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在字符串处理当中,后缀树和后缀数组都是非常有力的工具,其中后缀树大家了解得比较多,关于后缀数组则很少见于国内的资料.其实后缀是后缀树的一个非常精巧的替代品,它比后缀树容易编程实现,能够实现后缀树的很多功能而时间复杂度也不太逊色,并且,它比后缀树所占用的空间小很多.可以说,在信息学竞赛中后缀数组比后缀树要更为实用.因此在本文中笔者想介绍一下后缀数组的基本概念.构造方法,以及配合后缀数组的最长公共前缀数组的构造方法,最后结合一些例子谈谈后缀数组的应用. 基本定义:子串 字符串 S 的子串 r[i..…
参考: Suffix array - Wiki 后缀数组(suffix array)详解 6.3   Suffix Arrays - 算法红宝书 Suffix Array 后缀数组 基本概念 应用:字符串处理.生物信息序列处理 后缀:学过英语的都知道什么叫后缀,就是从某个位置开始到字符串结尾的特殊子串,记住 Suffix(i)=S[i...len(S)-1],i就是后缀起始位置 后缀数组:就是将后缀排序好后放到一个一维数组里,SA[i]存放排名第i大的后缀首字符下标,并且保证 Suffix(SA…
写在前面 在字符串处理当中,后缀树和后缀数组都是非常有力的工具. 其中后缀树大家了解得比较多,关于后缀数组则很少见于国内的资料. 其实后缀数组是后缀树的一个非常精巧的替代品,它比后缀树容易编程实现, 能够实现后缀树的很多功能而时间复杂度也不太逊色,并且,它比后缀树所占用的空间小很多. 可以说,在信息学竞赛中后缀数组比后缀树要更为实用! 因此在本文中笔者想介绍一下后缀数组的基本概念.构造方法, 以及配合后缀数组的最长公共前缀数组的构造方法,最后结合一些例子谈谈后缀数组的应用. 一.What  Is…
摘要:本文讨论了最长公共子串的的相关算法的时间复杂度,然后在后缀数组的基础上提出了一个时间复杂度为o(n^2*logn),空间复杂度为o(n)的算法.该算法虽然不及动态规划和后缀树算法的复杂度低,但其重要的优势在于可以编码简单,代码易于理解,适合快速实现. 首先,来说明一下,LCS通常指的是公共最长子序列(Longest Common Subsequence,名称来源参见<算法导论>原书第3版p223),而不是公共最长子串(也称为最长公共子串). 最长公共子串问题是在文本串.模式串中寻找共有的…
\(\\\) 定义 介绍一些写法和数组的含义,首先要知道 字典序 . \(len\):字符串长度 \(s\):字符串数组,我们的字符串存储在 \(s[0]...s[len-1]\) 中. \(suffix(i) ,i\in[0,len-1]\): 表示子串 \(s[i]...s[len-1]\),即从 \(i\) 开始的后缀 . 加入我们提取出了 \(suffix(1)...suffix(len-1)\) ,将他们按照字典序从小到达排序. \(sa[i]\) :排名为 \(i\) 的后缀的第一个…
倍增算法,时间复杂度O(nlogn) sa从小到大保存相对大小的下标 理解LSD,x数组,sa数组 char s[maxn]; int sa[maxn],t[maxn],t2[maxn],c[maxn],n; void build_sa(int m) { //LSD基数排序 int *x=t,*y=t2;//x数组保存rank //字串长度为1,即对每一个元素的大小排序 for(int i=0;i<m;++i) c[i]=0;//计数数组清空 for(int i=0;i<n;++i) c[x[…
传送门:http://www.lydsy.com/JudgeOnline/problem.php?id=1692 题意: 给出一个长度为N的字符串,每次可以从串头或串尾取一个字符,添加到新串中,使新串的字典序最小. 做法: 经过推导(略),发现只要贪心地取两端字典序较小的一端,所以在一开始对所有的正反后缀排序,即把原串倒过来接在后面求一遍SA就行了. 写了个倍增求SA[]+height[]的板子,代码可能比较长,但相对来说可能容易理解一点... #include <bits/stdc++.h>…
