ggplot2作图详解:入门函数qplot   ggplot2的功能不用我们做广告,因为它的作者Hadley Wickham就说ggplot2是一个强大的作图工具,它可以让你不受现有图形类型的限制,创造出任何有助于解决你所遇到问题的图形.一点也不谦虚. H.W.还说了另外一句话,“学习ggplot2你得忘记一些东西”,所以也有人说ggplot2是作图软件中的太极功.有点高深. 那好吧,我就怀着无比崇敬的心情来学一学这太极图法.先安装软件包: install.packages("ggplot2&q…

2.1 简介 qplot的意思是快速作图(quick plot). qplot是一种快捷方式,如果您已习惯于使用基础plot(),则可以使用它.它可以使用一致的调用模式快速创建许多不同类型的图. qplot(x, y, ..., data, facets = NULL, margins = FALSE, geom = "auto", xlim = c(NA, NA), ylim = c(NA, NA), log = "", main = NULL, xlab = N…

从2020年2月20到2月27日,3月13日到2020年3月16日,学习了ggplot2:数据分析与图形艺术(哈德利·威克姆 著 统计之都 译),历时12天.另外,3月6日到3月9日参加了美赛,也用到了刚学的ggplot2. qplot:基本掌握,可以快速绘图,不局限于数据框: 语法:有所了解,不大涉及具体应用: 图层:了解: 工具箱:重点,各种绘图形式: 标度,定位:修饰,细化: 输出:ggsave:布局:一页多图: 数据操作:ddply.transform.colwise.melt. 用平板…

一.简介 ggplot2是R语言中四大著名绘图框架之一,且因为其极高的参数设置自由度和图像的美学感,即使其绘图速度不是很快,但丝毫不影响其成为R中最受欢迎的绘图框架:ggplot2的作者是现任Rstudio首席科学家的Hadley Wickham,ggplot2基于Leland Wilkinson在Grammar of Graphics(图形的语法)中提出的理论,取首字母缩写再加上plot,于是得名ggplot,末尾的2是因为Hadley写包的一个习惯——对先前的版本不满意便写一个新版本的名称不…

第1章 简介 1.3图形的语法 第2章从qplot开始入门 1.基本用法:qplot(x,y,data) x是自变量横轴,y是因变量纵轴,data是数据框   2.图形参数 colour=I("red"),shape,size=I(2),alpha=I(1/20) colour是(外框)颜色,fill是填充颜色,shape是点的形状,适合描述分类变量:形状和颜色 size是点的大小,适合描述连续变量:大小和颜色 alpha是点的透明度,1/20说明20个重叠在一起就会变得不透明,可以用…

ggplot2绘图系统 基础绘图包向ggplot2过渡--qplot 绘图理念的不同: 基础绘图包是先铺好画布,再在这张画布上作图(常规思维): ggplot2打破常规,采用图层叠加的方法. qplot函数既有plot特点,又体现了ggplot2的特征,是一个过渡函数. library(ggplot2) data("diamonds") qplot(x=carat, y=price, data=diamonds, geom = 'point', color=color) #geom几何…

grid包是R底层的图形系统,可以绘制几乎所有的图形.除了绘制图形之外,grid包还能对图形进行布局.在绘图时,有时候会遇到这样一种情景,客户想把多个代表不同KPI的图形分布到同一个画布(Page)上,而且每一个图形都是单独绘制的.对于这种需求,可以使用grid包来实现,grid包能把图形逐个地添加到画布中,并按照业务的需求,把图形摆放到合适的位置上去.在布局完成之后,把图形绘制出来. 一,grid包概述 grid包不仅可以输出图形,还可以产生可编辑的图形组件,这些图形组件可以被复用和重组,并能…

R语言特征 对大小写敏感 通常,数字,字母,. 和 _都是允许的(在一些国家还包括重音字母).不过,一个命名必须以 . 或者字母开头,并且如果以 . 开头,第二个字符不允许是数字. 基本命令要么是表达式(expressions)要么就是 赋值(assignments). 命令可以被 (;)隔开,或者另起一行. 基本命令可以通过大括弧({和}) 放在一起构成一个复合表达式(compound expression). 一行中,从井号(#)开始到句子收尾之间的语句就是是注释. R是动态类型.强类型的语…

R语言与数据挖掘:公式:数据:方法 R语言特征 对大小写敏感 通常,数字,字母,. 和 _都是允许的(在一些国家还包括重音字母).不过,一个命名必须以 . 或者字母开头,并且如果以 . 开头,第二个字符不允许是数字. 基本命令要么是表达式(expressions)要么就是 赋值(assignments). 命令可以被 (;)隔开,或者另起一行. 基本命令可以通过大括弧({和}) 放在一起构成一个复合表达式(compound expression). 一行中,从井号(#)开始到句子收尾之间的语句就…

