一.关于程序: FUN:计算FASTA文件中每条序列中G和C的含量百分比,输出最大值及其id INPUT:FASTA格式文件 >seq1 CGCCGAGCGCTTGACCTCCAGCAAGACGCCGTCTGGCACATGCAACGAGCTGTAGCAGAC >seq2 ATGCCTAGAACGTTCGAGACTTCTCGGGTGCGGTAGAATTAGCCATTCGACCGACTTCCA GCATCTGCGAGCCGCCTGTTGATTGCATCCGCCGGGGACGCAACAAGGCAAG…

1.测试例子: 需要导入的外部jar包: 相关API http://www.coderanch.com/how-to/javadoc/itext-2.1.7/com/lowagie/text/package-summary.html 推荐博客相关参考资料: http://www.cnblogs.com/linjiqin/p/3539283.html import java.awt.Color; import java.io.FileNotFoundException; import java.i…

题目: 随便给定一条序列,如果GC含量超过65%,则认为高. 编程: from __future__ import division #整数除法 def is_gc_rich(dna): length = len(dna) G_count = dna.upper().count('G') C_count = dna.upper().count('C') GC_content = (G_count + C_count) / length if GC_content > 0.65: print('G…

一.MP4格式基本概念 MP4格式对应标准MPEG-4标准(ISO/IEC14496) 二.MP4封装格式核心概念 1  MP4封装格式对应标准为 ISO/IEC 14496-12(信息技术 视听对象编码的第12部分: ISO 基本媒体文件格式/Information technology Coding of audio-visual objects Part 12: ISO base media file format) 附-- 标准免费下载: Freely Available Standar…

[流媒體]H264—MP4格式及在MP4文件中提取H264的SPS.PPS及码流 SkySeraph Apr 1st 2012  Email:skyseraph00@163.com 一.MP4格式基本概念 MP4格式对应标准MPEG-4标准(ISO/IEC14496) 二.MP4封装格式核心概念 1  MP4封装格式对应标准为 ISO/IEC 14496-12(信息技术 视听对象编码的第12部分: ISO 基本媒体文件格式/Information technology Coding of aud…

一.MP4格式基本概念 MP4格式对应标准MPEG-4标准(ISO/IEC14496) 二.MP4封装格式核心概念 1  MP4封装格式对应标准为 ISO/IEC 14496-12(信息技术 视听对象编码的第12部分: ISO 基本媒体文件格式/Information technology Coding of audio-visual objects Part 12: ISO base media file format) 附-- 标准免费下载: Freely Available Standar…

使用JSON 模块中的 decode_json 函数,将json文件中的数据解码为perl 中的对象,然后进行处理 代码如下: #!/usr/bin/env perl use JSON; use Encode; my ($json) = @ARGV; my $context; open TXT, $json or die "Can't open $json!\n"; while (<TXT>) { $context .= $_; } close TXT; my $obj =…

可以通过文件句柄和<<运算符将文件内容写入到文件中去 #!usr/bin/perl -W use strict; use Spreadsheet::ParseExcel; use utf8; #引入utf8模块 脚本内的字符串使用utf8作为编码格式 binmode(STDOUT,":encoding(gbk)"); #标准输出使用gbk作为编码格式,也可以把gbk改为gb2312 binmode(STDIN,":encoding(gbk)"); #如果…

在分析中经常需要统计fasta/fastq文件的序列数和碱基数, 但是没有找到一些专门做这件事的小工具,可能是这个功能太简单了: 之前用自己写的perl的脚本统计这些信息, 当fastq文件非常大时,就变的很慢: 今天在网上搜到kseq.h可以parse fasta/fastq文件,用C写的, 速度很快: http://lh3lh3.users.sourceforge.net/parsefastq.shtml 自己试了一下, 在这个基础上添加个小功能, 命名为parse.c: #include…

转自:http://blog.csdn.net/timothyfly/article/details/7826139 osg格式文件中如何处理多个节点共享一个子节点 下面一段程序中,共有三个Group类型根节点:root,grp1和grp2:两个Geode类型节点:geode1和geode2.他们之间的从属关系是:grp1,grp2和geode2是root的孩子,geode1和geode2是grp1的孩子,geode2是grp2的孩子. .osg格式的文件存储像geode2这个的节点时,采用'U…