议题:后缀数组(Suffix Array) 分析: 后缀树和后缀数组都是处理字符串的有效工具,前者较为常见,但后者更容易编程实现,空间耗用更少:后缀数组可用于解决最长公共子串问题,多模式匹配问题,最长回文串问题,全文搜索等问题: 后缀数组的基本元素: 给定一个string,其长度为L,后缀指的是从string的某一个位置i(0<=i<L)开始到串末尾(string[L-1])的一个子串,表示为suffix(i): L个suffix(i)按照字典顺序排列并顺序存储在一个数组SA[L]中,则SA[…
倍增算法 基本定义子串:字符串 S 的子串 r[i..j],i≤j,表示 r 串中从 i 到 j 这一段也就是顺次排列 r[i],r[i+1],...,r[j]形成的字符串. 后缀:后缀是指从某个位置 i 开始到整个串末尾结束的一个特殊子串. 字串 r 的 从 第 i 个 字 符 开 始 的 后 缀 表 示 为 Suffix(i) , 也 就 是Suffix(i)=r[i..len(r)]. 后缀数组:后缀数组 SA 是一个一维数组,它保存 1..n 的某个排列 SA[1],SA[2],……,S…
后缀数组 顾名思义.SuffixArray(下面有时简称SA) 和字符串的后缀有关. 后缀:字符串中某个位置一直到结尾的子串.(SA中讨论包含了原串和空串).所以共同拥有len+1个后缀. 后缀数组: 字符串的全部后缀组成的按字典序从小到大排好的数组.因为SA中记录的都是字符串的后缀,所以SA仅仅须要记录其表示的后缀的起始位置. 因为比較字典序是O(n)的,所以暴力算法的复杂度将是O(n^2logn).通过一些算法能够降到线性复杂度.这里先介绍一种简单的O(nlognlogn)的算法. 该算法的…
题目大意 给定后缀数组sa,要求构造出满足sa数组的字符串.或输出无解\(n\leq 5*10^5\) 题解 我们按照字典序来考虑每个后缀 对于\(Suffix(sa[i])\)和\(Suffix(sa[i-1])\) 我们一定知道\(Suffix(sa[i-1])<Suffix(sa[i])\). 如果我们有\(Suffix(sa[i-1]+1)<Suffix(sa[i]+1)\) 那么\(sa[i]\)和\(sa[i-1]\)两个位置上的字符相等时也满足条件 那么从贪心的角度来讲我们就让\…
模板 后缀数组 #include<bits/stdc++.h> #define R register int using namespace std; const int N=1e6+9; int sa[N],rk[N],hei[N],x[N],y[N],c[N]; char s[N]; void Rsort(R n,R m){ for(R i=1;i<=n;++i)++c[x[i]]; for(R i=2;i<=m;++i)c[i]+=c[i-1]; for(R i=n;i;--…
题面 Description 话说练习后缀数组时,小C 刷遍 poj 后缀数组题, 各类字符串题闻之丧胆.就在准备对敌方武将发出连环杀时,对方一记无中生有,又一招顺 手牵羊,小C 程序中的原字符数组就被牵走了.幸运的是,小C 早已经求出了 SA[],为了 能东山再起,迅速 A 掉此题,他希望各位忠臣们能帮忙求出一组原字符数组的可行方案.已 知原字符数组由小写拉丁字母组成.且小C的SA[]也是有可能求错的, 原数组可能不存在. Input 输入文件只有一行且为用空格隔开的一个正整数 N. 接下来一…
本文首发于知乎专栏:https://zhuanlan.zhihu.com/p/60141207 也同步更新于我的个人博客:https://www.cnblogs.com/nickwu/p/12567789.html 4. [三维+]:数组(Array) R语言中数组可以看做是矩阵的扩展,它将矩阵扩展到2维以上.如果给定的数组是1维的则相当于向量,2维的相当于矩阵.R语言中的数组元素的类型也是单一的,可以是数值型,逻辑型,字符型或复数型等. R语言中数组的使用 4.1 数组的创建 语法:array…
参考资料:victorique的博客(有一点锅无伤大雅,记得看评论区),$wzz$ 课件(快去$ftp$%%%),$oi-wiki$以及某个人的帮助(万分感谢!) 首先还是要说一句:我不知道为什么我这么菜让我讲这么大神的知识点,我理解不深刻,你们可以随时$Ha(n)ck$然后我可能就fix不了了你知道吧 (好吧我大概又理解了因为数学是NC讲的数据结构是skyh讲的我能讲的可能也就是这种东西了) 希望还会的大神帮我解场...(某$bx$和某牛都$A$穿了) 顺便「无图预警」(懒得画又懒得粘) 当时…
