C/C++的速度是Python和perl所无法比拟的,尤其对于处理超大的生物信息学文件来说. 最近在写一个最简单的fastq cut工具,Python简直慢到不能忍,8G的fastq.gz文件的cut需要6-7个小时,而C++则只需要15-20min,简直就不在一个量级. 当然,听说Python有个cpython机制,可以加快速度,但和纯C++还是有差距的. C++的编译比较复杂,这里只能做个入门的介绍. 在linux环境下编译C++ 程序 g++编译命令选项 学习linux之 gcc/g++常…