文献名:Comparing Data-Independent Acquisition and Parallel Reaction Monitoring in Their Abilities To Differentiate High-Density Lipoprotein Subclasses(比较DIA和PRM区分高密度脂蛋白亚类的能力) 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:2019年11月 IF:3.78 单位: 圣保罗大学 Universidade…

文献名:Systematic comparison of strategies for the enrichment of lysosomes by data independent acquisition(通过DIA技术系统比较各溶酶体富集策略) 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:(2020年1月) IF:4.268 单位: 德国波恩大学 瑞士Biognosys公司 物种:HEK293细胞 技术:数据非依赖性采集(DIA)   一. 概述: 本研究基于…

文献名:Data-independent acquisition mass spectrometry in metaproteomics of gut microbiota - implementation and computational analysis(DIA技术在肠道宏蛋白质组研究中的方法实现和数据分析) doi: 10.1021/acs.jproteome.9b00606 期刊名:Journal of Proteome Research 作者:Juhani Akakko, Sami…

文献名:Utilization of the Proteome Data Deposited in SRMAtlas for Validating the Existence of the Human Missing Proteins in GPM(利用SRMAtlas中的已有的蛋白质组数据验证GPM中人类缺失蛋白的存在) 期刊名:journal of proteome 发表时间:2019.10.24 IF:3.780 单位: 1.日本Niigata大学 2.开罗Al-Azhar大学 物种:人类…

文献名:Integration and analysis of CPTAC proteomics data in the context of cancer genomics in the cBioPortal 期刊名:Molecular & Cellular Proteomics 发表时间:2019年9月 IF:4.828 作者: Pamela Wu1,2,3, Zachary J Heins4, James T Muller3, Lizabeth Katsnelson3, Ino de Br…

发表时间:2019年4月 IF:5.232 一. 概述: 分支杆菌索状因子TDM(trehalose-6,6’-dimycolate)能够与巨噬细胞C-型凝集素受体(CLR)MINCLE结合引起下游通路变化.本文对TDM处理的巨噬细胞磷酸化蛋白质组进行定量分析,发现了依赖于MINCLE的信号通路和MINCLE非依赖的信号通路,两种信号通路具有不同的生物功能. 二. 研究背景:(简要介绍研究进展动态.研究目的和意义) 巨噬细胞对分支杆菌的识别依赖于TLR.CLR以及分支杆菌核酸.TDM是细胞壁主要…

目录 1. 简介 2. 近几年发表的主要工具 1.DeepRT 2.Prosit 3. DIANN 4.DeepDIA 1. 简介 基于串联质谱的蛋白质组学大部分是依赖于数据库(database search)的bottom-up策略研究.也就是实际谱图和理论谱图进行匹配打分,从而实现肽段和蛋白的鉴定和定量.如果是DDA的数据,因为一张二级谱是一条肽段,直接将数据库理论酶切碎裂后的理论谱和实际谱图匹配即可.但如果是DIA的数据,因为二级谱是混合谱,即来源于很多肽段,而且碎片离子还会受到未碎裂的母…

前言 关于蛋白质组学,你是不是已经听了太多公司的宣讲,介绍了一大堆的技术名词,反而越听越懵懂,脑袋一团乱麻?就和传话游戏一样,当我们接收了多手信息以后,得到的信息就越不准确.那么,何不自己看一看第一手信息呢?比如说DIA. 这里只推荐两篇综述. 第一篇是蛋白质组学泰山北斗的Ruedi Aebersold和Matthlas Mann合作发的,该文不止介绍DIA,是对整个目前蛋白质组的bottom-up得研究策略做的一个总结和展望. 整个bottom-up的蛋白质组学研究流程如下图所示: 第二篇也是…

http://blog.packagecloud.io/eng/2016/06/22/monitoring-tuning-linux-networking-stack-receiving-data/ Jun 22, 2016 • packagecloud Tags: packagecloud linux kernel networking optimization tuning monitoring TL;DR This blog post explains how computers runn…

