DIA】的更多相关文章

http://www.cnblogs.com/xbinworld/p/4273506.html 稀疏矩阵是指矩阵中的元素大部分是0的矩阵,事实上,实际问题中大规模矩阵基本上都是稀疏矩阵,很多稀疏度在90%甚至99%以上.因此我们需要有高效的稀疏矩阵存储格式.本文总结几种典型的格式:COO,CSR,DIA,ELL,HYB. (1)Coordinate(COO) 这是最简单的一种格式,每一个元素需要用一个三元组来表示,分别是(行号,列号,数值),对应上图右边的一列.这种方式简单,但是记录单信息多(行…
稀疏矩阵是指矩阵中的元素大部分是0的矩阵,事实上,实际问题中大规模矩阵基本上都是稀疏矩阵,很多稀疏度在90%甚至99%以上.因此我们需要有高效的稀疏矩阵存储格式.本文总结几种典型的格式:COO,CSR,DIA,ELL,HYB. (1)Coordinate(COO) 这是最简单的一种格式,每一个元素需要用一个三元组来表示,分别是(行号,列号,数值),对应上图右边的一列.这种方式简单,但是记录单信息多(行列),每个三元组自己可以定位,因此空间不是最优. (2)Compressed Sparse Ro…

DIA

Dia Tutorial: http://www.seanet.com/~hgg9140/comp/diatut/all/all.html Dia Tutorial…
官网:https://wiki.gnome.org/Apps/Dia [root@ok Software]# wget --limit-rate=100k ftp://ftp.gnome.org/pub/gnome/sources/dia/0.96/dia-0.96.1.tar.bz2 ---- ::-- ftp://ftp.gnome.org/pub/gnome/sources/dia/0.96/dia-0.96.1.tar.bz2 => “dia-.tar.bz2” Resolving ft…
[转]http://navkirats.blogspot.hk/2014/10/dia-diagram-mac-osx-yosemite-fix-i-use.html I use the Dia tool for all my diagramming work. I have worked with many tools, but find Dia the easiest to use and is the most responsive, apart from it being a great…
ubuntu 中 软件  dia 可以替代 ms-visio软件. 安装过程可以在线安装: sudo apt-get install dia…
SBCL编译过程 - O.Nixie的专栏 - 博客频道 - CSDN.NET PS2: 这篇文章中的图片绘图工具使用的是Dia (sudo apt-get install dia).据说yEd也很不错.…
我是执行一下命令安装的 sudo apt-get install dia sudo apt-get install dia 打开软件后发现不能输入中文,网上搜索一圈后找到以下解决方案 sudo vim /usr/bin/dia sudo vim /usr/bin/dia 然后把 dia-gnome --integrated "$@" dia-gnome --integrated "$@" 修改成 dia-gnome  "$@" dia-gnome…
1● di 使~ 变成 :两个,两,       2● dia 穿过,二者之间…
解决方法: 以管理员权限打开/usr/bin/dia ,做如下修改 #dia-gnome --integrated "$@" dia-gnome "$@"…
安装dia后无法输入中文,解决如下: 修改/usr/bin/dia #dia-normal --integrated "$@" dia-normal "$@"…
一款非常不错的软件Dia,软件很小,免费.好用.跨平台(linux.windows.mac).可导出多种格式图片,除了流程图.UML建模图,还可以绘制其他很多图. ubuntu下可以直接通过命令行sudo apt-get install dia即可安装,windows的可以去官方网站下载:http://dia-installer.de/index.html.en…
文献名: DIAlignR provides precise retention time alignment across distant runs in DIA and targeted proteomics(DIAlignR 为DIA和靶向蛋白质组学提供了准确的保留时间对齐的算法) 期刊名:MCP 发表时间:(2019年1月) 单位: 多伦多大学 斯坦福大学   一. 概述:(用精炼的语言描述文章的整体思路及结果) 我们提出了一种新的保留时间算法,直接比对原始swathm – ms的二级色…
