弗雷塞斯从生物学到生物信息学到机器学习转录组入门(3)：了解fastq测序数据

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弗雷塞斯从生物学到生物信息学到机器学习转录组入门(3)：了解fastq测序数据

sra文件转换为fastq格式 1 fastq-dump -h --split-3 也就是说如果SRA文件中只有一个文件,那么这个参数就会被忽略.如果原文件中有两个文件,那么它就会把成对的文件按*_1.fastq,*_2.fastq这样分开.如果还出现了第三个文件,就意味着这个文件本身是未成配对的部分.可能是当初提交的时候因为事先过滤过了一下,所以有一部分数据被删除了. --gzip 输出文件压缩成gzip格式(通常gzip仅用来压缩单个文件.多个文件的压缩归档通常是首先将这些文件合并成一个…

机器学习简易入门（四）- logistic回归

摘要:使用logistic回归来预测某个人的入学申请是否会被接受声明:(本文的内容非原创,但经过本人翻译和总结而来,转载请注明出处) 本文内容来源:https://www.dataquest.io/mission/59/logistic-regression 原始数据展示这是一份美国入学申请的录取记录表,admit – 是否录取,1代表录取,0代表否定:gpa – gpa成绩,gre – 绩点 import pandas admissions = pandas.read_csv('adm…

[ZZ]机器学习的入门

转载自: http://www.cnblogs.com/mq0036/p/7131678.html 本篇虽不是这一个月的流水账,但是基本按照下面的思路对着一个月做了一次总结: 什么是机器学习? 机器学习都有什么算法? 个人对机器学习的三种境界理解推荐的学习路线推荐资源希望读者有所收获,另外,如果文中有任何理解上的错误,还望指正! 什么是机器学习? 之前在没有具体接触到机器学习前,我大概对他有一个概念上的认识,觉得是一种很高级的算法,能让机器学会很多的事情,就像...<我的机器人女友>里那…

Andrew Ng机器学习算法入门(一):简介

简介最近在参加一个利用机器学习来解决安全问题的算法比赛,但是对机器学习的算法一直不了解,所以先了解一下机器学习相关的算法. Andrew Ng就是前段时间从百度离职的吴恩达.关于吴恩达是谁,相信程序员/媛都知道. Andrew Ng的机器学习的公开课其实就是当年吴恩达还在斯坦福大学时在coursera上面开设的一门机器学习的入门的公开课,课程地址链接为Andrew Ng机器学习公开课 Andrew Ng机器学习公开课的评价,可以参考知乎上面的问题如何评价 Coursera 的机器学习 (And…

.NET平台机器学习组件-Infer.NET(三) Learner API—数据映射与序列化

所有文章分类的总目录:http://www.cnblogs.com/asxinyu/p/4288836.html 微软Infer.NET机器学习组件:http://www.cnblogs.com/asxinyu/p/4329742.html 关于本文档的说明本文档基于Infer.NET 2.6对Infer.NET User Guide进行中文翻译,但进行了若干简化和提炼,按照原网站的思路进行,但不局限与其顺序. 欢迎传播分享,必须保持原作者的信息,但禁止将该文档直接用于商业盈…

python机器学习《入门》

写在前面的废话: 好吧,不得不说鱼C的markdown文本编辑器挺不错的,功能齐全.再次感谢小甲鱼哥哥的python视频让我去年大三下学期的时候入门了编程,爱上了编程这门语言,由于是偏冷门的统计学,在实习以后就决定把方向放在数据挖掘方面了,越来越发现专业课的重要性.在大家都忙着参加各种培训的日子里面,我就在去年寒冷的冬天把甲鱼哥的python视频一字不落的看完了:现在,在别人拼命参加校招的日子里,我就来学习“机器学习”这里面的算法了(ps:工科学校的理科妹子表示很难找到数据分析工作,人家只要研究…

Spark MLBase分布式机器学习系统入门：以MLlib实现Kmeans聚类算法

1.什么是MLBaseMLBase是Spark生态圈的一部分,专注于机器学习,包含三个组件:MLlib.MLI.ML Optimizer. ML Optimizer: This layer aims to automating the task of ML pipeline construction. The optimizer solves a search problem over feature extractors and ML algorithms included inMLI and…