在生信分析中,经常会遇到不同的重复和处理,这样的分析过程有时是非常费时且占用资源并不是很多的,可以同时在后台运行以节约时间,这是并行处理的意义.除了需要并行处理,循环迭代来遍历整个文件夹的需要分析的数据也是非常消耗精力和时间的,按照宁可花费机器一分钟绝不浪费程序员一秒钟的精神,我决定开始探索并行循环处理的应用. 首先摆在我面前的是tab分割的按行分布的不同的采样策略,这样一个文件我们要进行分析的话就需要每次都迭代一下,这样非常费事,所以我们决定按行来拆分这样的文件,用到了split命令,见另述.…

转自:http://blog.csdn.net/taiyang1987912/article/details/39529291 版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载. 目录(?)[+] 一.简介 Linux是一种用户控制的多作业操作系统,系统允许多个系统用户同时提交作业,而一个系统用户又可能用多个shell登录,每个系统用户可以用一个shell提交多个作业.了解Bash Shell在多作业管理和进程处理方面的命名和机制有助于理解多用户.多作业的系统. 二.详解 1.子Shell (…

原文:http://www.ibm.com/developerworks/cn/linux/l-cn-shell-monitoring/ 使用 Shell 对进程资源进行监控 检查进程是否存在 在 对进程进行监控时,我们一般需要得到该进程的 ID,进程 ID 是进程的唯一标识,但是有时可能在服务器上不同用户下运行着多个相同进程名的进程,下面的函数 GetPID 给出了获取指定用户下指定进程名的进程 ID 功能(目前只考虑这个用户下启动一个此进程名的进程),它有两个参数为用户名和进程名,它首先使用…

bash&shell系列文章:http://www.cnblogs.com/f-ck-need-u/p/7048359.html 1.1 shell函数 在shell中,函数可以被当作命令一样执行,它是命令的组合结构体.可以将函数看成是一个普通命令或者一个小型脚本. 首先给出几个关于函数的结论: (1).当在bash中直接调用函数时,如果函数名和命令名相同,则优先执行函数,除非使用command命令.例如:定义了一个名为rm的函数,在bash中输入rm执行时,执行的是rm函数,而非/bin/rm…

开篇废话 这是在美国Amazon上评价很不错的一本书,其实严格来说这可能不算书,而是一本小册子.就像书名一样,里面的内容主要是用一些例子讲述地道的Python的代码是怎样写的.书中把很多例子用不良风格和地道Python写法作对比,内容覆盖谈不上很全,但是每一条都很有代表性.总体而言非常适合新手,同时里面有些条目老手看了或许也会有豁然开朗的感觉.作者Jeff Knupp曾在全球最牛B的高盛和其他银行里做过金融系统开发,在北美Python社区里也很有活跃度. 自己用Python也有些年头了,做过一年…

上篇我们学习了shell中条件选择语句的用法.接下来本篇就来学习循环语句.在shell中,循环是通过for, while, until命令来实现的.下面就分别来看看吧. for for循环有两种形式: for-in语句 基本格式如下: for var in list do commands done list代表要循环的值,在每次循环的时候,会把当前的值赋值给var(变量名而已,随意定), 这样在循环体中就可以直接通过$var获取当前值了. 先来一个例子吧: #!/bin/bash for st…

转载地址:http://weyo.me/pages/techs/linux-get-pid/ 导读 Linux 的交互式 Shell 与 Shell 脚本存在一定的差异,主要是由于后者存在一个独立的运行进程,因此在获取进程 pid 上二者也有所区别. 交互式 Bash Shell 获取进程 pid 在已知进程名(name)的前提下,交互式 Shell 获取进程 pid 有很多种方法,典型的通过 grep 获取 pid 的方法为(这里添加 -v grep是为了避免匹配到 grep 进程): ps…

用shell脚本监控进程是否存在 不存在则启动的实例,先上代码干货: #!/bin/shps -fe|grep processString |grep -v grepif [ $? -ne 0 ]thenecho "start process....."elseecho "runing....."fi#####processString 表示进程特征字符串,能够查询到唯一进程的特征字符串0表示存在的$? -ne 0 不存在,$? -eq 0 存在 ---------…

通过前两篇文章,我们掌握了shell的一些基本写法和变量的使用,以及基本数据类型的运算.那么,本次就将要学习shell的结构化命令了,也就是我们其它编程语言中的条件选择语句及循环语句. 不过,在学习shell结构化命令的时候,我们又会发现它与其它编程的语言相比存在不小的区别.下面就开始看看吧: 条件选择 在条件选择语句中,主要包含以下几种写法: if-then语句 if command then commands fi 吃瓜群众表示一脸懵比:if语句后面接的是命令,我们其它编程语言中,这儿都是接…

转载地址:http://weyo.me/pages/techs/linux-get-pid/ 根据pid,kill该进程:http://www.cnblogs.com/lovychen/p/5411391.html 导读 Linux 的交互式 Shell 与 Shell 脚本存在一定的差异,主要是由于后者存在一个独立的运行进程,因此在获取进程 pid 上二者也有所区别. 交互式 Bash Shell 获取进程 pid 在已知进程名(name)的前提下,交互式 Shell 获取进程 pid 有很多…