参考  设置环境变量R_LIBS将R包安装到自定义路径   实际上是可以解决问题的, #环境变量完成以后,启动(重启)R,运行 .libPaths() 加载R包时,发现路径仍然未变成自定义的. 那么参考  quantreg软件包加载失败.是要改路径么?新手求帮忙 开启R的时候用管理者身份打开[鼠标右键RStudio→以管理者身份运行],再运行,就会发现路径自定义成功. .libPaths()…

开学的时候,男神给了数据(.xlsx格式)让用R语言分析分析,作为编程小白,读了一天都没读近R,更别提如何分析了. 现在小伙伴们都喜欢读txt 和csv格式的,好多xlsx的表格读不进R,将xlsx格式另存为csv格式就可以读进去啦.但偶尔会有格式不兼容的情况,会干掉有些数据,导致我们最后跑出的结果和男神给的案例结果不一样.其中一种解决方法是(我认为好用的): (1)安装xlsx包时会提醒需要rJava包,而rJava包需要配置电脑的环境变量,没有环境变量会导致包装不上,装不上! 首先电脑要安装…

在linux下,对于手动安装的软件,当时间长了,我们就会忘记安装这个软件的细节.这就不利于以后软件的卸载工作了.而yum则会帮我们记住相关安装细节,当软件被卸载的时候,没用的文件也会一并被删除.因此,在centos 7下我们建议优先使用yum的方式安装软件. 在centos 7下安装R软件可以使用两种方式:源码编译安装和Yum在线安装.而R的官网上已经说明了,R已经被EPEL仓库管理着,EPEL是一个汇集了各种附加软件包的项目,所以我们使用yum来安装. 具体步骤如下: 1 通过如下命令安装并启…

错误信息 Package'libxml-2.0',requiredby'ggobi',notfound     错误原因 ggobi缺乏libxml依赖 解决方案 sudo apt install libxml2 sudo apt install libxml2-dev (注意,有一个坑是,运行了第一条指令后,仍将缺乏libxml2依赖,因为许多 Linux 发行版会进行拆包,把开发用的部分单独拆出去.在我们实际运行中,会缺乏libxml2 所需要的头文件.静态库和一些相关工具. 应该执行第二条…

错误信息: configure: error: GNU MP not found, or not 4.1.4 or up, see http://gmplib.org ERROR: configuration failed for package ‘gmp’ * removing ‘/home/chenyansu/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/gmp’ Warning in install.packages : installation of package…

post={"title":"my Blog post","content":"Here's my blog post","date":new Date()} sudo yum install -y gccsudo yum install -y glibc-headerssudo yum install -y libreadline6-dev gfortran sudo yum install -y rea…

在linux中用同一个版本的R 同时安装 Seurat 2 和 Seurat 3 Seurat  作为单细胞分析中的重量级R包,有多好用用,用过的人都知道.Seurat 分析流程基本涵盖了单细胞分析中的所有常见分析方法,包括filtering,tSNE,UMAP降维及画图等.还有一个重量级功能就是矫正不同实验之间的批次效应.然而Seurat 2和Seurat 3的矫正方法完全不一样,得到的结果也不一致.Seurat 2是基于CCA (典型相关性)的,可以矫正肿瘤,外周血及癌旁组织间由于实验带来的…

更新时间:2019.09.23 1. 序言 之前曾经用过一段时间的R(一直忍受着原生R那个超级"简洁"的界面),但是后来重装了系统并且学习了Python,就没有再怎么碰过R了.然而这两学期又开个R语言的课(统计狗一枚),只能再重新装一下. 这次有点不同的是,是想直接将R的内核嵌入到jupyter notebook中,用jupyter notebook来写R.为了方便起见,记录一些安装的过程,以便不时之需. 2. R的下载 其实,R的下载十分的简单,一种方法是直接进入R的官网-->…

R环境的两种安装方式,源码编译安装和yum在线安装 第一种:源码编译安装 1.首先,从官网上下载3.5.0版本 2.下载完后记得解压,我的习惯是解压在/usr/local下面 tar -zxvf R-3.5.0.tar.gz 3.然后,安装各种依赖环境 yum install -y gcc yum install -y glibc-headers yum install -y libreadline6-dev gfortran yum install -y readline-devel yum…

    今天看论文,需要用到R语言的库,于是又折腾了半天..     其实并没有什么太大的问题,只是在第三方包的下载方面还有python中使用R方面遇到了问题: 第三方包的导入      其实在网上有很多的方法了,R中包的安装     先说结论:最推荐直接使用install.packages("包名"),如果里面没有的话,再考虑在这个网站下载网站地址     这里一开始我担心又因为网速慢的问题,半天在线下不下来,所以直接从网站搜的包,然后下载下来,自己安,结果他并不添加其他依赖,下了一…