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使用python进行kmeans聚类 假设我们要解决一个这样的问题. 以下是一些同学,大萌是一个学霸,而我们想要找到这些人中的潜在学霸,所以我们要把这些人分为两类--学霸与非学霸. 高数 英语 Python 音乐 小明 88 64 96 85 大明 92 99 95 94 小朋 91 87 99 95 大朋 78 99 97 81 小萌 88 78 98 84 大萌 100 95 100 92 1 方法一:使用scipy 那么使用scipy的Python实现的代码如下: import numpy…
获取聚类结果中每一类的数据,该数据类型是DataFrame 思路:获取clf_KMeans的标签,我这里是聚三类,标签就是0,1,2 将Label转成Series类型,再筛选出指定标签的res0,我筛选了1 最后在DataFrame里获取Label为1的数据 import pandas as pdfrom sklearn.cluster import KMeans # 建立模型.n_clusters参数用来设置分类个数,即K值,这里表示将样本分为两类. clf_KMeans = KMeans(n…
编程中在做数值相等判断的时候,直接使用==判断并不可靠.实际上经过运算后的两个值(浮点型)并不可能完全一致,可能会因为小数点后的些许差异导致判断为false. 比如: 1 print 1e-5 == 1e-6 //这肯定是false,但是实际这两个值可以看作近似相等. 在kmeans中判断是否结束循环,就是判断重新计算的聚类中心点是否和原聚类中心点一致,实际上新旧聚类中心点之间会有一个可允许的误差.修改代码如下: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17…
# -*- coding: utf-8 -*- """ Created on Thu Mar 16 14:52:58 2017 @author: Jarvis """ import tensorflow as tf import numpy as np import pandas as pd import math import random from pandas import Series,DataFrame def cal_dis(a,b)…
K-means聚类 的 Python 实现 K-means聚类是一个聚类算法用来将 n 个点分成 k 个集群. 算法有3步: 1.初始化– K 个初始质心会被随机生成 2.分配 – K 集群通过关联到最近的初始质心生成 3.更新 –重新计算k个集群对应的质心 分配和更新会一直重复执行直到质心不再发生变化. 最后的结果是点和质心之间的均方差达到最小. 以 k=3 为例演示这个过程: 初始化 分配: 更新: 重新分配: 可以看到一个红色的点,变成了绿色的:一个蓝色的点变成了红色的. 我们更加接近最终…
Python进行KMeans聚类是比较简单的,首先需要import numpy,从sklearn.cluster中import KMeans模块: import numpy as np from sklearn.cluster import KMeans 然后读取txt文件,获取相应的数据并转换成numpy array: X = [] f = open('rktj4.txt') for v in f: regex = re.compile('\s+') X.append([float(regex…
Python实现kMeans(k均值聚类) 运行环境 Pyhton3 numpy(科学计算包) matplotlib(画图所需,不画图可不必) 计算过程 st=>start: 开始 e=>end: 结束 op1=>operation: 读入数据 op2=>operation: 随机初始化聚类中心 cond=>condition: 是否聚类是否变化 op3=>operation: 寻找最近的点加入聚类 op4=>operation: 更新聚类中心 op5=>o…
生物信息学原理作业第五弹:K-means聚类的实现. 转载请保留出处! K-means聚类的Python实现 原理参考:K-means聚类(上) 数据是老师给的,二维,2 * 3800的数据.plot一下可以看到有7类. 怎么确定分类个数我正在学习,这个脚本就直接给了初始分类了,等我学会了再发. 下面贴上Python代码,版本为Python3.6. # -*- coding: utf-8 -*- """ Created on Wed Dec 6 16:01:17 2017 @…
来源:, init='k-means++', n_init=10, max_iter=300, tol=0.0001, precompute_distances='auto', verbose=0, random_state=None, copy_x=True, n_jobs=1, algorithm='auto' ) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 参数的意义: n_clusters:簇的个数,即你想聚成几类 init: 初始簇中心的获取方法 n_init: 获取初始簇中…
K-means聚类算法(事先数据并没有类别之分!所有的数据都是一样的) 1.概述 K-means算法是集简单和经典于一身的基于距离的聚类算法 采用距离作为相似性的评价指标,即认为两个对象的距离越近,其相似度就越大. 该算法认为类簇是由距离靠近的对象组成的,因此把得到紧凑且独立的簇作为最终目标. 2.核心思想 通过迭代寻找k个类簇的一种划分方案,使得用这k个类簇的均值来代表相应各类样本时所得的总体误差最小. k个聚类具有以下特点:各聚类本身尽可能的紧凑,而各聚类之间尽可能的分开. k-means算…