// RColorBrewer包介绍 RColorBrewer包提供了3套很好的配色方案.用户只需要指定配色方案的名称,就可以用包中的brewer.pal()函数生成颜色.这3套配色方案包括: 连续型Sequential(连续的):生成一系列连续渐变的颜色,通常用来标记连续型数值的大小. 离散型Diverging(离散的):生成用深色强调两端.浅色标示中部的系列颜色,可用来标记数据中的离群点. 极端型Qualitative(定性的):生成一系列彼此差异比较明显的颜色,通常用来标记分类数据. 在使…

RColorBrewer是一个R包,使用http://colorbrewer2.org/这个网站提供的颜色.我们画一个包括八个box的boxplot时,或者在x-y散点图上画六条线时,该怎样选择颜色呢?这个包就可以帮你. =======哪些颜色系可以使用?=======让我们先看看RColorBrewer给我们提供了哪些颜色系.将如下代码写进test.R并运行.(运行方式:R CMD BATCH test.R)### Load the package or install if not pres…

  导包     library(stringr) library(XML) library(maps) heritage_parsed <- htmlParse("http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_World_Heritage_in_Danger",encoding ="UTF-8") 出现错误   Error: failed to load external entity " 网上查阅了相关的资料: htt…

教材就是传说中的机器学习和R语言--中文版,大家可以去图书馆借来看看~~~,例子都是来自书上的 首先介绍一下KNN算法,KNN还好吧,说白了就是一个算距离的公式然后以统计的方式呈现出来,以二维平面为例,平面内已知n个区域,每个区域里面有m(n)个点,现在求一个不在n区域内的点与哪一个区域最近,额,为了"恰当",考虑较远的点的影响会覆盖较近点的影响和没有意义的重复计算,只取k(k<n)个较近点参与计算,这就是这个方法的原理了,简单粗暴~~问题还有就是在数据很大的时候怎么选取K值,书…

今天去了学院的运动会呢-扮熊本熊超开心-写完这篇我补上我的图么么哒 ××××××××××××文末高能预警!!!!!这个包的安装并不是本周的任务!!!!!我真是萌萌哒×××××××××××××× ×××××××××××××××××××××××××××我是熊本分割线×××××××××××××××××××××××××××××××××××××××× 安装diveRsity: 好吧,回看官网,说的是 那么..那几个包都要装了啊.. Rcpp直接装, ggplot2需要装digest,gtable,MASS…

一.使用GATK前须知事项: (1)对GATK的测试主要使用的是人类全基因组和外显子组的测序数据,而且全部是基于illumina数据格式,目前还没有提供其他格式文件(如Ion Torrent)或者实验设计(RNA-Seq)的分析方法. (2)GATK是一个应用于前沿科学研究的软件,不断在更新和修正,因此,在使用GATK进行变异检测时,最好是下载最新的版本,目前的版本是2.8.1(2014-02-25).下载网站:http://www.broadinstitute.org/gatk/downloa…

1.ggplot2发展历程 ggplot2是Hadley在爱荷华州立大学博士期间的作品,也是他博士论文的主题之一,实际上ggplot2还有个前身ggplot,但后来废弃了,某种程度上这也是Hadley写软件的特 征,熟悉他的人就知道这不是他第一个“2”版本的包了(还有reshape2).带2的包和原来的包在语法上会有很大的改动,基本上不兼容.尽管如此,他的R代码风格在R社区可谓独树一帜,尤其是他的代码结构很好,可读性很高,ggplot2是R代码抽象的一个杰作.读者若感兴趣,可以在GitHub网站…

// // 问题到数据 理解问题 理解客户的问题:谁是客户(某航空公司)?交流,交流,交流! 问题要具体 某航空公司: 乘客体验如何?哪方面需要提高? 类别:比较.描述.聚类,判别还是回归 需要什么样的数据:现有数据,数据质量,需要收集的数据,自变量,因变量 哪些方面的满意度?哪些主要竞争对手? 内部数据?外部数据? 领导不关心的问题都是没有未来的! 设计问卷 礼貌(Courtesy) 友善(Friendliness) 能够提供需要的帮助(Helpfulness) 食物饮料服务(Service)…

一,布局 R绘图所占的区域,被分成两大部分,一是外围边距,一是绘图区域. 外围边距可使用par()函数中的oma来进行设置.比如oma=c(4,3,2,1),就是指外围边距分别为下边距:4行,左边距3行,上边距2行,右边距1行.很明显这个设置顺序是从x轴开始顺时针方向.这里的行是指可以显示1行普通字体.所以当我们使用mtext中的line参数时,设置的大小就应该是[0,行数)的开区间.当我们使用mtext在外围边距上书写内容时,设置mtext中的outer=TRUE即可. 绘图区域可使用par(…

分析数据要做的第一件事情,就是观察它.对于每个变量,哪些值是最常见的?值域是大是小?是否有异常观测? ggplot2图形之基本语法: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离,数据相关的绘图与数据无关的绘图分离ggplot2是按图层作图ggplot2保有命令式作图的调整函数,使其更具灵活性ggplot2将常见的统计变换融入到了绘图中.ggplot的绘图有以下几个特点:第一,有明确的起始(以ggplot函数开始)与终止(一句语句一幅图):其二,图层之间的叠加是靠"+"号实现的,越后面其…