后缀数组的倍增算法(Prefix Doubling) 文本内容除特殊注明外,均在知识共享署名-非商业性使用-相同方式共享 3.0协议下提供,附加条款亦可能应用. 最近在自学习BWT算法(Burrows-Wheeler transform),其中涉及到对字符串循环移位求编码.直观的办法就是模拟,使用O(n3)的时间求出BWT编码.经过简单的简化后也要O(n2logn)的时间,显然当字符串长度很大时这种方法的效率很低. 由于循环移位的结果类似后缀(二者有所不同,所以在字符串结尾添加了一个字典序严格小…
#1403 : 后缀数组一·重复旋律 时间限制:5000ms 单点时限:1000ms 内存限制:256MB 描述 小Hi平时的一大兴趣爱好就是演奏钢琴.我们知道一个音乐旋律被表示为长度为 N 的数构成的数列. 小Hi在练习过很多曲子以后发现很多作品自身包含一样的旋律.旋律是一段连续的数列,相似的旋律在原数列可重叠.比如在1 2 3 2 3 2 1 中 2 3 2 出现了两次. 小Hi想知道一段旋律中出现次数至少为K次的旋律最长是多少? 解题方法提示 输入 第一行两个整数 N和K.1≤N≤2000…
后缀数组四·重复旋律4 时间限制:5000ms 单点时限:1000ms 内存限制:256MB 描述 小Hi平时的一大兴趣爱好就是演奏钢琴.我们知道一个音乐旋律被表示为长度为 N 的数构成的数列.小Hi在练习过很多曲子以后发现很多作品中的旋律有重复的部分. 我们把一段旋律称为(k,l)-重复的,如果它满足由一个长度为l的字符串重复了k次组成. 如旋律abaabaabaaba是(4,3)重复的,因为它由aba重复4次组成. 小Hi想知道一部作品中k最大的(k,l)-重复旋律. 解题方法提示 输入 一…
涉及到字符串的问题,无外乎这样一些算法和数据结构:自动机 KMP算法 Extend-KMP 后缀树 后缀数组 trie树 trie图及其应用.当然这些都是比较高级的数据结构和算法,而这里面最常用和最熟悉的大概是kmp,即使如此还是有相当一部分人也不理解kmp,更别说其他的了.当然一般的字符串问题中,我们只要用简单的暴力算法就可以解决了,然后如果暴力效率太低,就用个hash.当然hash也是一个面试中经常被用到的方法.这样看来,这样的一些算法和数据结构实际上很少会被问到,不过如果使用它们一般可以得…
694. Distinct Substrings Problem code: DISUBSTR   Given a string, we need to find the total number of its distinct substrings. Input T- number of test cases. T<=20;Each test case consists of one string, whose length is <= 1000 Output For each test c…
永恒的大牛,kuangbin,膜拜一下,Orz 链接:http://www.cnblogs.com/kuangbin/archive/2013/04/23/3039313.html Musical Theme Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 30000K Total Submissions: 14334   Accepted: 4945 Description A musical melody is represented as a sequence of…
描述 我们定义一个字符串的后缀suffix(i)表示从s[i]到s[length(s)]这段子串.后缀数组(Suffix array)SA[i]中存放着一个排列,满足suffix(sa[i])<suffix(sa[i+1]) 按照字典序方式比较定义height[i]表示suffix(sa[i])与suffix(sa[i-1])之间的最长公共前缀长度,其中height[1]=0你的任务就是求出SA和height这两个数组.字符串长度<=200000 输入格式 一行,为描述中的字符串(仅会出现小写…