文献名:Data-independent acquisition improves quantitative cross-linking mass spectrometry (DIA方法可提升定量交联质谱分析) 期刊名:Mol Cell Proteomics 发表时间:(2019年4月) IF:5.232 单位: 1.      德国柏林技术大学生物技术研究所 2.      英国爱丁堡大学生命科学学院 3.      瑞典 Biognosys 公司 技术:DIA交联质谱定量 一.概述:(用精炼…
文献名:Proteome Analysis of Human Neutrophil Granulocytes From Patients With Monogenic Disease Using Data-independent Acquisition(单基因疾病患者中性粒细胞的DIA蛋白质组分析) 期刊名:Mol Cell Proteomics 发表时间: (2019年4月) IF:5.232 单位: 德国柏林工业大学生物技术研究所 德国慕尼黑 Dr.vonHauner儿童医院 物种:人类中性…
近期工作各种繁忙,导致很少分享自己喜欢和常用的一些工具,今天有点时间再次给各位喜欢开源的小伙伴介绍一个好用.免费.开源的软件Dia Diagram Editor. 首先给大家看看这个软件的主界面吧! ​ ​ 下载地址1:https://sourceforge.net/projects/dia-installer/ ​ 下载地址1:http://dia-installer.de/ ​ 最后说说Dia Diagram Editor他有哪些优势吧! 开源.免费 支持多平台(Windows.MacOS.…
linux下一款不错的流程图工具:dia.安装此工具:1.打开终端(快捷键:ctrl+alt+t).2.输入命令: $sudo apt-get install dia 3.提示“解压缩后会消耗掉 20.9 MB 的额外空间.您希望继续执行吗?[Y/n]”,输入“y”,等待,安装完成.卸载此工具:(1).输入命令:$sudo apt-get autoremove dia.(2).提示“解压缩后将会空出30.4MB的空间.您希望继续执行吗?[Y/n]”,输入“y”,等待,卸载完成. 假入无法输入中文…
linux下一款不错的流程图工具:dia. dia是一款非常优秀的制图工具,可以用于绘制 类图,流程图等等 安装此工具: 1.打开终端(快捷键:ctrl+alt+t). 2.输入命令:$sudo apt-get install dia. 3.提示“解压缩后会消耗掉 20.9 MB 的额外空间.您希望继续执行吗?[Y/n]”,输入“y”,等待,安装完成. 卸载此工具: 1.输入命令:$sudo apt-get autoremove dia. 2.提示“解压缩后将会空出30.4MB的空间.您希望继续…
文献名:Data-independent acquisition mass spectrometry in metaproteomics of gut microbiota - implementation and computational analysis(DIA技术在肠道宏蛋白质组研究中的方法实现和数据分析) doi: 10.1021/acs.jproteome.9b00606 期刊名:Journal of Proteome Research 作者:Juhani Akakko, Sami…
文献名:Systematic comparison of strategies for the enrichment of lysosomes by data independent acquisition(通过DIA技术系统比较各溶酶体富集策略) 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:(2020年1月) IF:4.268 单位: 德国波恩大学 瑞士Biognosys公司 物种:HEK293细胞 技术:数据非依赖性采集(DIA)   一. 概述: 本研究基于…
文献名:Comparing Data-Independent Acquisition and Parallel Reaction Monitoring in Their Abilities To Differentiate High-Density Lipoprotein Subclasses(比较DIA和PRM区分高密度脂蛋白亚类的能力) 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:2019年11月 IF:3.78 单位: 圣保罗大学 Universidade…