A novel massively parallel supercomputer of hundreds of teraOPS-scale includes node architectures based upon System-On-a-Chip technology, i.e., each processing node comprises a single Application Specific Integrated Circuit (ASIC). Within each ASIC n…

ABSTRACT Recent technological advancement have led to a deluge of data from distinctive domains (e.g., health care and scientific sensors, user-generated data, Internet and financial companies, and supply chain systems) over the past two decades. The…

https://github.com/onurakpolat/awesome-bigdata A curated list of awesome big data frameworks, resources and other awesomeness. Inspired by awesome-php, awesome-python, awesome-ruby, hadoopecosystemtable & big-data. Your contributions are always welco…

AN2548 -- 使用 STM32F101xx 和 STM32F103xx 的 DMA 控制器 DMA控制器 DMA是AMBA的先进高性能总线(AHB)上的设备,它有2个AHB端口: 一个是从端口,用于配置DMA,另一个是主端口,使得DMA可以在不同的从设备之间传输数据. DMA的作用是在没有Cortex-M3核心的干预下,在后台完成数据传输. 在传输数据的过程中,主处理器可以执行其它任务,只有在整个数据块传输结束后, 需要处理这些数据时才会中断主处理器的操作. 它可以在对系统性能产生较小影响…

文献名:Data-independent acquisition improves quantitative cross-linking mass spectrometry (DIA方法可提升定量交联质谱分析) 期刊名:Mol Cell Proteomics 发表时间:(2019年4月) IF:5.232 单位: 1.      德国柏林技术大学生物技术研究所 2.      英国爱丁堡大学生命科学学院 3.      瑞典 Biognosys 公司 技术:DIA交联质谱定量 一.概述:(用精炼…

BACKGROUND  1. Field  The embodiments of the disclosure generally relate to computer clusters, and more particularly to systems, methods, and devices for the efficient management of resources of computer clusters.  2. Description of the Related Art …

Data Management ObjectivesBy the end o this module, you should understand the fundamentals of data management, including:1.Explain typical data management operations.2.Describe typical user cases for inserting system fields.3.List the ways to obtain…

场景4 Data Warehouse Management 数据仓库 parallel 4 100% —> 必须获得指定的4个并行度,如果获得的进程个数小于设置的并行度个数,则操作失败 parallel_min_percent : 若设为100,则如上 ILM :信息生命周期管理 将休眠的数据高压缩放在低成本通道上(如磁带机) 将低访问量的数据低压缩放在访问效率低的设备上 将高访问数据不作压缩放在访问效率高的设备上 分区 (官方文档VLDB and Partioning Guide) 单张表容量…

原文发布于我的微信公众号: GeekArtT. 从CFA到如今的Data Science/Deep Learning的学习已经有一年的时间了.期间经历了自我的兴趣.擅长事务的探索和试验,有放弃了的项目,有新开辟的路线,有有始无终的遗憾,也有还在继续的坚持.期间有数不清的弯路.失落,有无法一一道明的挫败和孤独,也有每日重复单调训练而积累起来的自信与欣喜.和朋友聊天让我意识到,将我目前所摸索到的一些材料和路径分享出来,使其他想要进入这个领域的人或者仅仅是兴趣爱好者能够少走一些弯路,大概是有些意义的.…

1.vagrant建立简单httpserver方法: 1)映射端口 修改Vagrantfile, 末尾添加本地端口和虚机端口的映射关系, 然后执行vagrant reload. Vagrant::Config.run do |config| # Forward guest port 8000 to host port 8000 config.vm.forward_port 8000, 8000 end 需新增端口映射,只需增加 config.vm.forward_port 80, 8080 2)…

--Comparing data between two tables in SQL Server --Create two Tables-- CREATE TABLE TableA(ID Int, ProuctName Varchar(256)) GO CREATE TABLE TableB(ID Int, ProuctName Varchar(256)) GO INSERT INTO TableA VALUES(1,'A') INSERT INTO TableA VALUES(2,'B')…

