单细胞转录组确实是利器,但我们大多只利用了表达的信息,而从reads到表达之间的信息完全被我们忽略了. 最近nature发了一篇单细胞方法类文章,讲得就是如何利用RNA velocity来做细胞发育路径的推断. velocyto velocyto-notebooks RNA velocity of single cells 首先需要了解一些基本概念: RNA velocity:the time derivative of the gene expression state—can be dire…

视频  https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition  J.D. Watson et. al 调控RNA 一.细菌中RNA介导的调控 sRNA对翻译的激活与抑制 色氨酸trp操纵子 色氨酸浓度高时: 先导核糖体顺利通过先导RNA的两个Trp密码子 占据位置2 位置3.4形成发夹 形成衰减子(4后面有polyU终止信号) 色氨酸浓度低时: 先导核糖体被两个Trp密码子阻滞…

生命组学 按照功能分类遗传物质,可能的分类有系统流.操作流.平衡流等等.下面是使用该理论解释DNA与RNA的关系: DNA和RNA有很大不同,DNA存储遗传信息,作为生命活动的最内核物质,如同操作系统内核一样,因而被称为系统流.依据中心法则得到的翻译得到RNA,RNA再翻译成蛋白质,蛋白质用于生命活动,所以RNA是随着生命活动不断转移和改变的,故被称为操作流.为了满足不同生命活动的需要,RNA变得比DNA灵活许多.但是DNA作为遗传物质的内核,必须保证一定的稳定性,否则生物形态就不可能在一段时间…

原始地球 你会想,我们每一个细胞中都有一个遗传分子叫做DNA?那么,DNA之前有没有什么遗传分子呢?我的答案是:"有".在远古地球,那个海底有无数火山,喷发的火山口两侧都是喷涌出的滚烫岩浆与那冰冷的海水瞬间凝固产生的"深海黑烟囱",在这些物质所形成的空隙大小,刚好是一个细胞这么大,你说怎么就这么巧呢?他们是海水中的硫化物与海水中的二氧化碳,水合成所形成的有机物.但是!我们仔细想想就会发现,"深海黑烟囱"所喷发的黑烟一般都是呈碱性,但海水又呈酸性,…

单细胞在脑科学方面的应用 Session 1: Deciphering the Cellular Landscape of the Brain Using Single Cell Transcriptomics Single cell/nucleus transcriptomics has emerged as a powerful approach to classify cell types and dynamic cell states in any multicellular organ…

UI层复习笔记 在main文件中,UIApplicationMain函数一共做了三件事 根据第三个参数创建了一个应用程序对象 默认写nil,即创建的是UIApplication类型的对象,此对象看成是整个应用程序的一个抽象,负责存储应用程序的状态. 根据第四个参数创建了一个应用程序代理类对象 所谓代理,及帮助另一个对象做事情.上面第一步中创建的应用程序对象只负责存储应用程序的状态,但不提供响应,而是给代理发消息,由代理负责针对不同的状态提供响应.比如说:程序一启动,代理就要响应一下,说明弹出的第…

关于POPDecayAnimation的介绍先引用别人写的一些内容,基本上把它的一些注意点都说明了: Decay Animation 就是 POP 提供的另外一个非常特别的动画,他实现了一个衰减的效果.这个动画有一个重要的参数 velocity(速率),一般并不用于物体的自发动画,而是与用户的交互共生.这个和 iOS7 引入的 UIDynamic 非常相似,如果你想实现一些物理效果,这个也是非常不错的选择. Decay 的动画没有 toValue 只有 fromValue,然后按照 veloci…

http://web.jobbole.com/84962/     首页 所有文章 JavaScript HTML5 CSS 基础技术 前端职场 工具资源 更多频道▼ - 导航条 - 首页 所有文章 JavaScript HTML5 CSS 基础技术 前端职场 工具资源 更多频道▼ - iOS - Java - Android - Python     伯乐在线 > WEB前端 - 伯乐在线 > 所有文章 > JavaScript > ReactNative Animated动画详…

文献:Sahraeian S M E, Mohiyuddin M, Sebra R, et al. Gaining comprehensive biological insight into the transcriptome by performing a broad-spectrum RNA-seq analysis[J]. Nature Communications, 2017, 8(1):59. 这是一篇在NC上发表的使用RNAseq工具对比的一篇文献,解读这篇文献对我们使用RNAseq…

关节 布料 关节 铰链关节(Hinge     Joint):将两个物体以链条的形式绑在一起,当力量过大超过链条的固定力矩时,两个物体就会产生相互的拉力. 固定关节(Fixed     Joint):将两个物体永远以相对的位置固定在一起,即使发生物理改变,它们之间的相对位置也不会发生改变. 弹簧关节(Spring     Joint):将两个物体以弹簧的形式绑定在一起,挤压它们会得到 向外的推力,拉伸它们会得到两边对中间的拉力.  铰链关节(HingeJoint) 在  Unity3D  基本关…