题意: 求两个串的最长连续子串. 我的想法: 枚举第二个串...在第一个串的后缀数组中二分查找. 复杂度NlogN.最坏情况N^2 题解: (3)height 数组:定义height[i]=suffix(SA[i-1])和suffix(SA[i])的最长公共前缀,也就是排名相邻的两个后缀的最长公共前缀. (4) h[i]=height[rank[i]],也就是suffix(i)和在它前一名的后缀的最长公共前缀. (5)LCP(i,j):对正整数i,j 定义LCP(i,j)=lcp(Suffix(…
题意:问a串中有多少种字符串集合B中没有的连续子串. a的长度10^5,B中的总长度为不超过10^5. 解法:后缀数组题目:后缀数组能够非常easy算出来一个串中有多少种子串. 把a和B集合连起来.求一次不同子串数量,然后减掉B相互连起来的数量. 在求时候,要减掉含有链接符的子串,方法是扫一遍,枚举最后出现的连接符. 代码: /****************************************************** * @author:xiefubao ***********…
以后似乎终于不用去学后缀数组的倍增搞法||DC3等blablaSXBK的方法了= = 定义(来自关于后缀数组的那篇国家集训队论文..) 后缀数组:后缀数组SA是一个一维数组,它保存1..n的某个排列SA[1],SA[2],……,SA[n],并且保证Suffix(SA[i])<Suffix(SA[i+1]),1≤i<n. 也就是将S的n个后缀从小到大进行排序之后把排好序的后缀的开头位置顺次放入SA中. height数组:定义height[i]=suffix(sa[i-1])和suffix(sa[…
后缀树: 字符串匹配算法一般都分为两个步骤,一预处理,二匹配. KMP和AC自动机都是对模式串进行预处理,后缀树和后缀数组则是对文本串进行预处理. 后缀树的性质: 存储所有 n(n-1)/2 个后缀需要 O(n) 的空间,n 为的文本(Text)的长度: 构建后缀树需要 O(dn) 的时间,d 为字符集的长度(alphabet): 对模式(Pattern)的查询需要 O(dm) 时间,m 为 Pattern 的长度: 介绍后缀树之前,我们首先要知道压缩字典树的概念. 我们在对关键字建立字典树的时…
显然我们可以先把len(Ti)+len(Tj)的值先算出来,再把LCP减去.所有len(Ti)+len(Tj)的值为n*(n-1)*(n+1)/2,这个随便在纸上画一画就可以算出来的. 接下来问题就是如何把LCP减去.我们先用后缀数组把height求出来,当有一段区间l~r,height[i]为height[l]~height[r]中的最小值,那么随便取rk[l]~rk[r]中的两个后缀,他们的LCP则都是height[i],这个很好理解吧.那么l~r这个区间里有(l-i+1)*(r-i+1)对…
题意:有N(1 <= N <=20000)个音符的序列来表示一首乐曲,每个音符都是1..88范围内的整数,现在要找一个重复的主题. “主题”是整个音符序列的一个子串,它需要满足如下条件:1.长度至少为5个音符2.在乐曲中重复出现(可能经过转调,“转调”的意思是主题序列中每个音符都被加上或减去了同一个整数值.)3.重复出现的同一主题不能有公共部分. 链接:点我先转化成相邻两项的差值,然后就是找不可重叠重复子串.做法就是二分答案LEN然后根据height值进行分组 第一道后缀数组题,测了一下模板…
后缀数组倍增算法超时,听说用3DC可以勉强过,不愿写了,直接用hash+二分求出log(n)的时间查询两个字符串之间的任意两个位置的最长前缀. 我自己在想hash的时候一直在考虑hash成数值时MOD取多大,如果取10^18的话,那么两数相乘个就超LL了,但是取10^9的话又怕出现重复的可能大.后面才发现自己是sb,如果用unsigned long long 如果有溢出或者为负数是直接变成对(1<<64)取模了. 也就是无符号长整形运算自动帮你取模了.所以可以放心用hash Justice S…
#1579 : Reverse Suffix Array 时间限制:1000ms 单点时限:1000ms 内存限制:256MB 描述 There is a strong data structure called "Suffix Array" which can effectively solve string problems. Let S=s1s2...sn be a string and let S[i,j] denote the substring of S ranging f…