Gene Ontology(GO)是基因功能国际标准分类体系.GO富集分析是对差异基因等按GO分类,并对分类结果进行基于离散分布的显著性分析.错判率分析.富集度分析,得到与实验目的有显著联系的.低误判率的.靶向性的基因功能分类,该分类即导致样本性状差异的最重要的功能差别.在芯片的数据分析中,研究者可以找出哪些变化基因属于一个共同的GO功能分支,并用统计学方法检定结果是否具有统计学意义,从而得出变化基因主要参与了哪些生物功能. 1.      对mRNA进行显著性功能富集分析,得到具有显著性.…

RNA-seq是利器,大部分做实验的老板手下都有大量转录组数据,所以RNA-seq的分析需求应该是很大的(大部分的生信从业人员应该都差不多要沾边吧). 普通的转录组套路并不多,差异表达基因.富集分析.WGCNA network以及一些没卵用的花式分析.DEG分析是基础,up and down,做个富集,了解一下处理后到底是什么通路被改变了:WGCNA主要就是根据相关性来找出一些co-express的gene module. 单细胞的转录组的玩法就比较多了,可以理解为超多样本的普通转录组,普通转录…

[protocol]GO enrichment analysis     背景: 什么是富集分析,自己可以百度.我到目前也没发现一个比较通俗易懂的介绍.直接理解为一种统计学方法就可以了. 用于查看显著性. 富集分析有很多种,最常见的是GO富集分析.也有pathway富集分析.[pathway的我目前不会啊 ::>_<:: ] 工具: 也有很多种,我这里主要是用Ontologizer (links:http://compbio.charite.de/contao/index.php/cmdlin…

BABOK - 企业分析(Enterprise Analysis)概要 发表于2013年10月9日由周金根 描述 企业分析描述我们如何捕捉.提炼并明晰业务需要,并定义一个可能实现这些业务需要的一个方案范围,它包括问题定义和分析,业务案例开发,可行性研究和方案范围定义 目的 明确业务战略需要和目标,并建议方案范围 任务 标识业务需要(Identify Business Need) 确定方案步骤(Determine Solution Approach) 定义方案范围(Define Solution…

帕累托分析法(Pareto Analysis)(柏拉图分析) ABC分类法是由意大利经济学家帕雷托首创的.1879年,帕累托研究个人收入的分布状态图是地,发现少数人收入占全部人口收入的大部分,而多数人的收入却只占一小部分,他将这一关系用图表示出来,就是著名的帕累托图.该分析方法的核心思想是在决定一事物的众多因素中分清主次,识别出少数但对事物起决定作用的关键因素和多数的但对事物影响较小的次要因素.后来,帕累托法被不断应用于管理的各个方面.1951年,管理学家戴克(H.F.Dickie)将其应用于库…

CSDN的markdown编辑器是吃屎了么! !.什么玩意.!写了一半写不了东西还全没了,搞个毛线! 本节课的视频教程地址是:第七课在此 假设本教程有帮助到您,希望您能点击进去观看一下,并且如今注冊成为极客学院的会员,能够免费领取30天学习时间,免费拿极客学院VIP,1000+高清视频.学习Android.HTML5.iOS各种开发技术,限时领取.手快的戳:http://e.jikexueyuan.com/invite/index.html?ZnJvbV9jb2RlPVkxblJUZSZ1bmF…

Java安全(权限)框架 - Shiro 功能讲解 架构分析 作者 : Stanley 罗昊 [转载请注明出处和署名,谢谢!] 简述Shiro Shiro出自公司Apache(阿帕奇),是java的一个安全和权限框架: 在这之前,我想各位应该也学过 SpringMvc.struts2.他们都是web的mvc框架,紧接着一些ORM框架,比如Mybatis .Hibernate,而这个Shiro更加主流.也更加简单易用,它不但是适用于javaSE环境,也适用于javaEE环境: Shiro可以完成如…

一.为什么要做GWAS的条件分析(conditional analysis) 我们做GWAS的时候,经常扫出一堆显著的信号,假设rs121是我们扫出来与某表型最显著相关的位点(P=1.351e-36),rs124尾随其后(6.673e-22),也是与该表型显著相关,那么这个时候,我们就有问题了:这个rs124位点是真的与该表型显著相关,还是因为rs124与rs121高度连锁不平衡(linkage disequilibrium).换句话说,rs124之所以出类拔萃,是因为它本身厉害,还是有rs12…

其中 管理文章 的功能没有做,以下做的设计 浏览与参与 功能的步骤 分析功能   5个功能.   7个请求. 实现功能   Action, 7个方法   Service   Dao   Jsp ForumAction   list() 版块列表 1个   show() 显示单个版块(主题列表) 1个 TopicAction   show() 显示单个主题(主帖+回帖列表) 1个   addUI(), add() 发新帖 2个 ReplyAction   addUI(), add() 回帖 2个…

    BMDP是Bio Medical Data Processing的缩写,是世界级的统计工具软件,至今已经有40多年的历史.目前在国际上与SAS.SPSS被并称为三大统计软件包.BMDP是一个大型综合的数据统计集成系统,从简单的统计学描述到复杂的多变量分析都能应付自如.每一个BMDP程序的执行算法都经历了最为严酷的实际专业测试才被予以应用. BMDP为常规的统计分析提供了大量的完备的函数系统,如:方差分析(ANOVA).回归分析(Regression).非参数分析(Nonparametri…