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GenomicConsensus (quiver, arrow)使用方法 | 序列 consensus

https://github.com/PacificBiosciences/GenomicConsensus GenomicConsensus 是pacbio开发的,我个人非常不喜欢pacbio开发的工具,很难用. 安装这个GenomicConsensus也是废了我快半条老命. 这个工具的目的:Compute genomic consensus and call variants relative to the reference. 就是用一些reads来对最终的ref来进行纠错,这个模型适用性…

guxh的python笔记八：特殊方法

 1,类的特殊方法  新建一个类,本章内容中的特殊方法如果不创建类或新增方法,默认使用的就是下面的类: class Foo: """this is Foo""" typecode = 'd' def __init__(self, x): self.x = x def run(self): return self.x f = Foo(1) __doc__:类的描述信息 print(f.__doc__) # this is Foo __module_…

Struct2_使用Ajax调用Action方法并返回值

一.Login.jsp 1.<head>引入jquery: <script type="text/javascript" src="http://ajax.aspnetcdn.com/ajax/jQuery/jquery-1.7.1.js"></script>   2.界面控件:  用户名: <input type="text" id="userName">  <input…

关于ajaxfileupload的使用方法以及一些问题

使用问题: 1.ajax-fileupload.js handleError 异常 由于本来handleError方法是jquery的方法,但jquery到了某个版本这个方法就去掉了没有了 所以最简单有效的方式就是在ajaxfileupload.js中添加上该方法, 方法如下: 著作权归作者所有. 商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处. 作者:卷猫 链接:http://anneke.cn/ArticleInfo/Detial?id=2 来源:Anneke.cn handleError…

71、salesforce的JSON方法

List<Merchandise__c> merchandise = [select Id,Name,Price__c,Quantity__c from Merchandise__c limit 1]; String goodsToJson = JSON.serialize(merchandise);//通过serialize方法序列化成JSON内容 String goodsToJsonPretty = JSON.serializePretty(merchandise);//通过seriali…

三代PacBio reads纠错 - 专题

三代纠错的重要性不言而喻,三代的核心优势就是长,唯一的缺点就是错误率高,但好就好在错误是随机分布的,可以通过算法解决,这也就是为什么现在有这么多针对三代开发的纠错工具. 纠错和组装是分不开的,纠错就是为了组装,单纯的为了纠错而纠错是没有意义的. 目前的算法大致可以分为三种:1.三代数据自纠:2.二代对三代纠:3.二代三代混合纠错. 目前已有的三代纠错程序: PacBioToCA 自纠(falcon也是用MHAP,SMRT的HGAP使用的是另一种速度慢的自纠算法,自纠的核心是多重序列比对) CCS…

Raft

http://thesecretlivesofdata.com/raft/ https://github.com/coreos/etcd   1 Introduction Consensus algorithms allow a collection of machines to work as a coherent group that can survive the failures of some of its members. Because of this, they play a k…

HTTP超文本传输协议-HTTP/1.1中文版

摘要 超文本传输协议(HTTP)是一种为分布式,合作式,多媒体信息系统服务,面向应用层的协议.它是一种通用的,不分状态(stateless)的协议,除了诸如名称服务和分布对象管理系统之类的超文本用途外,还可以通过扩展它的请求方式,错误代码和报头来完成许多任务.HTTP的一个特点是数据表示方式的典型性和可协商性允许独立于传输数据而建立系统.在1990年WWW全球信息刚刚起步的时候HTTP就得到了应用.HTTP的第一个版本叫做HTTP/0.9,是一种为互联网原始数据传输服务的简单协议.由RFC 19…

LINQ to Entities 和LINQ to Objects 的区别

本文资料来源:http://www.codeproject.com/Articles/246861/LINQ-to-Entities-Basic-Concepts-and-Features) LINQ to Entities needs an Object Context object. The ObjectContext object is the bridge between LINQ and the database (we will explain more about ObjectCo…

RFC-2068-http

本文档规定了互联网社区的标准组协议,并需要讨论和建议以便更加完善.请参考 “互联网官方协议标准”(STD 1)来了解本协议的标准化状态.本协议不限流传发布. 版权声明 Copyright (C) The Internet Society (1999). All Rights Reserved. 摘要 超文本传输协议(HTTP)是一种为分布式,协作式的,超媒体信息系统.它是一种通用的,无状态(stateless)的协议,除了应用于超文本传输外,它也可以应用于诸如名称服务器和分布对象管理系统之类的系…