生信笔记-mooc【武大】】的更多相关文章

.DNA拓扑学 在拓扑结构的限制下,DNA进行复制等过程.还有连环数=扭转数+缠绕数. 2.拓扑异构酶 DNA变性破坏了两条链之间碱基形成的氢键.和拓扑异构酶是不同的. 3.RNA的组成和结构特点 RNA的生物学功能. 4.DNA复制叉 复制只能由5'端到3'端(磷酸->五碳糖),DNA新链的起始需要一条RNA引物.本质是因为DNA聚合酶需要带有游离3'-OH的引物,而这个正好可以由引物酶现在DNA上合成一段短的RNA引物,这个引物可以提供(引物大约5-10个核苷酸). 那么在DNA完成复制以后…
各种生信工具: https://omictools.com/…
非原创 参考资料: 一文掌握GO和pathway分析 - 生物信息学讨论版 -丁香园论坛http://www.dxy.cn/bbs/thread/34904124#34904124 GO富集 GO是Gene ontology的缩写,GO数据库分别从功能.参与的生物途径及细胞中的定位对基因产物进行了标准化描述,即对基因产物进行简单注释,通过GO富集分析可以粗略了解差异基因富集在哪些生物学功能.途径或者细胞定位. Pathway Pathway指代谢通路,对差异基因进行pathway分析,可以了解实…
http://mp.weixin.qq.com/s/nK1Kkf9lfZStoX25Y7SzHQ 这篇文章主要适用于Linux平台,当然MacOS也行,不过它有更好安装方法. 此外网上也会许多更好的关于biconda的教程,这里还是抛砖应用,提供一种除了编译源码和直接下载二进制文件外安装生信软件的一种思路 bioconda是什么 官方介绍是: Bioconda is a channel for the conda package manager specializing in bioinform…
本文首发于“生信补给站”公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/ZEjaxDifNATeV8fO4krOIQ更多关于R语言,ggplot2绘图,生信分析的内容,敬请关注小号. 为了能更方便的查看,检索,对文章进行了精心的整理.建议收藏,各取所需,当前没用也许以后就用到了呢! 一 R资料+计划 R语言精品资料年中无套路赠送 R-plotly|交互式甘特图(Gantt chart)-项目管理/学习计划 二 Bioinfo R|fastqcr QC数据处理 :测序结果的数据质控及…
使用NCBI进行目的基因的引物设计 全文概述 利用生信工具进行目的基因的引物设计,使用了NCBI进行筛选与设计引物,使用 idtdna对筛选出的DNA进行检查.本文分享了如何筛选出高质量的基因引物,帮助想通过生信进行引物设计的学生.从业者找出合适的基因,毕竟购买引物也比较烧钱,避免设计出的基因质量偏低. NCBI查找基因 1.查询目的基因:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=zbed3 备注:这里需要注意的是,要找到合适的目的基因!如果找智人,一…
android 几种发送短信的方法 http://www.oschina.net/question/163910_27409 <uses-permission android:name="android.permission.SEND_SMS"></uses-permission>     package com.union.matchfighter; import android.app.PendingIntent; import android.teleph…
1, 拷贝底层串口依赖的librxtxSerial.so到JDK安装路径cp librxtxSerial.so /usr/java/{0}/jre/lib/{1} # {0}: JDK的基础目录,例如: jdk1.7.0_55; {1}: 处理器名称,例如: amd64,i386 2, 在工程中添加RXTXcomm.jar, smslib-3.5.1.jar librxtxSerial.so和RXTXcomm.jar下载地址:http://rxtx.qbang.orgsmslib-3.5.1.j…
1.官网下载GATK. (学校网速实在是太慢了,下载几个小时到自闭) 下载地址:https://software.broadinstitute.org/gatk/download/ 下载完成后文件夹中有如下内容. 2.docker的下载. 因为我的电脑配置的Windows10,而GATK仅支持Linux和MacOSX(这个时候要注意一定要多查看documentation),询问老师后决定使用虚拟机.在GATK的入门指南上有明确建议使用docker,但是我从来没有接触过这一方面(卑微),所以下面主…
twlio基本使用 Twilio是一个做成开放插件的电话跟踪服务(call-tracking service),可用来进行短信,图片等信息的集中于转发,貌似只支持北美地区的电话. 现有一个需求是:客户和客服聊天,用户用手机发短信,而客服这边有一个用户列表,可分别于不同的用户进行交流,于是便用到了twilio 此平台收费,一条短信貌似是0.03美元,图片贵一点 这里用后台用Java开发,我们需要先下载对应的jar包 twilio-7.40.0-jar-with-dependencies.jar 首…