Hmmer的安装与使用   从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个对一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度,但其应用还远没有blast普及. hmmer下载与安装 对于Mac OS/X, Linux, UNIX系统,用源代码编译安装: % wget ftp://selab.janelia.org/pub/software/hmmer3/3.0/hmmer-3.0.tar.gz % tar zxf hm…

hmmer 使用 » 转载文章请注明,转载自:博耘生物 » <hmmer的安装与使用> » 原文链接:http://boyun.sh.cn/bio/?p=1753   从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个对一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度,但其应用还远没有blast普及,这里是一篇入门级的介绍文章. hmmer下载与安装 对于Mac OS/X, Linux, UNIX系统,用源代码编译安装:…

转载至:http://blog.sina.com.cn/s/blog_3f6403290100rb61.html(感谢原文作者) HMMPfam的安装使用手记前言 简要介绍一下 HMMPfam吧.这还要从HMMER说起,HMMER是基于隐马尔可夫模型(profile HMMs),用于生物序列分析工作的一个非常强大的软件包,而hmmpfam就是HMMER软件包中的一个重要组成部分.同时,我们还需要了解Pfam (Protein families database of alignments and…

https://www.codetd.com/article/1137423 <版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载> 本次利用SPECCPU2006测试工具来进行Intel CPU Xeon E7-**** v4的测试以及调优,计划在机器I840-G**测试.本次测试主要从硬件调优和操作系统调优两个方面进行.经过最终的测试,SPECint_rate_base和SPECfp_rate_base结果均超过Intel的预期.其中调优过程尤为重要,为后续继续的测试达下基础.下面记录中间…

基于RedHatEnterpriseLinux V7(RHEL7)下SPEC CPU 2006环境搭建以及测试流程(之一)--介绍.安装准备.安装.config文件以及运行脚本介绍 其他 2018-05-30 13:27:18 阅读次数: 0  https://www.codetd.com/article/1137423 <版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载> 本次利用SPECCPU2006测试工具来进行Intel CPU Xeon E7-**** v4的测试以及调优,计划在机…

如果进行重复序列的预测,则使用RepeatModeler,可自身比对进行查找 安装 (1)下载地址:http://www.repeatmasker.org/RepeatModeler/ (2)RepeatModeler安装之前需要安装以下软件 perl RECON - De Novo Repeat Finder;  鉴定重复家族 RepeatScout - De Novo Repeat Finder; 从基因组中鉴定重复序家族序列 TRF - Tandem Repeat Finder RMBla…

写在前面: 继续docker的学习,学习了docker的基本常用命令之后,我在docker上安装jdk,tomcat两个基本的java web工具,这里对操作流程记录一下. 软件准备: 1.jdk-7u79-linux-x64.tar.gz 2.apache-tomcat-8.0.36.tar.gz 下载centos镜像:(下载centos这个过程极其漫长) # 启动docker服务 service docker start # 检索centos镜像 docker search centos #…

如果你正在构建一个基于 gulp 的前端自动化开发环境,那么极有可能会用到 gulp-sass ,由于网络原因你可能会安装失败,因为安装过程中部分细节会到亚马逊云服务器上获取文件.本文主要讨论在不变更网络环境的前提下安装 gulp-sass / node-sass . 问题描述 执行 npm install 安装软件包 gulp-sass $ npm install gulp-sass 这个过程中会先安装 node-sass ,因为 gulp-sass 依赖于 node-sass .中间出现的错…

介绍 Sublime Text3使用jshint依赖Nodejs,SublimeLinter和Sublimelinter-jshint. NodeJs的安装省略. 安装SublimeLinter Sublime的包管理器安装SublimeLinter. 安装成功后如下: Package Control Messages ======================== SublimeLinter ------------- ____ _ _ _ _ _ _ / ___| _ _| |__ | (…

Fabio(Go 语言):https://github.com/eBay/fabio Fabio 是一个快速.现代.zero-conf 负载均衡 HTTP(S) 路由器,用于部署 Consul 管理的微服务. Fabio 由 eBay Classifieds Group 开发,用于处理 marktplaats.nl 和 kijiji.it 的流量.Marktplaats 所有的流量都经过 Fabio ,每秒有 250000 个请求,分发于数个 Fabio 实例,并且没有出现任何延迟. 简单流程图…