[R笔记]R语言函数总结   R语言与数据挖掘:公式:数据:方法 R语言特征 对大小写敏感 通常,数字,字母,. 和 _都是允许的(在一些国家还包括重音字母).不过,一个命名必须以 . 或者字母开头,并且如果以 . 开头,第二个字符不允许是数字. 基本命令要么是表达式(expressions)要么就是 赋值(assignments). 命令可以被 (;)隔开,或者另起一行. 基本命令可以通过大括弧({和}) 放在一起构成一个复合表达式(compound expression). 一行中,从井号(…

例一 Michaelis-Menten动力学方程 这个例子中采用出自文献中的一组有关于浮萍氮摄取的数据,共2两个变量8个观测值,其中底物浓度与浮萍的氮取速率之间可以通过M-M动力学方程来进行描述.在这个例子中首先通过nls()根据M-M动力学方程进行模型拟合,然后用预测值进行了ggplot2绘图,主要采用了R里面的数学表示方法plotmath在图中展示了公式,并通过ggplot2种的theme对图像进行了修饰.需要注意的在geom_text()并不能直接使用expression,需要开启pars…

原博: R语言与数据挖掘:公式:数据:方法 R语言特征 对大小写敏感 通常,数字,字母,. 和 _都是允许的(在一些国家还包括重音字母).不过,一个命名必须以 . 或者字母开头,并且如果以 . 开头,第二个字符不允许是数字. 基本命令要么是表达式(expressions)要么就是 赋值(assignments). 命令可以被 (;)隔开,或者另起一行. 基本命令可以通过大括弧({和}) 放在一起构成一个复合表达式(compound expression). 一行中,从井号(#)开始到句子收尾之间…

相信很多人都看到过上面这种方块图,有点像"华夫饼图"的升级版,也有点像"热图"的离散版.我在一些临床多组学的文章里面看到过好几次这种图,用它来展示病人的临床信息非常合适,我自己也用R包或者AI画过类似的图.今天给大家演示一下,如何用ggplot2里面的geom_tile函数画这种图. 先构造一个练习数据集,假设有15个病人,每个病人有年龄.性别.症状.是否有RNA-seq和WES测序等信息. library(ggplot2) library(tidyverse) l…

出处:http://www.cellyse.com/how_to_use_gggplot2_part1/ ggplot2包是基于Wilkinson在<Grammar of Graphics>一书中所提出的图形语法的具体实现, 这套图形语法把绘图过程归纳为data, transformation, scale, coordinates, elements, guides, display等一系列独立的步骤, 通过将这些步骤搭配组合, 来实现个性化的统计绘图.于是, 得益于该图形语法, Hadle…

先写一些需要用到的知识点,比如包.函数 dplyr 很好用的包 经常与ggplot2连用 mutate:用于对数据框的列进行重新处理,或者用处理的结果添加新列 数据清洗: 1.na.omit()               #去除数组当中的空值 newdata<-na.omit(olddata) ggplot: 1.在ggplot的里面添加直线: geom_hline()添加水平线 geom_viline()添加垂直线        #geom_hline(yintercept=1.3,type…

出处:http://www.cellyse.com/how_to_use_gggplot2_part2/ 更多实战 例一 Michaelis-Menten动力学方程 这个例子中采用出自文献中的一组有关于浮萍氮摄取的数据,共2两个变量8个观测值,其中底物浓度与浮萍的氮取速率之间可以通过M-M动力学方程来进行描述.在这个例子中首先通过nls()根据M-M动力学方程进行模型拟合,然后用预测值进行了ggplot2绘图,主要采用了R里面的数学表示方法plotmath在图中展示了公式,并通过ggplot2种…

R语言  ggplot2包的学习   分析数据要做的第一件事情,就是观察它.对于每个变量,哪些值是最常见的?值域是大是小?是否有异常观测? ggplot2图形之基本语法: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离,数据相关的绘图与数据无关的绘图分离ggplot2是按图层作图ggplot2保有命令式作图的调整函数,使其更具灵活性ggplot2将常见的统计变换融入到了绘图中.ggplot的绘图有以下几个特点:第一,有明确的起始(以ggplot函数开始)与终止(一句语句一幅图):其二,图层之间的叠加…

简介 ggplot2包是基于Wilkinson在<Grammar of Graphics>一书中所提出的图形语法的具体实现, 这套图形语法把绘图过程归纳为data, transformation, scale, coordinates, elements, guides, display等一系列独立的步骤, 通过将这些步骤搭配组合, 来实现个性化的统计绘图.于是, 得益于该图形语法, Hadley Wickham所开发的ggplot2是如此人性化, 不同于R基础绘图和先前的lattice那样参…

ggplot2 R的作图工具包,可以使用非常简单的语句实现非常复杂漂亮的效果. qplot 加载qplot library(ggplot2) # 测试数据集,ggplot2内置的钻石数据 qplot(carat, price, data = diamonds) dsmall <- diamonds[sample(nrow(diamonds), 100), ] #对diamonds数据集进行抽样 #1. 按color,size,shape的基本分类可视化      #1.1 简单的散点图(利用co…

