R语言基础绘图系统 基础图形--散点图.盒形图 plot是一个泛型函数(generic method),对于不同的数据绘制不同的图形. par函数的大部分参数在plot中通用. 1.散点图 plot绘制散点图类型,type有6种,即p, b, l, s, o, n. type=c('p','b','l','s','o','n') par(mfrow=c(2,3)) for(i in 1:6){ plot(1:10,type = type[i], main = paste('type is: ',…

ggplot2绘图系统--几何对象之盒形图 参数: geom_boxplot(mapping = , #lower,middle,upper,x,ymax,ymin必须(有默认) #alpha/color/fill/linetype/shape/size/weight可选 data = , stat = 'boxplot', position = 'dodge', outlier.color = , #离群点颜色 outlier.shape = 19, outlier.size = 1.5, o…

ggplot2绘图系统--扩展包ggrepel.ggsci.gganimate.ggpubr等 部分扩展包可在CRAN直接下载,有些需借助devtools包从Github下载. 1. ggrepel包 用来在图上添加文字和标签,相比geom_text和geom_label函数,能将重叠的标签分开,并添加指示短横线. library(ggrepel) ggplot(mtcars,aes(wt,mpg))+geom_point(color='red')+ geom_text_repel(aes(la…

ggplot2绘图系统--坐标轴调节 scale函数:图形遥控器.坐标轴标度函数: scale_x_continous scale_y_continous scale_x_discrete scale_y_discrete 1. 连续型变量坐标轴 函数及其参数: scale_x_continuous(name = , #坐标轴标签 breaks = , #定义刻度 minor_breaks = , labels = , #刻度标签 limits = , expand = c(0.05,0), #…

ggplot2绘图系统--几何对象汇总 前面介绍了常见的几种基本的几何对象,并且介绍了scale.stat等其他要素.后续将介绍position.themes.coord和faceting等函数. 这里对ggplot2几何对象进行汇总. abline/area/bar/bin2d/boxplot/contour/crossbar/density/density2d/dotplot/errorbar/errorbarh/freqpoly/hex/histogram/hline/vline/jitt…

1.plotly包 动态散点图 library(plotly) # 交互散点图 plot_ly(data=iris, x=~Sepal.Length, y=~Petal.Length, marker=list(size=10, color='rgba(255,182,193,.9)', line=list(color='rgba(152,0,0,.8)', width=2))) %>% layout(title='Styled Scatter', yaxis=list(zeroline=FALS…

1.海盗图 参数众多,其语法与基础包类似. 基础图. #devtools::install_github('ndphillips/yarrr') #install.packages('yarrr') library(yarrr) #基本海盗图 str(pirates) pirateplot(formula = age ~ favorite.pirate, data = pirates, xlab = 'Favorite Pirate', ylab = 'Age', main="") 散…

ggplot2绘图系统--统计变换函数 在几何对象中以参数stat形式出现. 不同的几何对象对应不同的统计变换函数. 以直方图为例,几何对象geom_histogram(..., stat='bin')与stat_bin(.., stat='bar')的作用是一样的. 一般而言,我们不需要对数据进行额外的统计变换,使用默认的就好.但特殊情况时需要用到,如对数据进行log转换. 绘制QQ图 df <- data.frame(y=rt(200,df=5)) #随机生成t分布 ggplot(df,ae…

ggplot2绘图系统--几何对象之线图 曲线:点连线.路径曲线.时间序列曲线.模型拟合曲线...... 直线:水平直线.垂直直线.斜线. 1.曲线 对象及其参数. #路径图 geom_path(mapping = , data = , stat = 'identity', position = 'identity', lineend = 'butt', #线段两端样式,round/square linejoin = 'round', #线段交叉样式,mitre/bevel linemitre…

ggplot2绘图系统--几何对象之散点图 以geom开头的函数超过30个.几何对象和标度函数scale密不可分.只有在aes中传入某个变量,scale才能发挥作用. 所谓标度scale,就是图形遥控器,用于控制元素属性.相对于color/shape等参数而言,可以进行更多.更精确的设置. 颜色标度设置 颜色梯度(gradient)标度(scale)函数. #双色梯度函数 scale_color_gradient(...,high='#56B1F7',low='#132B43',...) sca…