.persist…
struts2使用annotation注意事项 1.包名只能以.action .actions  .struts  .struts2结尾.如:com.cnbolgs.web.actions 2.类名只能以Action结尾.如: userAction,loginAction…
什么是Data Annotation ? 如何使用 ? 自定义Validate Attribute EF  Db first中使用Data Annotation asp.net MVC中使用Data Annotation 什么是Data Annotation ? 貌似没听过,但肯定见过 所属程序集:System.ComponentModel.DataAnnotations DataAnnotation code: public class Product { [Required] [String…
1.导入jar包时,要在xml配置基础上加 spring-aop-4.2.2.RELEASE.jar (注解的时候需要) 2.编写controller的时候要annotation需要做相关配置即红色部分,而xml就是要实现controller的接口 (a)annotation配置时 package com.spring.hello; import javax.servlet.http.HttpServletRequest; import javax.servlet.http.HttpServle…
从回帖的反应来看,大多数人还是不赞成完全代替XML的,这点倒是在意料之中.我个人还是倾向于用代码来取代XML的Bean定义,当然这更多的是关乎个人偏好,不代表与我观点不同的人就是错的. 先来说说代码相对于XML的优点吧:    1. 更加简洁,相对于XML的"语法",java来得更熟悉    2. 类型安全,更大程度上发挥java静态语言的特性    3. 对重构更加友好 再说说用annotation代替XML的可能性吧,目前看来是不大可能,主要还存在以下的限制: 1. java的语言…
很久之前写过两篇博客: spring3.0使用annotation完全代替XML spring3.0使用annotation完全代替XML(续) 用java config来代替XML,当时还遗留下一些问题: <tx:annotation-driven />声明性事务等配置无法用简单代码来实现 web.xml无法去掉 随着servlet 3.0规范以及spring3.1.M2的发布,现在以上的问题也解决了. 先来说说web.xml,有两种方法来替代 (一)annotation @WebServl…
@Service与@Component有什么不同?那天被问到这个问题,一时之间却想不起来,就利用这篇文章来纪录spring3.0中常用的annotation. 从spring2.5开始,annotation结合BeanPostProcessor成了扩展Spring IoC容器的常用方法.Spring2.5增加了对JSR-250中@Resource, @PostConstruct, @PreDestroy的支持,Spring 3.0又增加了对JSR-330 (Dependency Injectio…
f you are not familiar with MySQL stored procedures or want to review it as a refresher, you can follow the MySQL stored procedures tutorial. We will create two stored procedures for the demonstration in this tutorial. The first stored procedure gets…
先创建注解 OperInfo @Target({ElementType.TYPE, ElementType.METHOD}) @Retention(RetentionPolicy.RUNTIME) @Documented @Inherited public @interface OperInfo { public String description() default "";//操作说明 } 然后创建AOP的切面类 LogAspect public class LogAspect {…
package com.example.ele_me.util; import java.lang.annotation.Retention; import java.lang.annotation.Target; import java.lang.annotation.ElementType;  import java.lang.annotation.RetentionPolicy;  /** * Use this annotation to mark the fields of your A…
package com.example.ele_me.activity; import android.annotation.SuppressLint; import android.app.Activity; import android.content.Intent; import android.os.Bundle; import android.view.View; import android.view.View.OnClickListener; import android.view…
使用注解最主要的部分在于对注解的处理,那么就会涉及到注解处理器.      从原理上讲,注解处理器就是通过反射机制获取被检查方法上的注解信息,然后根据注解元素的值进行特定的处理.   注解处理器类库(java.lang.reflect.AnnotatedElement): Java使用Annotation接口来代表程序元素前面的注解,该接口是所有Annotation类型的父接口.除此之外,Java在java.lang.reflect 包下新增了AnnotatedElement接口,该接口代表程序…
转载:https://segmentfault.com/a/1190000007623013 简介 注解,java中提供了一种原程序中的元素关联任何信息.任何元素的途径的途径和方法. 注解是那些插入到源代码中使用其他工具可以对其进行处理的标签.注解不会改变程序的编译方式.java编译器会对包含注解与不包含注解的代码生成相同的虚拟机指令.在java中,注解是被当做修饰符(如public/static之类)来使用的. 注解与注释 注释是供人看的,注解是供程序调用的.一种是程序员写给另一个程序员的,一…
上篇文章介绍了反射的一些基础知识以及应用案例,本文将介绍jdk 1.5 出现的新特性——Annotation也就是我们所说的注解,即使用注释的方式加入一些程序的信息. 注解相当于一种标记,在程序中加了注解就等于为程序打上了某种标记,没加,则等于没有某种标记. Java.lang.annotation. Annotation 接口是所有的Annotation都必须实现的接口.下面我们将从系统的三个内建Annotation开始学习. 内建Annotation ♥ @Overrider :复写的Ann…