并行计算 沿用微软的写法,System.Threading.Tasks.Parallel类,提供对并行循环和区域的支持. 我们会用到的方法有For,ForEach,Invoke. Program.Data = new List<int>(); ; i < ; i++) { Data.Add(i); } 下面我们定义4个方法,分别为for,foreach,并行For,并行ForEach.并测试他们的运行时长. /// <summary> /// 是否显示执行过程 /// <…

Real-Time SQL Monitoring可以在sql运行的时候监控其性能. 缺省情况下,单个sql执行花费的CPU或I/O时间超过5秒或sql并行执行的时候,Real-Time SQL Monitoring会自动启动. 可以通过视图v$sql_monitor.v$sql_plan_monitor来查看sql语句运行时的统计信息. 在结合以下视图,可以获取更多的信息: v$active_session_history.v$session.v$session_longops.v$sql.v$…

C# 4.0 并行计算部分   沿用微软的写法,System.Threading.Tasks.::.Parallel类,提供对并行循环和区域的支持. 我们会用到的方法有For,ForEach,Invoke. 一.简单使用 首先我们初始化一个List用于循环,这里我们循环10次.(后面的代码都会按这个标准进行循环) Code Program .Data = new List <int >(); for (int i = 0; i < 10; i++) { Data.Add(i); } 下面…

大家好,本次讨论的是C#中的并行开发,给力吧,随着并行的概念深入,哥也赶上这个潮流了,其实之前讨论C#的异步调用或者C#中BeginInvoke或者Invoke都已经涉及了部分本篇的内容. 参考书目:Professional.C#.4.0.and.NET.4.pdf 以及 Pro .NET 4 Parallel Programming in C#.pdf Parallel Program in C#中有Delegate的Asynchronous也有Thread的Asynchronous,前者已经…

先来个对比图看一下, 左边图是普通 rsync 目录拷贝, 右边图是借助 parallel 工具并发起了多个 rsync centos6.5安装 parallel #!/bin/bash # Install parallel on CentOS . # Assumes you are root. Prefix w/ sudo if not. cd /etc/yum.repos.d/ #wget http://download.opensuse.org/repositories/home:tang…

waylau/netty-4-user-guide: Chinese translation of Netty 4.x User Guide. 中文翻译<Netty 4.x 用户指南> https://github.com/waylau/netty-4-user-guide Rich Buffer Data Structure 丰富的缓冲实现 · GitBook https://waylau.com/netty-4-user-guide/Architectural%20Overview/Ric…

using System; using System.Collections.Concurrent; using System.Collections.Generic; using System.Linq; using System.Threading; using System.Threading.Tasks; namespace Try { public class ParallelTest { #region 分区块并行执行 public static void TestPartition…

waylau/netty-4-user-guide: Chinese translation of Netty 4.x User Guide. 中文翻译<Netty 4.x 用户指南> https://github.com/waylau/netty-4-user-guide Rich Buffer Data Structure 丰富的缓冲实现 · GitBook https://waylau.com/netty-4-user-guide/Architectural%20Overview/Ric…

In my last article, I stated that for practitioners (as opposed to theorists), the real prerequisite for machine learning is data analysis, not math. One of the main reasons for making this statement, is that data scientists spend an inordinate amoun…

数据科学是一个大领域,如果你想成为一个优秀的数据专家,自学是必要的技能. MOOCs是数据科学的主要来源.有许多网站提供了 MOOCs,比如Coursera.Coursera和Udacity都还不错.无论您的语言是R.python.Java还是c/c++,MOOCs都有涵盖. 如果你是一个初学者,并且了解数据科学到底是什么,或者你成为下一个前沿领域的专家. 这里提供几个公开课列表,您可以根据自己的情况去学习. 关于这些课程资源的一些的指导说明: 你需要考虑到需要的条件,决定所需的学时和持续时间看…