题目转自hdu 1080,题目传送门 题目大意: 不想翻译! 解题思路: 其实就是一道变异的求lcs(Longest common subsequence 最长公共子序列)的题 不过,它的依据是下面这张图: 所以,需要一个数组来存规则: ][]={ {,-,-,-,-}, {-,,-,-,-}, {-,-,,-,-}, {-,-,-,,-}, {-,-,-,-,} }; 同时,需要把每个字母对应成一个数字 处理字母对应代码如下: int get_init(char s) { ; ; ; ; ;…

http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=1080 二维最长公共子序列 #include <iostream> #include <cstdio> #include <cstring> using namespace std ; ],s2[]; ][]={{,-,-,-,-}, {-,,-,-,-}, {-,-,,-,-}, {-,-,-,,-}, {-,-,-,-}}; //dp[i][j]表示长i和j的字符串的最长公共子序列…

最长公共子序列的变形 题目大意:给出两个基因序列,求这两个序列的最大相似度. 题目中的表格给出了两两脱氧核苷酸的相似度. 状态转移方程为: dp[i][j] = max(dp[i-1][j]+Similarity(s1[i], '-'),                     dp[i][j-1]+Similarity(s2[j], '-'),                     dp[i-1][j-1]+Similarity(s1[i], s2[j])); 注意边界的初始化. //#de…

匹配两个人相似度. A,G,C.T.每两个都会有一个相应的值,给出两串基因.长度能够不一样,能够在基因中间加_使两串长度一样.然后有一个相应值.求最大相应值. 先做出相应的表 DP方程: x=dp[i-1][j-1]+hash[str_a[i-1]][str_b[j-1]]; y=dp[i-1][j]+hash[str_a[i-1]]['-']; z=dp[i][j-1]+hash[str_b[j-1]]['-']; p[i][j]=Max(x,y,z); #include "stdio.h&q…

意甲冠军:该基因序列的两端相匹配,四种不同的核苷酸TCGA有不同的分值匹配.例如T-G比分是-2,它也可以被加入到空格,空洞格并且还具有一个相应的核苷酸匹配分值,求最大比分 分析: 在空气中的困难格的数量和位置不确定 二维dp,dp[i][j]表示序列a的前i段和序列b的前j段匹配时的最大分数. 接下来细致分析当i和j匹配的情况:1.a[i]与b[j]匹配:2.a[i]与b[j-1].3.a[i]与b[j+1]. 所以方程:dp [i][j]=  max(dp[i-1][j]+mat[i]['#…

Human Gene Functions Time Limit: 2000/1000 MS (Java/Others)    Memory Limit: 65536/32768 K (Java/Others)Total Submission(s): 3008    Accepted Submission(s): 1701 Problem Description It is well known that a human gene can be considered as a sequence,…

题意: 输入俩个字符串,怎样变换使其所有字符对和最大.(字符只有'A','C','G','T','-') 其中每对字符对应的值如下: 怎样配使和最大呢. 比如: A G T G A T G -  G T T A -  G 和为 (-3)+5+5+(-2)+5+(-1) +5=14. 题解: 最长公共子序列的变形. 设dp[i][j]为a的前i个和b的前j个字符能构成的最大和. score[][]为每对字符的值,比如score['A']['G']为'A','G'这对字符对应的值. string a…

传送门 题目大意: 将两个字符串对齐(只包含ACGT,可以用'-'占位),按照对齐分数表(参见题目)来计算最后的分数之和,输出最大的和. 例如:AGTGATG 和 GTTAG ,对齐后就是(为了表达对齐,这里我用m表示'-') AGTGATG mGTTAmG 题目分析: 首先看出这道题与LCS有关,下面来考虑转移: 当t1[i]==t2[j]时,和LCS一样,\(dp[i][j] = dp[i-1][j-1]+score[t1[i]][t2[j]]\) 当t1[i]!=t2[j]时,唯一不同的是…

题意: 人类基因由A.C.G.T组成. 有一张5*5的基因表.每格有一个值,叫相似度.例:A-C:-3.意思是如果A和C配对, 则它俩的相似度是-3[P.S.:-和-没有相似度,即-和-不能配对] 现在给两条基因片段.(长度不一定相等) 现在你要在两条基因片段中插入若干个-(空白基因),使得两个基因片段长度相等,且得到的整体相似度的值最大.[再次P.S.:-和-不能配对] 思路: 因为-和-不能匹配,所以插入的-的个数是有限的. str1的第一个基因可以与str1的第一个或-配对.然后,,,,很…

HDU 模拟题, 枚举1002 1004 1013 1015 1017 1020 1022 1029 1031 1033 1034 1035 1036 1037 1039 1042 1047 1048 1049 1050 1057 1062 1063 1064 1070 1073 1075 1082 1083 1084 1088 1106 1107 1113 1117 1119 1128 1129 1144 1148 1157 1161 1170 1172 1177 1197 1200 1201…