Xi, a developmental biologist is working on developmental distances of chromosomes. A chromosome, in the Xi's simplistic view, is a permutation from n genes numbered 1 to n. Xi is working on an evolutionary distance metric between two chromosomes. In…

Dissecting evolution and disease using comparative vertebrate genomics-online 因为基因组不是独一无二的,同时人类基因组可以组为参考数据,所以最近这些年涌现了脊椎动物的基因数据,所以我们可以利用比较基因组学获得生物学各方面的内在机制,以此来预测和调节疾病. 两种方式获得人类基因组:方式一:多级策略:(IHGSC)工程量巨大(因为工程量巨大,所以急需的测序技术(新且造价低)),使用了BAC克隆同时高coverage(准确率…

本以为这题n=3000,随便n方一下就能过.于是我先枚举长度len再枚举起点,不断增加新的点并删除原来的点,判断在b中的r-l+1是不是等于len即可,这个过程显然要用set维护比较方便,但是貌似卡了这个log,T了= =. 然后修改了一下思路,先枚举左端点,再不断的向有扩张,并用两个变量l和r来标记在b中的最左和最右的位置,然后如上做法即可.这样的好处在于不需要删除点的信息,因此可以直接借用变量来维护边界了.具体差别见代码吧. T的代码如下: #include <stdio.h> #incl…

http://exploredegrees.stanford.edu/coursedescriptions/cs/ CS 101. Introduction to Computing Principles. 3-5 Units. Introduces the essential ideas of computing: data representation, algorithms, programming "code", computer hardware, networking, s…

差分进化算法 (Differential Evolution)   Differential Evolution(DE)是由Storn等人于1995年提出的,和其它演化算法一样,DE是一种模拟生物进化的随机模型,通过反复迭代,使得那些适应环境的个体被保存了下来.但相比于进化算法,DE保留了基于种群的全局搜索策略,采用实数编码.基于差分的简单变异操作和一对一的竞争生存策略,降低了遗传操作的复杂性.同时,DE特有的记忆能力使其可以动态跟踪当前的搜索情况,以调整其搜索策略,具有较强的全局收敛能力和鲁棒…

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UVA - 10564 Paths through the Hourglass 题意: 要求从第一层走到最下面一层,只能往左下或右下走 问有多少条路径之和刚好等于S? 如果有的话,输出字典序最小的路径. f[i][j][k]从下往上到第i层第j个和为k的方案数 上下转移不一样,分开处理 没必要判断走出沙漏 打印方案倒着找下去行了,尽量往左走   沙茶的忘注释掉文件WA好多次   #include <iostream> #include <cstdio> #include <a…

UVA - 11404 Palindromic Subsequence 题意:一个字符串,删去0个或多个字符,输出字典序最小且最长的回文字符串 不要求路径区间DP都可以做 然而要字典序最小 倒过来求LCS,转移同时维护f[i][j].s为当前状态字典序最小最优解 f[n][n].s的前半部分一定是回文串的前半部分(想想就行了) 当s的长度为奇时要多输出一个(因为这样长度+1,并且字典序保证最小(如axyzb  bzyxa,就是axb|||不全是回文串的原因是后半部分的字典序回文串可能不是最小,多…

POJ3869 Headshot 题意:给出左轮手枪的子弹序列,打了一枪没子弹,要使下一枪也没子弹概率最大应该rotate还是shoot 条件概率,|00|/(|00|+|01|)和|0|/n谁大的问题 |00|+|01|=|0| 注意序列是环形 // // main.cpp // poj3869 // // Created by Candy on 25/10/2016. // Copyright © 2016 Candy. All rights reserved. // #include <i…

UVA - 11538 Chess Queen 题意:n*m放置两个互相攻击的后的方案数 分开讨论行 列 两条对角线 一个求和式 可以化简后计算 // // main.cpp // uva11538 // // Created by Candy on 24/10/2016. // Copyright © 2016 Candy. All rights reserved. // #include <iostream> #include <cstdio> #include <cst…