1.ggplot2发展历程 ggplot2是Hadley在爱荷华州立大学博士期间的作品,也是他博士论文的主题之一,实际上ggplot2还有个前身ggplot,但后来废弃了,某种程度上这也是Hadley写软件的特 征,熟悉他的人就知道这不是他第一个“2”版本的包了(还有reshape2).带2的包和原来的包在语法上会有很大的改动,基本上不兼容.尽管如此,他的R代码风格在R社区可谓独树一帜,尤其是他的代码结构很好,可读性很高,ggplot2是R代码抽象的一个杰作.读者若感兴趣,可以在GitHub网站…

1.分面 分面是指在一个页面上自动摆放多幅图形的技巧,也就是说可以让不同分类的图同时展示在一张图上,这样方便于数据之间的的比较.ggplot2提供了网格型(facet_grid)和封装型(facet_wrap)两种分面类型,下面就针对不同的两种分面进行介绍. 1.1 网格分面(facet_grid) 如果我们对图像什么也不改变,或者加上facet_null()则不会出现分面效果(如下所示). library("ggplot2") mpg2<-subset(mpg,cyl!=5&a…

0. Preparation and Introduction ggplot2是R中新颖的数据可视化包,这得益于Leland Wilkinson在他的著作<The Grammar of Graphics>中提出了一套图形语法,把图形元素抽象成可以自由组合的成分,Hadley Wickham把这套想法在R中实现. 1. How to use qplot 函数qplot()是ggplot2中十分常用的函数,使用它可以绘制丰富多彩的图形,并且通常只需要一行代码可以搞定.在这里,我们通过R内置的钻石数…

ggplot2包实现了基于语法的.连贯一致的创建图形的系统,由于ggplot2是基于语法创建图形的,这意味着,它由多个小组件构成,通过底层组件可以构造前所未有的图形.ggplot2可以把绘图拆分成多个面板,且能够按照顺序创建多重图形,基本上,无所不能,是R开发人员必学必会的包. ggplot2图形系统的核心理念是: 把绘图与数据分离,把数据相关的绘图与数据无关的绘图分离: 按图层作图,有利于结构化思维: 具有命令式作图的调整函数,使绘图更具灵活性,绘制出来的图形美观,同时避免繁琐细节. 使用gg…

[怪毛匠子整理] 1.下载 wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz 2.解压: tar -zxvf R-3.0.1.tar.gz cd R-3.0.1 3.安装 yum install readline-devel yum install libXt-devel ./configure 如果使用rJava需要加上 --enable-R-shlib ./configure  --enable-R-shlib -…

R图表入门 R语言最强的功能就是统计和作图了,在学习了基本语法之后,博主马上体验了一下R的图表功能 条形图 例1 H = c(7,12,28,3,41) M = c("Mar","Apr","May","Jun","Jul") barplot(H, #数据集 names.arg = M, #坐标项名称 xlab = "Revenue", #坐标标签 ylab = "Month&…

Python数据分析入门 最近,Analysis with Programming加入了Planet Python.作为该网站的首批特约博客,我这里来分享一下如何通过Python来开始数据分析.具体内容如下: 数据导入 导入本地的或者web端的CSV文件: 数据变换: 数据统计描述: 假设检验 单样本t检验: 可视化: 创建自定义函数. 数据导入 这是很关键的一步,为了后续的分析我们首先需要导入数据.通常来说,数据是CSV格式,就算不是,至少也可以转换成CSV格式.在Python中,我们的操作如…

早在N年前就听说这个包画图不错,一直没机会用,终于等到了.相比前面trendline这个包的可视化功能强大得多. ggplot2需要使用dataframe,其实就是一个N维数组, install.packages("ggplot2") library(ggplot2) ab<-data.frame(x1,y1) ggplot(data=ab,aes(x=x1,y=y1))+geom_smooth(method='lm')+geom_point() 但是要求太奇葩,背景,网格线统统…

Alpha-ma 2016/10/7 1 Introduction of GGplot2 ggplot2 is an R package for producing statistical, or data, graphics, and it has a deep underlying grammar. This grammar, based on the Grammar of Graphics creadted by Wilkinson. In the grammar of graphics,…

ggplot2包中绘制点图的函数有两个:geom_point和 geom_dotplot,当使用geom_dotplot绘图时,point的形状是dot,不能改变点的形状,因此,geom_dotplot 叫做散点图(Scatter Plot),通过绘制点来呈现数据的分布,对点分箱的方法有两种:点密度(dot-density )和直方点(histodot).当使用点密度分箱(bin)方式时,分箱的位置是由数据和binwidth决定的,会根据数据进行变化,但不会大于binwidth指定的宽度:当使用…

ggplot2已经成为了R语言中数据可视化的同义词, 这是一个强大的工具, 可以帮助我们制作优良的图表, 创造出令人吃惊的图片, 下面我们一起学习(本博文参考了知乎问题如何使用 ggplot2中黄宝臣的回答(), 并在此基础上补充了一些细节和自己的理解). ggplot2函数里面为属性赋值的时候需要使用的参数名: 图形属性(aes): 表示几何对象的属性: 横坐标, 点的大小, 颜色, 填充色等; 比如一个点的属性有它的横纵坐标, 它的大小, 颜色等等. 不同的几何对象(geom_,  geom…