vegan 包进行 Bioenv 分析】的更多相关文章

Bioenv 分析通过 计算样本群落结构的距离矩阵和 环境因子的距离矩阵,计算两个距离之间的相关系数,挑选出最佳的环境因子组合: 默认情况下,计算 群落结构的距离矩阵时, 使用 Bray-Curtis 距离: 计算环境因子的距离矩阵时,使用Euliodean 欧式距离, 计算相关性,则采用 spearman 相关系数: 示例用法: > # The method is very slow for large number of possible subsets.> # Therefore onl…
Adonis 分析 是基于距离矩阵的多变量方差置换分析, 代码示例: 默认使用bray 距离来计算样本间的距离矩阵 参考资料: https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/topics/adonis https://pdfs.semanticscholar.org/038e/8869b676aa365f2afdea935edf3f2003324d.pdf…
vegan 包是进行群落数据分析最常用的R包,其中的 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线 首先看下官方示例: library(vegan) data(BCI) sp1 <- specaccum(BCI, method="random") plot(sp1, ci.type="poly", col="blue", lwd=2, ci.lty=0, ci.col="lightblue") boxplot(sp1,…
每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 词向量的表示主流的有两种方式,一种当然是耳熟能详的google的word2vec,还有一类就是GloVe.那么前面一类有三个开源的包,后面这一类我倒是看到得不多,恰好是在我关注了许久的一个包里面有,它就是text2vec啦.该包提供了一个强大API接口,能够很好地处理文本信息. 本包是由C++写的,流处理器可以让内存得到更好的利用,一些地方是用…
什么是WinPcap WinPcap是一个基于Win32平台的,用于捕获网络数据包并进行分析的开源库. 大多数网络应用程序通过被广泛使用的操作系统元件来访问网络,比如sockets.  这是一种简单的实现方式,因为操作系统 已经妥善处理了底层具体实现细节(比如协议处理,封装数据包等等),并且提供了一个与读写文件类似的,令人熟悉的接口. 然而,有些时候,这种“简单的方式”并不能满足任务的需求,因为有些应用程序需要直接访问网 络中的数据包.也就是说,那些应用程序需要访问原始数据包,即没有被操作系统利…
计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers(Wireshark抓包与协议分析实验) 前言:本博客包含Windows10下安装wget.Wireshark. 一些有用的链接: Labexercise1-1 Protocol Layers翻译 wireshark练习及答案lab-protocol-layers.docx Wireshark抓包使用指南 山东大学计算机网络实验 一些有用的提示: 开始实验进行抓包时,校园网环境下的同学不建议使用一些 [ 上网不涉密涉密不…
PS: 这个实现对于某些特定情况未必是最佳实现,可以用数组来代替队列来实现 参照TCP/IP详解第二卷24~29章,详细论述了TCP协议的实现,大概总结一下TCP如何向应用层保证数据包的正确性.可靠性,即TCP如何实现对数据报文的重组. 首先要设计两个报文队列,一个存放正常来到的报文,一个存放失序到来的报文. 比如正常报文队列最后一个报文数据如下: 报文数据段第一字节的序号                      数据报长度 seq1=100 len1=100 下一个来到的报文可能有多种情况,…
学习golang难免需要分析源码包中一些实现,下面就来说说container/heap包的源码 heap的实现使用到了小根堆,下面先对堆做个简单说明 1. 堆概念 堆是一种经过排序的完全二叉树,其中任一非终端节点的数据值均不大于(或不小于)其左孩子和右孩子节点的值. 最大堆和最小堆是二叉堆的两种形式. 最大堆:根结点的键值是所有堆结点键值中最大者. 最小堆:根结点的键值是所有堆结点键值中最小者. 2. heap 树的最小元素在根部,为index 0. heap包对任意实现了heap接口的类型提供…
1. 粘包现象及产生原因 1)概念 指TCP协议中,发送方发送的若干个包数据到接收方接收时粘成一包.发送方粘包:发送方把若干个要发送的数据包封装成一个包,一次性发送,减少网络IO延迟:接收方粘包:接收方接到的数据是若干个数据包个封装成的,而不是一个一个的数据包接收到. 一般实际开发中所说的粘包问题都是指接收方粘包现象. 2)原因分析 我们知道,我们写的应用程序是无法直接操作硬件,都是通过调用操作系统给应用程序封装的接口间接来操作硬件. 如上图所示,一个C/S系统,当你的程序要给要给远程发送数据时…
Spring Boot介绍 Spring Boot是由Pivotal团队提供的新框架,其设计目的是简化Spring应用的搭建以及开发过程.其目标是: 为所有Spring开发提供一个从根本上更快,且方便上手的体验 开箱即用,摆脱原有的默认配置方式 提供大型项目常用的非功能性特征,例如:内嵌服务器,安全,指标度量,健康监测,外部化配置 无需xml配置和绝无代码生成 Spring Boot系统要求 Spring Boot 2.1.2.RELEASE 版本 要求Java7或者更高版本(推荐用jdk8).…