1.什么是BWT 压缩技术主要的工作方式就是找到重复的模式,进行紧密的编码. BWT(Burrows–Wheeler_transform)将原来的文本转换为一个相似的文本,转换后使得相同的字符位置连续或者相邻,之后可以使用其他技术如:Move-to-front transform 和 游程编码 进行文本压缩. 2.BWT原理 2.1 BWT编码 (1)首先,BWT先对需要转换的文本块,进行循环右移,每次循环一位.可以知道长度为n的文本块,循环n次后重复,这样就得到看n个长度为n的字符串.如下图中…

参考: BWT (Burrows–Wheeler_transform)数据转换算法 压缩技术主要的工作方式就是找到重复的模式,进行紧密的编码. BWT(Burrows–Wheeler_transform)将原来的文本转换为一个相似的文本,转换后使得相同的字符位置连续或者相邻,之后可以使用其他技术如:Move-to-front transform 和 游程编码 进行文本压缩. 1 BWT编码 (1)首先,BWT先对需要转换的文本块,进行循环右移,每次循环一位.可以知道长度为n的文本块,循环n次后重…

BWT (Burrows–Wheeler_transform)数据转换算法 MTF(Move-to-front transform)数据转换 基于统计的压缩算法:游程编码 良心PPT: bwt_based_compression_verbin.ppt BWT Idea: 压缩技术主要的工作方式就是找到重复的模式,进行紧密的编码. BWT(Burrows–Wheeler_transform)将原来的文本转换为一个相似的文本,转换后使得相同的字符位置连续或者相邻: 之后可以使用其他技术如:Move-…

BWT KMP Boyer-Moore BWT [IR] BWT+MTF+AC 中已经介绍了BWT (Burrows–Wheeler_transform)数据转换算法, 这种变换方式不仅方便压缩,同时对pattern search也带来了意想不到的好处. 事实上,BWT形式的数据,可以仅还原局部数据,而非必须还原完整的文件. Left Symbol #Less Than A 0 B 3 N 4 [ 6 ] 7 Right Position Symbol #Matching(idx) B   +-…

BWT(Burrows-Wheeler Transformation) 1.什么是BWT 压缩技术主要的工作方式就是找到重复的模式,进行紧密的编码. BWT(Burrows–Wheeler_transform)将原来的文本转换为一个相似的文本,转换后使得相同的字符位置连续或者相邻,之后可以使用其他技术如:Move-to-front transform 和 游程编码 进行文本压缩. 2.BWT原理 2.1 BWT编码 (1)首先,BWT先对需要转换的文本块,进行循环右移,每次循环一位.可以知道长度…

Hive.Spark SQL.Impala比较        Hive.Spark SQL和Impala三种分布式SQL查询引擎都是SQL-on-Hadoop解决方案,但又各有特点.前面已经讨论了Hive和Impala,本节先介绍一下SparkSQL,然后从功能.架构.使用场景几个角度比较这三款产品的异同,最后附上分别由cloudera公司和SAS公司出示的关于这三款产品的性能对比报告.1. Spark SQL简介        Spark SQL是Spark的一个处理结构化数据的程序模块.与其…

http://www.cnblogs.com/dadadechengzi/p/6226071.html 1,列表推导(没当要对序列中的内容进行循环处理时,就应该尝试使用列表推倒) 在python中编写如下的代码是让人痛苦和不高效已经简洁美观的. numbers = range(10) evens = [] for i in numbers: if i % 2 == 0: evens.append(i) print evens 毫无疑问,在python中它确实会使得程序的执行速度变得慢了(它使解释…

摘要:如何搭建数据仓库,在这个过程中都应该遵循哪些方法和原则,项目实践中有哪些技巧. 一.数据仓库的“心脏” 首先来谈谈数据模型.模型是现实世界特征的模拟和抽象,比如地图.建筑设计沙盘,飞机模型等等. 而数据模型DataModel是现实世界数据特征的抽象. 在数据仓库项目建设中,数据模型的建立具有重要的意义,客户的业务场景,流程规则,行业知识都体现在通过数据模型表现出来,在业务人员和技术人员之间搭建起来了一个沟通的桥梁,所以在国外一些数据仓库的文献中,把数据模型称之为数据仓库的心脏“TheHea…

原文:重新想象 Windows 8 Store Apps (32) - 加密解密: 非对称算法, 数据转换的辅助类 [源码下载] 重新想象 Windows 8 Store Apps (32) - 加密解密: 非对称算法, 数据转换的辅助类 作者:webabcd介绍重新想象 Windows 8 Store Apps 之 加密解密 非对称算法(RSA) 签名和验证签名(RSA) 通过 CryptographicBuffer 来实现 string hex base64 binary 间的相互转换 示例…

DNA比对算法:BWT BWT算法,实质上是前缀树的一种实现.那么什么是前缀树呢? 一.前缀树 对于问题p in S?如果S=rpq,那么p为S前缀rp的一个后缀. 于是,为了判断p in S 是否成立,我们找到S的所有前缀,然后逐一判断p是不是它们的后缀.为了加快效率,我们将所有的前缀建成一颗树,这棵树便是前缀树.下面,我们举例说明前缀树的建立过程和如何使用前缀树进行模式匹配. 前缀树的建立 假设S='acaacg',p='aac',那么我们首先找到S的所有前缀,如下 a ac aca aca…