目录 1. 简介 2. 近几年发表的主要工具 1.DeepRT 2.Prosit 3. DIANN 4.DeepDIA 1. 简介 基于串联质谱的蛋白质组学大部分是依赖于数据库(database search)的bottom-up策略研究.也就是实际谱图和理论谱图进行匹配打分,从而实现肽段和蛋白的鉴定和定量.如果是DDA的数据,因为一张二级谱是一条肽段,直接将数据库理论酶切碎裂后的理论谱和实际谱图匹配即可.但如果是DIA的数据,因为二级谱是混合谱,即来源于很多肽段,而且碎片离子还会受到未碎裂的母…
前言 关于蛋白质组学,你是不是已经听了太多公司的宣讲,介绍了一大堆的技术名词,反而越听越懵懂,脑袋一团乱麻?就和传话游戏一样,当我们接收了多手信息以后,得到的信息就越不准确.那么,何不自己看一看第一手信息呢?比如说DIA. 这里只推荐两篇综述. 第一篇是蛋白质组学泰山北斗的Ruedi Aebersold和Matthlas Mann合作发的,该文不止介绍DIA,是对整个目前蛋白质组的bottom-up得研究策略做的一个总结和展望. 整个bottom-up的蛋白质组学研究流程如下图所示: 第二篇也是…
官方文档: https://biognosys.com/media.ashx/spectronautmanual.pdf 0. 准备 Spectronaut软件是蛋白组DIA分析最常用的谱图解析软件之一,优点是定量准确,缺点是高额收费,window版本,速度慢.一起来简单了解下用法. 这是它的界面.只要理解了DIA流程,用法其实很简单,首先构建谱图库,或者导入已建好的DDA谱图库,再导入DIA原始文件,配置好参数,最后run即可. 一开始需要准备的是各种数据,包括:DIA的rawdata,DDA…
为大家分享一下个人的一个Utils系统帮助类,可能有些现在有新的技术替代,自行修改哈~ 这个帮助类主要包含:对象转换处理 .分割字符串.截取字符串.删除最后结尾的一个逗号. 删除最后结尾的指定字符后的字符. 生成指定长度的字符串. 生成日期随机码. 生成随机字母或数.字 截取字符长度. 对象<-->JSON 4.0使用.  对象<-->JSON 2.0使用litjson插件.  DataTable<-->JSON. List<--->DataTable. 清…
本文转载自:https://www.codeproject.com/articles/11132/walking-the-callstack Download demo project with source - 64.2 Kb Introduction In some cases you need to display the callstack of the current thread or your are just interested in the callstack of othe…
发博客时,总免不了要用图片说话.经过长时间的磨合,在 Linux 桌面系统下有几款图片处理软件我已经用得比较顺手了.这几款软件在 Linux 世界使用广泛,各个 Linux 发行版的软件仓库中都有自带的安装包,而且这几款软件运行稳定.界面美观.特在这里推荐给大家. 请看我的桌面,左边的 Luancher 中下面的五个图标就是我今天要介绍的五款图片处理工具: 一.截图工具 gnome-screenshot 这个软件不用自己安装,它是 Gnome 桌面自带的截图软件,一般在 Linux 系统安装完成…
回到目录 一般sso的说明 在Lind.DDD框架里,有对单点登陆的集成,原理就是各个网站去sso网站统一登陆授权,之后在sso网站将登陆的token进行存储,存储方式随你(cache,redis,mongodb,file),之后业务平台在访问资源时,如果这些资源需要用户登陆才能访问,就会去sso网站取token,再根据token去凭证,然后将cookies(由sso域名+token值组成)存储到自己浏览器的cookies里,同时在自己的业务平台也存储的登陆状态,当退出后,将sso上存储的信息清…
--函数GetHzFullPY(string)用于获取汉字字符串的拼音 --select GetHzFullPY('中华人民共和国') from dual; --返回:ZhongHuaRenMinGongHeGuo --函数GetHzPYCAP(string)用于获取拼音首字母 --select GetHzPYCAP('中华人民共和国') from dual; --返回ZHRMGHG create or replace package GetHZPY is -- Author : ADMINIS…
A.Phillip and Trains CodeForces 586D 题意:过隧道,每次人可以先向前一格,然后向上或向下或不动,然后车都向左2格.问能否到达隧道终点. 题解:dp,一开始s所在列如果前方为'.'则dp[i]=1.r[i]代表上一次的dp[i]值. 如果该行当前可行,那么它就可以更新它上下两行(如果有),必须用r[i]去更新. 再判断每行在当前时间是否会发生撞车:看看位置 i+t*2,i+t*2+1,i+t*2+2 是否有车. #include <iostream> #inc…