洛谷P1140 相似基因 题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了44种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度.因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用. 题目描述 两个基因的相似度的计算方法如下: 对于两个已知基因,例如AGTGATGAGTGATG和GTTAGGTTAG,将它们的碱基互相对应.当然,中间可以加入一些空碱基-,例如: 这样,…

最近博客更不起来...然后又(照例)犯鼻炎了唉难受. 题目传送门 我们首先可以预处理碱基间的权值表.然后讲读入的碱基转化为数字,就变成了“数字匹配使权值最大”的问题.我们显然可以用动态规划解决. 两个序列配对上的dp状态设计相似,以前做过一道编辑距离也是类似配对的问题. 设f[i][j]表示第一个基因当前位置到了第i个碱基,第二个基因当前位置到了第j个碱基所能得到的最大相似度. 转移:lena*lenb 而且和状态也没有什么地方可以优化了. 决策:我们可以在每一次转移的时候有3种决策: A串留空…

传送门 https://www.cnblogs.com/violet-acmer/p/9852294.html 参考资料: [1]:https://www.cnblogs.com/real-l/p/9712029.html [2]:https://www.luogu.org/problemnew/solution/P1140 题解: 方法一:枚举所有可能(记忆型DP) 相关变量解释: m,n...................................................分别…

题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了44种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度.因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用. 题目描述 两个基因的相似度的计算方法如下: 对于两个已知基因,例如AGTGATGAGTGATG和GTTAGGTTAG,将它们的碱基互相对应.当然,中间可以加入一些空碱基-,例如: 这样,两个基因之间的相似度就可以…

题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了4种核苷酸,简记作A,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度.因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用. 题目描述 两个基因的相似度的计算方法如下: 对于两个已知基因,例如AGTGATG和GTTAG,将它们的碱基互相对应.当然,中间可以加入一些空碱基-,例如: 这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述,碱基之间的…

题目:https://www.luogu.org/problemnew/show/P1140 题意: 给定两串基因串(只包含ATCG),在其中插入任意个‘-’使得他们匹配.(所以一共是5种字符) 这5种字符两两之间有一个匹配数值,要求使这两个字符串的匹配值之和最大. 思路: dp[i][j]表示匹配了s1中前i个字符和s2中前j个字符的最大匹配值. 完成s1[i]与s2[j]的匹配只有三种可能. 1.s1[i]之前已经匹配好,s2[j]配‘-’.即dp[i][j] = dp[i][j-1]+sc…

题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了444种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度.因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用. 题目描述 两个基因的相似度的计算方法如下: 对于两个已知基因,例如AGTGATGAGTGATGAGTGATG和GTTAGGTTAGGTTAG,将它们的碱基互相对应.当然,中间可以加入一些空碱基-,…

题目背景 大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列.它包含了444种核苷酸,简记作A,C,G,TA,C,G,TA,C,G,T.生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物. 在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度.因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用. 题目描述 两个基因的相似度的计算方法如下: 对于两个已知基因,例如AGTGATGAGTGATGAGTGATG和GTTAGGTTAGGTTAG,将它们的碱基互相对应.当然,中间可以加入一些空碱基-,…

题目传送门 题目大意:给你一个序列,求子序列为等差数列的子序列个数.序列长度$n<=2000$,最高的塔高$v<=20000$. 这种计数类的题,大概就是dp的套路了⑧.开始设计的是一个错误的状态:设$f[i][j]$为到前$i$个塔选了$j$个的方案数,但是我们再看一看就会发现这是错的,因为等差数列啊,我们并没有考虑公差鸭.所以我们再设计一个状态:设$f[i][j]$表示到第$i$个塔为止,公差为$j$的方案数.开始想的是$O(n^3)$算法 ,还要枚举公差,但是后来发现不需要特意枚举公差,…

题意 : 题目链接 分析 :  可以观察到给出的配对代价表中对角线部分是正数 其余的都是负数,也就是说让相同字母的匹配的越多越好 即找出 LCS 但是这里 DP 的过程需要记录一下代价 有关 LCS 的一篇博客 ==> Click here 如果不是计算长度而是计算配对的价值,那么初始化的时候 记得将每一个串的字母作为结尾与空串配对的价值初始化一下 即 dp[i][0] 与 dp[0][i] #include<bits/stdc++.h> using namespace std; con…